New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 102940 = | 54 (1.020) | 3 (0.060) | 3/238 | NT | 5.1% | coding (1760/2052 nt) | prlC | oligopeptidase A |
? | NC_002947 | 103008 = | 61 (1.230) | coding (1828/2052 nt) | prlC | oligopeptidase A |
TGGCCGCAAAAAACTTCCAGTCGGGCATGATGATGGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAGGAAGAAGGCGTGCTG > NC_002947/102793‑103079 | gaacagctccatcggctcgcgcgaaccaccacgggccaggatcgcctcgcggaaggcgcggccggtctcggcgttcagcacgccttcttcctcgaagcgcgagaaggcgtcagccgacagcacttcggcccacttgtagctgtagtaGc < 3:313802‑M1/2‑1 (MQ=255) gCCGCAAAAAACTTCCAGTCGGGCATGATGATGGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGcgccc < 6:291512/149‑1 (MQ=255) ccGCAAAAAACTTCCAGTCGGGCATGATGATGGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGGGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGcgcccg < 7:126909/149‑1 (MQ=255) cGCAAAAAACTTCCAGTCGGGCATGATGATGGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGcgcccgc > 1:176981/1‑149 (MQ=255) ctccatcggctcgcgcgaaccaccacgggccaggatcgcctcgcggaaggcgcggccgctctcggcgttcagcacgccttcttcctcgaaccgcgagaaggcgtcagccgacagcacttctgcccacatgtagctgtagtaTCccgccg < 2:150995‑M1/8‑1 (MQ=255) aaCTTCCAGTCGGGCATGATGATGGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGGGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTa > 7:56879/1‑149 (MQ=255) aaCTTCCAGTCGGGCATGATGATGGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTa < 8:212629/149‑1 (MQ=255) ccAGTCGGGCATGATGATGGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAAc < 8:56879/148‑1 (MQ=255) aGTCGGGCATGATGATGGTGCGCCAGTTGCAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGc < 5:317109/149‑1 (MQ=255) gggCATGATGATGGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTc < 8:133626/148‑1 (MQ=255) atgatgGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAg > 7:102828/1‑149 (MQ=255) gatgGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTccc > 8:185388/1‑141 (MQ=255) gatgGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTccc < 7:185388/141‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTgc < 1:6228/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTgcg > 3:65981/1‑148 (MQ=255) cgcCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTgcgc < 4:65981/148‑1 (MQ=255) gatcgcctcgcggaaggcgcggccggtctcggcgttcagcacgccttcttcctcgaagcgcgagaaggcgtcagccgacagcacttcggcccacttgtagctgtagtaGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGca < 4:281804‑M1/40‑1 (MQ=255) gAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTcgc > 6:3644/1‑149 (MQ=255) aGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTcgcg > 8:127518/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCgcgggcg < 8:102828/146‑1 (MQ=255) ttCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGcac < 6:297983/129‑1 (MQ=255) ttCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGcac > 5:297983/1‑129 (MQ=255) ttCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTAcgc > 1:146279/1‑149 (MQ=255) cGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACgcgg > 6:162687/1‑149 (MQ=255) aTTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACgcggcg > 6:279106/1‑149 (MQ=255) gcgttcagcacgccttcttcctcgaagcgcgagaaggcgtcagccgacagcacttcggcccacttgtagctgtagtaGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGctact > 5:213759‑M1/78‑149 (MQ=255) gCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTcgcg > 3:263182/1‑127 (MQ=255) gCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTcgcg < 4:263182/127‑1 (MQ=255) cgttcagcacgccttcttcctcgaagcgcgagaaggcgtcagccgacagcacttcggcccacttgtagctgtagtaGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGctacta > 3:281804‑M1/77‑149 (MQ=255) agccaTGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTAc > 6:133096/1‑147 (MQ=255) caTGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTg > 5:225100/1‑149 (MQ=255) aTGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTgg < 5:279106/149‑1 (MQ=255) tGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTggg < 6:225100/149‑1 (MQ=255) gCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGcc < 5:3644/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTg < 5:162687/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGctac < 3:43661/124‑1 (MQ=255) ccGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGctac > 4:43661/1‑124 (MQ=255) cAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGt > 3:206016/1‑149 (MQ=255) gCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTc > 5:279614/1‑141 (MQ=255) gCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTc < 6:279614/141‑1 (MQ=255) gCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGAc < 3:169920/148‑1 (MQ=255) gCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGAc < 3:164719/148‑1 (MQ=255) cAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGc > 4:55499/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGAc > 5:23436/1‑140 (MQ=255) tCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGAc < 6:23436/140‑1 (MQ=255) gAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTcgcg > 3:312885/1‑149 (MQ=255) 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cGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAGga < 5:133096/149‑1 (MQ=255) tGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAg > 2:12073/1‑145 (MQ=255) tGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAg < 1:12073/145‑1 (MQ=255) gACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTAcg > 7:170322/1‑79 (MQ=255) gACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTAcg < 8:170322/79‑1 (MQ=255) gtgtCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAGGAAGAAGGCGt < 4:312885/149‑1 (MQ=255) tgtCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGcc < 7:322028/101‑1 (MQ=255) tgtCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGcc > 8:322028/1‑101 (MQ=255) gtCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAGGAAGAAGGCGTGc > 5:54195/1‑149 (MQ=255) ggTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAGGAAGAAGGCGTGCTg > 1:71453/1‑148 (MQ=255) aTGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCgcgc < 8:101950/123‑1 (MQ=255) aTGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCgcgc > 7:101950/1‑123 (MQ=255) cgcccgccGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAGGAAGAAGGCg < 5:121150/136‑1 (MQ=255) cgcccgccGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAGGAAGAAGGCg > 6:121150/1‑136 (MQ=255) | TGGCCGCAAAAAACTTCCAGTCGGGCATGATGATGGTGCGCCAGTTGGAGTTCTCGCTGTTCGATTTCGAGCTGCACGCCAGCCATGGCGACGGCCGCAGCGTATTGCAGGTGCTCGAAGGTGTGCGTGACGAGGTGTCGGTCATGCGCCCGCCGGCTTACAACCGCTTCCCCAACAGCTTTGCGCACATTTTCGCGGGCGGTTACGCGGCGGGCTACTACAGCTACAAGTGGGCCGAAGTGCTGTCGGCTGACGCCTTCTCGCGCTTCGAGGAAGAAGGCGTGCTG > NC_002947/102793‑103079 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |