Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_002947 | 3,787,986 | (CAACTGTC)1→2 | coding (649/1392 nt) | PP_3350 ← | hypothetical protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3787977 | 4 (0.060) | 67 (1.010) +CCAACTGT |
58/248 | 0.1 | 94.5% | coding (658/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3787978 = | 4 (0.060) | coding (657/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein |
TGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/3787830‑3787977 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGCCGA > NC_002947/3787978‑3788123 |||||||| TGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCC < 7:185397/149‑1 GCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAAC < 4:143508/149‑1 GCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTG > 1:417682/1‑149 CTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCC > 1:55698/1‑148 ACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTC < 3:29193/149‑1 CCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCT > 4:280154/1‑149 GCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGT > 8:16951/1‑149 GCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGT > 4:377848/1‑149 GCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGT < 3:377848/149‑1 GCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCG < 6:8737/147‑1 GCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCACGACAAAGGCTAGCACGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGAGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑TATGCCATAGTCCCAACTGTCAAACTGTCTTCAactga > 8:211926/1‑144 CCGGCCAGGGTGCGGTCTTCGGTTTCCAGGCCTAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCAGGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTT < 7:223594/149‑1 AGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGC < 7:16951/149‑1 TGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGC > 4:22960/1‑149 GGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCA > 1:13015/1‑149 GTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCAC < 8:40710/149‑1 TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCA > 1:220920/1‑147 CGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCG > 7:280709/1‑148 GGTTTCCATGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAA < 2:13015/149‑1 GGTTTCCAGGCCAACGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAA < 2:55698/149‑1 GGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAA < 7:228797/149‑1 TTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATG > 5:351682/1‑148 CCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCAT > 6:376585/1‑149 ctcGCCACAGGCTAGCAGCCCCCTCATCCACGACGCCGACCGCGGCACGGAGCCGGAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCAGCGTCCCAACTGTCCAACTCTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATC < 8:387271/146‑1 CAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCT > 4:333825/1‑149 AAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTT < 2:238705/149‑1 AGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGC < 3:333825/149‑1 AGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGC < 3:280154/149‑1 CTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGT < 3:22960/148‑1 TAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCC > 2:343444/1‑149 GCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGT > 3:289693/1‑149 GCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGT > 1:156220/1‑149 GCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGT < 5:376585/149‑1 AGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCC < 7:11659/149‑1 AGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCC < 6:270174/149‑1 GTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCCACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTCCGTCCGTCC > 6:230684/1‑147 CCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTT > 5:76184/1‑147 CATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGA < 6:76184/148‑1 ATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGGCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAG > 1:125678/1‑149 CACGACGCCGACATCGGCAAGGTTCAGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCAAACTGTCCAACTGTCTTGACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAG < 8:280709/148‑1 CACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTAGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAG < 1:343444/148‑1 ACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCAT > 5:109180/1‑119 ACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCAT < 6:109180/119‑1 CCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGC > 8:219399/1‑149 CGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCG > 1:77036/1‑149 cgtCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGATATTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAAGTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGGACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGATGTTGAGGCTGGCGCGCACGCC < 7:211926/146‑1 GGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAA < 3:211176/149‑1 AGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACTGCGAATGCATCAAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGC > 7:158988/1‑149 AGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGG < 7:353101/119‑1 AGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGG > 8:353101/1‑119 GCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATAGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGAT < 2:220920/149‑1 CGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGT > 7:90231/1‑149 CGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTC > 7:31450/1‑132 CGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTC < 8:31450/132‑1 GTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGC < 8:393156/142‑1 GTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGC > 7:393156/1‑142 GAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCG < 2:77036/148‑1 AATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGC < 1:179090/149‑1 TTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTT > 8:326077/1‑143 TTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTT < 7:326077/143‑1 TTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAG < 4:289693/149‑1 TTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAG > 5:156665/1‑149 TTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAG < 6:351682/149‑1 GTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCGGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGC > 4:6378/1‑97 GTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTCTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCGGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGC < 3:6378/97‑1 TT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGT > 6:270962/1‑148 GCTGCCATCGTCCCAACTGACCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCGTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGAGAC > 6:387804/1‑149 GCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGCCCAA > 3:94773/1‑149 CCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAA > 4:13092/1‑148 ATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACAC < 2:125678/149‑1 TCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGG > 4:56060/1‑149 CCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTC < 4:94773/149‑1 CAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCG > 7:78577/1‑149 CAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCG > 7:72865/1‑149 GTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGCCG > 1:215114/1‑147 GTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGCCG > 5:123192/1‑147 TCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGCCGA < 3:13092/147‑1 |||||||| TGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/3787830‑3787977 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGCCGA > NC_002947/3787978‑3788123 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |