| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_002947 | 3,787,986 | (CAACTGTC)1→2 | coding (649/1392 nt) | PP_3350 ← | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3787977 | 4 (0.060) | 67 (1.010) +CCAACTGT |
58/248 | 0.1 | 94.5% | coding (658/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 3787978 = | 4 (0.060) | coding (657/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein | |||||
TGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGCCGAA > NC_002947/3787830‑3788124 | tgtAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCc < 7:185397‑M1/149‑2 (MQ=255) gcgcTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCccaac < 4:143508‑M1/149‑6 (MQ=255) gctgctCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCccaactg > 1:417682‑M1/1‑142 (MQ=255) 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3:211176‑M1/149‑102 (MQ=255) cGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATg < 2:417682/149‑1 (MQ=255) agagGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcactgcgaatgcatcaagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggc > 7:158988‑M1/1‑40 (MQ=255) agGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgagg > 8:353101‑M1/1‑38 (MQ=255) agGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgagg < 7:353101‑M1/119‑82 (MQ=255) gCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATAGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggat < 2:220920‑M1/149‑114 (MQ=255) 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7:393156‑M1/1‑33 (MQ=255) gAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcg < 2:77036‑M1/148‑119 (MQ=255) aaTTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcggc < 1:179090‑M1/149‑121 (MQ=255) tttGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgtt > 8:326077‑M1/1‑27 (MQ=255) tttGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgtt < 7:326077‑M1/143‑117 (MQ=255) ttgtt‑gCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcggcgcgtcgcggtag < 4:289693‑M1/149‑133 (MQ=255) 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TGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTT‑GCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGCCGAA > NC_002947/3787830‑3788124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |