New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 688301 | 54 (1.020) | 6 (0.120) | 6/240 | NT | 9.8% | coding (1166/1182 nt) | ydgK | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
? | NC_002947 | = 688328 | 59 (1.180) | coding (7/183 nt) | PP_5446 | hypothetical protein |
GTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCGGGGTTTCGGCTCGACG > NC_002947/688162‑688446 | gTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGGGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGTCGTTTGCAGGCCAAGGCTcc < 6:153396/149‑1 (MQ=255) aGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGC‑‑‑TACAGGCacctcacccgcttatg < 3:17126‑M1/149‑17 (MQ=255) gTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCa > 5:59446/1‑148 (MQ=255) tGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCacctcacccgcttatgcgggagcctt > 1:140078‑M1/1‑123 (MQ=255) tGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAgg < 7:20245/128‑1 (MQ=255) tGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAgg > 8:20245/1‑128 (MQ=255) tGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAgg > 2:172440/1‑149 (MQ=255) gCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGt > 6:31038/1‑149 (MQ=255) cGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAgg < 6:59446/147‑1 (MQ=255) gTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCacctcacccgcttatgcgggagccttggcct > 5:313126‑M1/1‑118 (MQ=255) gTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCacctcacccgcttatgcgggagccttggcct < 2:140078‑M1/149‑32 (MQ=255) tgcGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAg > 5:72414/1‑149 (MQ=255) gcggcgCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGc > 6:130741/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCgg < 5:130741/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCgg < 3:10301/149‑1 (MQ=255) gcTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGC‑‑‑TGCAGGCacctcacccgcttatgcgggagccttggcctgcaaacgccgggt < 3:181961‑M1/149‑45 (MQ=255) cTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCacctcacccgcttatgcgggagccttggcctgcaaacgccgg < 6:313126‑M1/149‑43 (MQ=255) gTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCgg < 1:209078/143‑1 (MQ=255) gTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCgg > 2:209078/1‑143 (MQ=255) gTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTc > 3:215020/1‑148 (MQ=255) tACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTgg > 7:89188/1‑149 (MQ=255) cTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGc > 5:212193/1‑148 (MQ=255) cATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTc > 8:304796/1‑136 (MQ=255) cATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTc < 7:304796/136‑1 (MQ=255) cATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGcgac > 4:112188/1‑148 (MQ=255) cATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGcgac < 6:212193/148‑1 (MQ=255) tgatgGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGaa < 1:172440/149‑1 (MQ=255) tgatgGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGaa > 8:317349/1‑149 (MQ=255) gatgGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCGTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTg > 4:52428/1‑140 (MQ=255) gatgGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTg < 3:52428/140‑1 (MQ=255) atgGCTGTGCGGTGCCCATGGAAATGGTGATCAGCCTGTGGGGGGCGCTGGTGGTCTGTGTTGGGGTGTTGACCGGGGGTTTGCAGGCCATGGCTCCCGAATATGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCGGGGTTTCCAGGGTGGCGACGAAg < 8:89188/148‑1 (MQ=255) tgGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGgc > 6:355426/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGgcgc > 4:282891/1‑149 (MQ=255) gTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCt > 5:141036/1‑147 (MQ=255) gTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCa < 5:355426/149‑1 (MQ=255) ccATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGATGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCt > 1:51991/1‑149 (MQ=255) aTGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCg > 6:173353/1‑149 (MQ=255) aTGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCg < 4:215020/149‑1 (MQ=255) aaTCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGc > 8:242976/1‑114 (MQ=255) aaTCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGc < 7:242976/114‑1 (MQ=255) tGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGACGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAAc > 8:116871/1‑149 (MQ=255) aGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGAc < 5:173353/148‑1 (MQ=255) aGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGAc < 6:72414/148‑1 (MQ=255) gCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACca > 8:251644/1‑149 (MQ=255) cTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCAGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCggg > 8:119301/1‑93 (MQ=255) cgcTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGa > 2:225835/1‑127 (MQ=255) gtggtCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCt < 3:282891/147‑1 (MQ=255) gtggtCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCACCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTgg < 7:317349/149‑1 (MQ=255) gtCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACt > 6:220283/1‑149 (MQ=255) aGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGc > 7:288317/1‑149 (MQ=255) ttGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCaa < 3:237282/148‑1 (MQ=255) ttGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAg < 2:51991/149‑1 (MQ=255) gACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCgg < 7:251644/148‑1 (MQ=255) gACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACAACATGATGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCggg > 6:301840/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTgcctgcagccgggtcaacagcgcaacactgaccaccagcgccccgcacaggctgatcacgattgccatgggcaccgcactgccatcatgcagtagcccgaccagc < 3:181961‑M2/149‑106 (MQ=255) ccGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTgcctgcaaacgccgggtcaacagcgcaacactgaccaccagcgccccgcacaggctgatcacgattgccatgggcaccgcactgccatcatgcagtagcccgaccag < 6:313126‑M2/149‑108 (MQ=255) ccGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGc < 5:205438/114‑1 (MQ=255) ccGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGc > 6:205438/1‑114 (MQ=255) ggCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCGGGGTTTc < 6:141036/149‑1 (MQ=255) ggCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCGGGGTTTc < 5:31038/149‑1 (MQ=255) gCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCGGGGTTTCg < 8:288317/149‑1 (MQ=255) cGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCGGGGTTTCgg < 5:220283/149‑1 (MQ=255) gTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCGGGGTTTCGGc > 4:61730/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCGGGGTTTCGGCTCGa > 8:170409/1‑149 (MQ=255) aGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTgcctgcaaacgccgggtcaacagcgcaacactgaccaccagcgccccgcacaggctgatcacgattgccatgggcaccgcactgccatcatgcagtagcccgaccagcgccgcagcac > 5:313126‑M2/1‑31 (MQ=255) aGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTgcctgcaaacgccgggtcaacagcgcaacactgaccaccagcgccccgcacaggctgatcacgattgccatgggcaccgcactgccatcatgcagtagcccgaccagcgccgcagcac < 2:140078‑M2/149‑119 (MQ=255) aGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCGGGGTTTCGGCTCGACg > 1:290619/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGc > 8:289466/1‑125 (MQ=255) ccAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGc < 7:289466/125‑1 (MQ=255) | GTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGCGGGGTTTCGGCTCGACG > NC_002947/688162‑688446 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |