New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4712124 = | 45 (0.810) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.7% | coding (356/2115 nt) | PP_4171 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4712160 = | 41 (0.780) | coding (392/2115 nt) | PP_4171 | hypothetical protein |
CGGCTACGGTGCCGGTAATCAACCCACGGTCAACTACCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTGAAAGTGACACGCGGCCAGGACGGT > NC_002947/4712014‑4712308 | gctgtcggcgggtttgcgggtgaggatgttgaccaccgccatcagcgcgttggcgccatagctgacggtattcgggccacgaaacacctcgatgcgctcgatatcctccaTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATgg > 1:72473‑M1/111‑149 (MQ=255) cGGTGCCGGTAATCAACCCACGGTCAACTACCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGata < 6:111529/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGGTAATCAACCCACGGTCAACTACCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGatat < 3:320865/149‑1 (MQ=255) gTAATCAACCCACGGTCAACTACCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGa < 4:218490/145‑1 (MQ=255) gTAATCAACCCACGGTCAACTACCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGa > 3:218490/1‑145 (MQ=255) aTCAACCCACGGTCAACTACCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATc > 5:69792/1‑149 (MQ=255) aCGGTCAACTACCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGtt > 8:4783/1‑149 (MQ=255) ggTCAACTACCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTc > 6:244605/1‑149 (MQ=255) aCCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGccc > 2:72917/1‑148 (MQ=255) ccACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATGGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCg > 1:251913/1‑148 (MQ=255) cACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGaa < 5:244605/149‑1 (MQ=255) aCGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAgcgc > 4:233541/1‑125 (MQ=255) aCGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAgcgc < 3:233541/125‑1 (MQ=255) cGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATa < 6:69792/149‑1 (MQ=255) cagcaACGTCAACGACGCACGGCCCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCAACGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCg > 6:291170/1‑149 (MQ=255) gcaACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTc < 2:251913/149‑1 (MQ=255) aaCGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCa > 3:108572/1‑118 (MQ=255) aaCGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCa < 4:108572/118‑1 (MQ=255) gaaCGGCGCATGAAGGTATTGATCGATCGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCACCTTGGCCATGTAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAAAACCGACAGCAATGGCGCCaa > 6:195425/3‑149 (MQ=255) aCGGCGCATGGAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGTTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGTCTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAAcg < 5:195425/149‑1 (MQ=255) aTGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGAt < 7:4783/149‑1 (MQ=255) gCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATgg > 7:21536/1‑149 (MQ=255) aGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCg > 4:333446/1‑149 (MQ=255) cGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGCGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAAc > 2:107403/1‑148 (MQ=255) cGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACa > 1:150271/1‑149 (MQ=255) aTGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAAc < 8:81041/146‑1 (MQ=255) aTGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAAc > 7:81041/1‑146 (MQ=255) ggCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCaa > 8:247845/1‑122 (MQ=255) ggCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCaa < 7:247845/122‑1 (MQ=255) gCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGTAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCAACGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCt < 5:291170/148‑1 (MQ=255) gCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTc < 2:56649/149‑1 (MQ=255) gCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTc < 1:72917/149‑1 (MQ=255) taCCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACa < 2:197591/133‑1 (MQ=255) taCCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACa > 1:197591/1‑133 (MQ=255) cgcgCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACccgc < 2:150271/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAg < 3:189894/55‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAg > 4:189894/1‑55 (MQ=255) ccatggccaaggggatgtcgctccagtccaccgtggccaTGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGc > 1:72473‑M2/40‑149 (MQ=255) ggccaaggggatgtcgctccagtccaccgtggccaTGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGa < 2:132566‑M2/69‑1 (MQ=255) ggccaaggggatgtcgctccagtccaccgtggccaTGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGa > 1:132566‑M2/36‑104 (MQ=255) aCTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTg < 8:21536/149‑1 (MQ=255) tGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTGa > 3:154084/1‑148 (MQ=255) aGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTGAAAGt > 8:292021/1‑149 (MQ=255) aCATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTGAAAGTGaca > 5:99136/1‑149 (MQ=255) tCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTGAAAGTGACAcgc > 3:232688/1‑149 (MQ=255) caTGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCCCCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTGAAAGTGACACGCGGCCAGGACg > 6:216774‑M2/3‑149 (MQ=255) caTGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTGAAAGTGACACGCGGCCAGGACg < 4:154084‑M2/147‑1 (MQ=255) tGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTGAAAGTGACACGCGGCCAGGACGGt < 7:292021/149‑1 (MQ=255) | CGGCTACGGTGCCGGTAATCAACCCACGGTCAACTACCACGGCAGCAACGTCAACGACGCACGGCGCATGCAGGTATTGATCGATGGCCGCTCGGTATACCGCGCAGGCCTGGCCACGGTGGACTGGAGCGACATCCCCTTGGCCATGGAGGATATCGAGCGCATCGAGGTGTTTCGTGGCCCGAATACCGTCAGCTATGGCGCCAACGCGCTGATGGCGGTGGTCAACATCCTCACCCGCAAACCCGCCGACAGCCATGGTACGCGGCTGAAAGTGACACGCGGCCAGGACGGT > NC_002947/4712014‑4712308 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |