New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5496396 | 42 (0.760) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 6.9% | coding (289/1332 nt) | cobG | precorrin‑3B synthase |
? | NC_002947 | = 5496434 | 42 (0.810) | coding (251/1332 nt) | cobG | precorrin‑3B synthase |
CGAGGATCTGCCCGGCCAGCGGCCTGGCGTCCAGCAGCATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGC > NC_002947/5496291‑5496578 | cGAGGATCTGCCCGGCCAGCGGCCTGGCGTCCAGCAGCATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGcg > 3:145219‑M2/1‑144 (MQ=255) cGAGGATCTGCCCGGCCAGCGGCCTGGCGTCCAGCAGCATGAGCCGGTCATGCCCGGCCAGTGGCCTGAGGATCACCTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCAACGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCAACGACCAAAGcgca < 4:145219‑M2/148‑5 (MQ=255) ggATCTGCCCGGCCAGCGGCCTGGCGTCCAGCAGCATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGTCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGcgcgatgc < 2:300151‑M2/149‑9 (MQ=255) ggATCTGCCCGGCCAGCGGCCTGGCGTCCAGCAGCATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGcgcgatgc < 3:35162‑M2/149‑9 (MQ=255) aTCTGCCCGGCCAGCGGCCTGGCGTCCAGCAGCATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTc > 1:72700/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCCTGGCGTCCAGCAGCATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGTCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGc < 1:300151/149‑1 (MQ=255) gCGGCCTGGCGTCCAGCAGCATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCa < 5:53996/149‑1 (MQ=255) tCCAGCAGCATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAg < 6:209929/149‑1 (MQ=255) gccgggcaTGACCCGCTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGt > 7:30213/6‑149 (MQ=255) agcagcATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGtt > 3:97835/1‑149 (MQ=255) gcaTGACCCGCTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCa > 4:144805/1‑149 (MQ=255) ggTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTtggtg > 6:165863/1‑149 (MQ=255) ggTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTtggtg < 2:72700/149‑1 (MQ=255) tCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGc > 6:60492/1‑149 (MQ=255) aTGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGc > 2:40553/1‑110 (MQ=255) aTGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGc < 1:40553/110‑1 (MQ=255) ccGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGAt < 2:220649/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCAc < 3:144805/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCAc < 5:165863/149‑1 (MQ=255) ggCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCAcgccgc > 6:277255/1‑147 (MQ=255) gCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAg > 6:43029/1‑149 (MQ=255) cTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAg > 2:113443/1‑148 (MQ=255) aTCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACg > 6:95701/1‑149 (MQ=255) tCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGc > 5:311371/1‑149 (MQ=255) aCGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTc < 5:277255/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTc < 6:238633/123‑1 (MQ=255) gTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCAGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTc > 5:238633/1‑123 (MQ=255) gcgcACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTccgcc < 8:30213/148‑1 (MQ=255) gcACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTccgccgcc < 4:97835/149‑1 (MQ=255) aTCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTccgccgccgccg > 4:1306/1‑149 (MQ=255) cGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCcgccgccgccgc > 6:28749/1‑148 (MQ=255) tCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCAc > 1:189055/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCt > 2:155853/1‑149 (MQ=255) cgGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGcgcgatgccgcgggtgacgatgtgcgcaacgtgatgctcagcccactggccgggcatgacccgctcatgctgctggacgcca > 1:295125‑M2/1‑48 (MQ=255) cgGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGcgcgatgccgcgggtgacgatgtgcgcaacgtgatgctcagcccactggccgggcatgacccgctcatgctgctggacgcca < 2:295125‑M2/130‑83 (MQ=255) cATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGcgcgatgccgcgggtgacgatgtgcgcaacgtgatgctcagcccactggccgggcatgacccgctcatgctgctggacgccaggccgctggccgggcagatcct < 5:6466‑M2/149‑105 (MQ=255) gcgTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGc < 1:155853/148‑1 (MQ=255) gTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCTCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCg < 5:28749/149‑1 (MQ=255) gTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCg > 3:122353/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCcag > 5:75373/1‑148 (MQ=255) aGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCcagcag > 7:292819/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCcagcag < 4:35162/149‑1 (MQ=255) ggCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGc < 6:140568/149‑1 (MQ=255) ggCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGc < 2:189055/149‑1 (MQ=255) aGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCgg < 4:122353/149‑1 (MQ=255) tCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGAt > 1:170462/1‑149 (MQ=255) gACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGAt < 2:170462/147‑1 (MQ=255) gACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGAt < 6:75373/147‑1 (MQ=255) gACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGc > 3:22241/1‑149 (MQ=255) gACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGc < 6:311371/149‑1 (MQ=255) aaaGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCgg > 4:329034/1‑147 (MQ=255) aaGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGc < 3:232920/147‑1 (MQ=255) aaGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGc > 4:232920/1‑147 (MQ=255) | CGAGGATCTGCCCGGCCAGCGGCCTGGCGTCCAGCAGCATGAGCGGGTCATGCCCGGCCAGTGGGCTGAGCATCACGTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGC > NC_002947/5496291‑5496578 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |