New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4951669 = | 53 (0.960) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.4% | coding (604/1266 nt) | fliK | flagellar hook‑length control protein FliK |
? | NC_002947 | 4951723 = | 54 (1.010) | coding (550/1266 nt) | fliK | flagellar hook‑length control protein FliK |
TCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTGCGCCGTGGCC > NC_002947/4951576‑4951868 | aggaggccttcgatccggatgctgaccccctggccaacctgccgaccctgcgcctggcgctggagcacagtgcccaggccaaggggggcacctCGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAg > 3:123072‑M1/94‑149 (MQ=255) aGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGt > 1:329934/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGt < 6:335387/149‑1 (MQ=255) gCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGc < 8:22747/149‑1 (MQ=255) ttCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCt > 3:180005/1‑149 (MQ=255) caagGCACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCt < 6:3514/149‑1 (MQ=255) gtcACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTggg < 7:312322/147‑1 (MQ=255) ggCACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTggg < 1:85206/149‑1 (MQ=255) cACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCa > 1:353707/1‑149 (MQ=255) cTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCACCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGcc < 4:143654/123‑1 (MQ=255) cTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCACCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGcc > 3:143654/1‑123 (MQ=255) ccACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAgcgc > 8:38963/1‑149 (MQ=255) cACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGc > 6:79527/1‑140 (MQ=255) cACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGc < 5:79527/140‑1 (MQ=255) aCCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAgcgc > 1:54961/1‑147 (MQ=255) aGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAggg > 3:86313/1‑149 (MQ=255) cTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCgg < 2:353707/149‑1 (MQ=255) ccATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGtt > 6:303806/1‑149 (MQ=255) tATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAgg > 8:201586/1‑149 (MQ=255) cTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGt > 6:323879/1‑149 (MQ=255) gACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCa < 2:54961/148‑1 (MQ=255) gACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCa < 5:174292/148‑1 (MQ=255) ccAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAg < 4:287020/121‑1 (MQ=255) ccAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAg > 3:287020/1‑121 (MQ=255) ccAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGc > 2:161117/1‑148 (MQ=255) aTTCGCCTAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCg > 8:101614/1‑149 (MQ=255) aTTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCg > 5:53577/1‑149 (MQ=255) ttCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCgg < 2:329934/149‑1 (MQ=255) gCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGAt < 7:15300/148‑1 (MQ=255) cAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATc > 7:152640/1‑141 (MQ=255) cAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATc < 8:152640/141‑1 (MQ=255) cAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCg > 6:340767/1‑148 (MQ=255) ggTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAgg < 4:86313/149‑1 (MQ=255) gTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGc > 5:332131/1‑149 (MQ=255) tATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCa > 3:152317/1‑131 (MQ=255) tATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCa < 4:152317/131‑1 (MQ=255) tATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGcc > 6:222626/1‑149 (MQ=255) gACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGcctcct > 8:182854/1‑149 (MQ=255) ctcggcacatgcccttgatgctgcccaggctcagggcgaggaagggcaggcggccgAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGcctcct > 3:123072‑M2/57‑149 (MQ=255) cacatgcccttgatgctgcccaggctcagggcgaggaagggcaggcggccgAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTcggcg < 4:123072‑M2/98‑1 (MQ=255) CCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTcggcg > 7:201586‑M1/1‑149 (MQ=255) ccttgatgctgcccaggctcagggcgaggaagggcaggcggccgAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGct > 3:280241‑M2/45‑149 (MQ=255) cccTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACgg < 1:161117/147‑1 (MQ=255) cTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAg < 5:222626/149‑1 (MQ=255) tCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAgg > 5:32492/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAgg > 7:81259/1‑149 (MQ=255) gCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAgg < 6:53577/147‑1 (MQ=255) ccTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGGAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGt > 7:84404/1‑149 (MQ=255) cTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGtg < 8:84404/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGtgctg > 5:1458/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTc < 8:281658/97‑1 (MQ=255) ccTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTc > 7:281658/1‑97 (MQ=255) gcagcaTCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAAc < 5:303806/149‑1 (MQ=255) caTCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTgg > 6:257703/1‑149 (MQ=255) tCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGt < 4:180005/149‑1 (MQ=255) aaGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGttt < 5:257703/149‑1 (MQ=255) aGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTg > 3:139058/1‑149 (MQ=255) gggCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTgc < 5:323879/149‑1 (MQ=255) gggCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTgc < 4:139058/149‑1 (MQ=255) gggCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTgc < 8:81259/149‑1 (MQ=255) ggCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGAGCCAGGCGCACGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGTGTTTgcg > 2:148106/1‑149 (MQ=255) gcggccgAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTGCGCCGt < 4:280241‑M2/142‑1 (MQ=255) tgCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTGCGCCGTgg < 6:1458/149‑1 (MQ=255) tgCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTGCGCCGTg < 7:101614/148‑1 (MQ=255) gccgAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTgc < 7:234114‑M2/137‑1 (MQ=255) gccgAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTgc > 8:234114‑M2/5‑141 (MQ=255) ccgAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTGCGCCGTGgcc > 6:24088‑M2/4‑149 (MQ=255) ccgAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTGCGCCGTGgc < 7:38963‑M2/145‑1 (MQ=255) | TCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCCACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCCTGAGCCTGGGCAGCATCAAGGGCATGTGCCGAGGTGCCCCCCTTGGCCTGGGCACTGTGCTCCAGCGCCAGGCGCAGGGTCGGCAGGTTGGCCAGGGGGTCAGCATCCGGATCGAAGGCCTCCTCGGCGGACGGCTCTTCAGGCAGTGCTGCGGAAACCTGGGTTTGCGCCGTGGCC > NC_002947/4951576‑4951868 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |