New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 478290 | 19 (0.360) | 6 (0.150) | 5/194 | NT | 34.8% | intergenic (+38/+72) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
? | NC_002947 | = 478325 | 8 (0.200) | intergenic (+73/+37) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
GTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCG > NC_002947/478151‑478431 | gtgGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCt > 6:308458/1‑148 (MQ=255) ggCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGc > 4:205175/1‑149 (MQ=255) gCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGcc > 3:43566/1‑149 (MQ=255) aaGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGccc > 2:238329/1‑148 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACggg < 3:174554/135‑1 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACggg > 4:174554/1‑135 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACggg < 2:210326/135‑1 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACggg > 1:210326/1‑135 (MQ=255) gcgcAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGa < 3:180377/148‑1 (MQ=255) cgcAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATGAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGAtg < 1:340782/149‑1 (MQ=255) gcAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGAtgt < 5:308458/149‑1 (MQ=255) gcAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACAGGCCCCCCTCGCCTTTGAGTGCCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGCCCTCTTCGCCGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacccaacagaggttgggca > 3:254863‑M1/1‑123 (MQ=255) aaGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtag > 7:173086‑M2/1‑144 (MQ=255) aaGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtag < 8:173086‑M2/148‑5 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGGCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGGCCGCTTGAGCCTGTTTCGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcg < 4:254863‑M1/149‑45 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcg > 5:47618‑M1/1‑105 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcg > 5:128169‑M1/1‑104 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcg < 6:128169‑M1/148‑45 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg > 3:205175‑M2/1‑139 (MQ=255) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcggg < 6:47618‑M1/149‑47 (MQ=255) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTGGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg > 1:238329‑M2/1‑139 (MQ=255) tcgatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtt > 1:105206‑M2/1‑135 (MQ=255) gatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCCACCGCTGATGTGTGGCCCCTgtaggagcggggttac < 3:203417‑M2/149‑17 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg > 8:297851‑M2/1‑127 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg < 7:297851‑M2/137‑11 (MQ=255) tACTGGCCCCCGTGGCCTTTGTGGGGCGCTGGTTTCAGTTTCCGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACT‑‑ACGGGCTG‑AGCCAAACCTCTTATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 4:203417‑M2/1‑126 (MQ=255) tGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGAtgt < 6:260460/114‑1 (MQ=255) tGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGAtgt > 5:260460/1‑114 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGTCACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaaga > 1:100293‑M2/1‑123 (MQ=255) cccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑CCGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 5:156204/1‑149 (MQ=255) cAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTc < 6:156204/148‑1 (MQ=255) aGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTc > 5:280175/1‑147 (MQ=255) tATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 6:280175/149‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtgacgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggc > 1:100293‑M1/1‑25 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacataagaggtttggctcagcccgtagtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcggaaactgaaaccagcgccccacaaaggccacgggggccagta > 4:203417‑M1/1‑23 (MQ=255) gTAACCCCGCTCCTACaggggccacacatcagcggtggggctcagcccgtcgtcggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatc < 3:203417‑M1/149‑134 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcga > 1:105206‑M1/1‑13 (MQ=255) cccGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatct < 6:47618‑M2/149‑104 (MQ=255) ccGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctccagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatct > 1:238329‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctg > 3:205175‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtac < 7:297851‑M1/137‑128 (MQ=255) ccGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtac > 8:297851‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTg < 2:159871/93‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTg > 1:159871/1‑93 (MQ=255) cGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgc > 5:47618‑M2/1‑44 (MQ=255) cGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctg < 6:128169‑M2/148‑105 (MQ=255) cGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctg > 5:128169‑M2/1‑44 (MQ=255) cGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggctttacccgcgaagaggccgaaacaggctcaagcggccgtcaactgcaacccgcgccactcaaagcccacgggggccagtacctgatcgatctgc < 4:254863‑M2/149‑106 (MQ=255) cTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgcgctt > 7:173086‑M1/1‑4 (MQ=255) cTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgcgctt < 8:173086‑M1/148‑145 (MQ=255) | GTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCG > NC_002947/478151‑478431 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |