New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 478290 | 19 (0.360) | 6 (0.150) | 5/194 | NT | 34.8% | intergenic (+38/+72) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
? | NC_002947 | = 478325 | 8 (0.200) | intergenic (+73/+37) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
AAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCAC > NC_002947/478182‑478448 | aaGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtag < 8:173086‑M2/148‑5 (MQ=255) aaGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtag > 7:173086‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg > 3:205175‑M2/1‑139 (MQ=255) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTGGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg > 1:238329‑M2/1‑139 (MQ=255) tcgatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtt > 1:105206‑M2/1‑135 (MQ=255) gatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCCACCGCTGATGTGTGGCCCCTgtaggagcggggttac < 3:203417‑M2/149‑17 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg > 8:297851‑M2/1‑127 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg < 7:297851‑M2/137‑11 (MQ=255) tACTGGCCCCCGTGGCCTTTGTGGGGCGCTGGTTTCAGTTTCCGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACT‑‑ACGGGCTG‑AGCCAAACCTCTTATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 4:203417‑M2/1‑126 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGTCACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaaga > 1:100293‑M2/1‑123 (MQ=255) cccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑CCGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 5:156204/1‑149 (MQ=255) cAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTc < 6:156204/148‑1 (MQ=255) aGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTc > 5:280175/1‑147 (MQ=255) tATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 6:280175/149‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatct < 6:47618‑M2/149‑104 (MQ=255) ccGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTg < 2:159871/93‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTg > 1:159871/1‑93 (MQ=255) cGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgc > 5:47618‑M2/1‑44 (MQ=255) cGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctg < 6:128169‑M2/148‑105 (MQ=255) cGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctg > 5:128169‑M2/1‑44 (MQ=255) cGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggctttacccgcgaagaggccgaaacaggctcaagcggccgtcaactgcaacccgcgccactcaaagcccacgggggccagtacctgatcgatctgc < 4:254863‑M2/149‑106 (MQ=255) tgcCCAACCTCTGTTGGGTGCCCCCTgtaggagcgggtttaccggcgaagagggcgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcggcactcaaaggcgaggggggcctgtacctgatcgatctgcgcttcctgccacagctgc > 3:254863‑M2/2‑26 (MQ=255) ctGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAg < 6:255964/127‑1 (MQ=255) tgtgCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGa < 1:163021/113‑1 (MQ=255) tgtgCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGa > 2:163021/1‑113 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTc > 2:55055/1‑79 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTc < 1:55055/79‑1 (MQ=255) | AAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑‑ACGGGCTG‑AGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCAC > NC_002947/478182‑478448 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |