New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5946013 | 50 (0.900) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 7.7% | coding (996/1467 nt) | ubiD | 3‑octaprenyl‑4‑hydroxybenzoate carboxy‑lyase |
? | NC_002947 | = 5946060 | 47 (0.880) | coding (949/1467 nt) | ubiD | 3‑octaprenyl‑4‑hydroxybenzoate carboxy‑lyase |
CACCGCCATGCGGTACGAGCAGCCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCGGGGCCATTTCGCCTGGGTGGATCACCCCTTCCA > NC_002947/5945917‑5946200 | caccGCCATGCGGTACGAGCAGCCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCtgt < 4:2572/149‑1 (MQ=255) caccGCCATGCGGTACGAGCAGCCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCtgt > 2:329982/1‑149 (MQ=255) ccGCCATGCGGTACGAGCAGCCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTgg < 3:24186/149‑1 (MQ=255) cGGTACGAGCAGCCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCg < 1:329982/148‑1 (MQ=255) ggTACGAGCAGCCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGt < 1:341726/149‑1 (MQ=255) gTACGAGCAGCCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGtt > 7:172280/1‑149 (MQ=255) tACGAGCAGCCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGttt < 4:101927/149‑1 (MQ=255) agcagcCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGc < 3:205338/149‑1 (MQ=255) agcagcCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGc < 8:172280/149‑1 (MQ=255) gcagcCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTgg > 5:13543/1‑133 (MQ=255) gcagcCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTgg < 6:13543/133‑1 (MQ=255) tCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCCCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCggtgggt > 2:147164/1‑149 (MQ=255) cggcggCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGa > 8:259137/1‑149 (MQ=255) gcAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCTGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTa < 7:194786/121‑1 (MQ=255) gcAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCTGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTa > 8:194786/1‑121 (MQ=255) aGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGAGCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCCCGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGt < 6:30255/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTg < 6:95733/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTg > 5:95733/1‑148 (MQ=255) gTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGa > 7:175944/1‑149 (MQ=255) tCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCAGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGaa > 6:20520/1‑149 (MQ=255) gtcaTTTCCGGGACCTGCTTCTGCAGTATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGttttt < 2:17216/115‑1 (MQ=255) gATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTg < 7:81658/142‑1 (MQ=255) gATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTg > 8:81658/1‑142 (MQ=255) aTTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCgg > 2:314639/1‑149 (MQ=255) ttCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCggg < 1:147164/148‑1 (MQ=255) ttCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCggg > 2:83014/1‑148 (MQ=255) cGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAAc > 1:241712/1‑149 (MQ=255) aCTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTcc < 2:35719/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCg < 5:281261/148‑1 (MQ=255) cAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTgctg < 3:138335‑M2/79‑5 (MQ=255) cAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTgctg > 4:138335‑M2/1‑75 (MQ=255) cAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGtt < 3:276920/147‑1 (MQ=255) cAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTg < 8:175944/148‑1 (MQ=255) gATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTc < 1:217799/135‑1 (MQ=255) gATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTc > 2:217799/1‑135 (MQ=255) tCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGtagtag > 2:48835/1‑149 (MQ=255) gCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGtt < 1:344815/139‑1 (MQ=255) gCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGtt > 2:344815/1‑139 (MQ=255) gCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGccc > 3:295843/1‑149 (MQ=255) aCGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACTGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCgt > 4:165549/1‑149 (MQ=255) acacTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCAGCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGa > 3:325570/1‑149 (MQ=255) acTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGACCGGCCGGTGTAGGTgctgaacgaagtgttcgtgccgatcctgcagaagcagttcccggaaatcaccgacttctacctgccgccggaaggctgctcgtaccgcat < 5:133147‑M2/149‑91 (MQ=255) ttCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGCTCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGc > 2:346914/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCTGCTCGCCGAGTATGGCTGGTTGATCTGGCGGACGGCCGGTGTAGGTTCTGTGGTAGATCTGTTTTTGGCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGt < 3:49167/149‑1 (MQ=255) ttCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTgctgaacgaagtgttcgtgccgatcctgcagaagcagttcccggaaatcaccgacttctacct > 5:324361‑M2/1‑53 (MQ=255) ttCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTgctgaacgaagtgttcgtgccgatcctgcagaagcagttcccggaaatcaccgacttctacct < 6:324361‑M2/116‑64 (MQ=255) cgcCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGACCGGCCGGTGTAGGTgctgaacgaagtgttcgtgccgatcctgcagaagcagttcccggaaatcaccgacttctacctgccgccggaaggctgctcgtaccgcatggcggtggtga > 6:133147‑M2/1‑48 (MQ=255) ccACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCt > 7:29145/1‑149 (MQ=255) aCGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTc < 1:314639/149‑1 (MQ=255) ccGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCgg < 2:241712/149‑1 (MQ=255) cGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCggg < 4:295843/149‑1 (MQ=255) cGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCggg > 1:191856/1‑149 (MQ=255) agagaATGGCGGGCTCATCTGGGGGGCGGCCGGTGTATGTGCTGTTTTAGATCGGTTTTTGCCGTTGGGTGTTGCGCGCAACGTTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCgg < 5:284548/147‑1 (MQ=255) gaATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCGGGGcc < 8:29145/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACTGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCGGGGCCAtt < 3:165549/149‑1 (MQ=255) cGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCGGGGCCATTTCGc < 1:48835/149‑1 (MQ=255) ggccggccGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCGGGGCCATTTCGCCTGGGTGGATCAc < 1:346914/149‑1 (MQ=255) gccggccgGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACAGCGGGAAACTGTCCAGTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTGCGGGGCCATTTCGCCTGGGTGGATCAcc < 5:20520/149‑1 (MQ=255) cggTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCGGGGCCATTTCGCCTGGGTGGATCACCCCTTc > 3:136591/1‑148 (MQ=255) ggTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCGGGGCCATTTCGCCTGGGTGGATCACCCCTTCCa < 4:136591/149‑1 (MQ=255) | CACCGCCATGCGGTACGAGCAGCCTTCCGGCGGCAGGTAGAAGTCGGTGATTTCCGGGAACTGCTTCTGCAGGATCGGCACGAACACTTCGTTCAGCGCCACGCCGAGAATGGCCGGCTCATCTGGCGGCCGGCCGGTGTAGGTGCTGTGGTAGATCGGTTTTTGCCGGTGGGTGATGCGCTCAACGGTGAACACCGGGAAACTGTCCACTTCGTTGTAGTAGCCCGTGTGATCGCCGTAAGGGCCTTCCGGGGCCATTTCGCCTGGGTGGATCACCCCTTCCA > NC_002947/5945917‑5946200 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |