New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4881961 = | 52 (0.940) | 4 (0.080) | 3/242 | NT | 7.6% | coding (1044/1356 nt) | uacT | uric acid permease |
? | NC_002947 | 4882028 = | 48 (0.920) | coding (1111/1356 nt) | uacT | uric acid permease |
CCGCTATGTCACCATCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGTGGATGGAGCCCATCACCCACAGCGG > NC_002947/4881883‑4882170 | ccGCTATGTCACCATCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCaa < 4:168806/147‑1 (MQ=255) ccGCTATGTCACCATCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGa < 7:268032/149‑1 (MQ=255) cTATGTCACCATCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGAttc > 7:286633/1‑149 (MQ=255) gTCACCATCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCCCAGCCACCGGGATCAAGAtcgtga > 8:300733/1‑143 (MQ=255) cACCATCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCag > 2:311156/1‑148 (MQ=255) cATCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCa > 8:81797/1‑144 (MQ=255) cATCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCa < 7:81797/144‑1 (MQ=255) aTCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGc < 6:62218/149‑1 (MQ=255) tCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCg < 7:309172/149‑1 (MQ=255) cGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCg < 5:354382/149‑1 (MQ=255) tgctgATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGc < 5:329186/133‑1 (MQ=255) tgctgATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGc > 6:329186/1‑133 (MQ=255) gATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACcgccgc > 6:322407/1‑148 (MQ=255) tCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACcgccgctgc > 3:168725/1‑146 (MQ=255) tCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTg > 6:221980/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTgttg < 5:281480/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTgttgg > 2:210631/1‑149 (MQ=255) tgctgcCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTgttggtt > 7:179893/1‑149 (MQ=255) gctgcCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTgttggttg > 4:309498/1‑149 (MQ=255) ctgcCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGc < 2:28356/149‑1 (MQ=255) gcCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCg > 4:249762/1‑122 (MQ=255) gcCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCg < 3:249762/122‑1 (MQ=255) cccAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCCCCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGGGGGTTGCCgg > 8:234891/1‑148 (MQ=255) cccAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGt > 5:306747/1‑149 (MQ=255) cccAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGt > 4:297228/1‑149 (MQ=255) cccAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAACAGCTGGTTGcgg < 4:113877/148‑3 (MQ=255) cAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGa < 5:221980/149‑1 (MQ=255) ttCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCtt > 7:318280/1‑149 (MQ=255) cTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCgg < 1:311156/149‑1 (MQ=255) cTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCg < 3:114951/148‑1 (MQ=255) aTTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCggg < 8:179893/147‑1 (MQ=255) tCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATccc > 3:257575/1‑149 (MQ=255) cGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATAGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATcccc > 1:264953/1‑149 (MQ=255) ATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCgt > 8:286633‑M1/1‑149 (MQ=255) cccggtggcggtgaccatgccgaacatggcgatggacgcgccgcccagtactgcgggcgggatcAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATcccc < 8:70973‑M2/81‑1 (MQ=255) cccggtggcggtgaccatgccgaacatggcgatggacgcgccgcccagtactgcgggcgggatcAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATcccc > 7:70973‑M2/65‑145 (MQ=255) cccggtggcggtgaccatgccgaacatggcgatggacgcgccgcccagtactgcgggcgggatcAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCgagg > 1:124092‑M2/65‑149 (MQ=255) CCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCgtggt < 5:340364‑M1/149‑1 (MQ=255) CCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCgtggt > 3:297228‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCgtggtg < 1:108964‑M1/149‑1 (MQ=255) cgcAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCgtggt < 8:305332/144‑1 (MQ=255) cgcAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCgtggt > 7:305332/1‑144 (MQ=255) cAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCg < 6:306747/149‑1 (MQ=255) ccatgccgaacatggcgatggacgcgccgcccagtactgcgggcgggatcAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGa > 1:174421‑M2/51‑145 (MQ=255) ggcggcGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCt < 2:264953/148‑1 (MQ=255) gcggcgCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCttt < 3:309498/149‑1 (MQ=255) cggcgCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTg < 2:108964/149‑1 (MQ=255) cggcgCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTg < 7:234891/149‑1 (MQ=255) ggcgCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGc > 5:147768/1‑149 (MQ=255) aTCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCataagc > 5:215069/1‑143 (MQ=255) cATGTTCGGCATGGTCACCGGCAGCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATGGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTGGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGt < 1:300258/149‑1 (MQ=255) tGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGtg > 5:94594/1‑148 (MQ=255) ttCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGtggat < 1:210631/149‑1 (MQ=255) cGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGCTGCCACAGtggatg > 7:308890/1‑148 (MQ=255) gCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGTGGATGGAg < 4:257575/149‑1 (MQ=255) tGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGTGGATGGAGcc > 4:116427/1‑148 (MQ=255) cACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGTGGATGGAGCCCATCa > 1:270718/1‑149 (MQ=255) cGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGtggatgga > 2:169706/1‑138 (MQ=255) cGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGtggatgga < 1:169706/138‑1 (MQ=255) ccGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGTGGATGGAGCCCATCACCCACAGc > 3:347575/1‑149 (MQ=255) ggatcAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGTGGATGGAGCCCATCACCCACAGCgg > 7:213556‑M2/6‑148 (MQ=255) | CCGCTATGTCACCATCGTGGCCGGTGCACTGCTGATCCTGCTCAGCCTGCTGCCCAAGGCGGCCTTCCTGATTGCCTCGATCCCGCCCGCAGTACTGGGCGGCGCGTCCATCGCCATGTTCGGCATGGTCACCGCCACCGGGATCAAGATTCTTCAGGAGGCGGACATCGGCGACCGCCGCAACCAGCTGTTGGTTGCCGTGAGCGTCGGCTTCGGGTTGATCCCCGTGGTGCGTCCGGAGTTCTTTGCCCAGATGCCACAGTGGATGGAGCCCATCACCCACAGCGG > NC_002947/4881883‑4882170 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |