New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 737628 = | 34 (0.640) | 4 (0.080) | 4/240 | NT | 10.7% | intergenic (+11/+101) | PP_0629/yacG | membrane protein/DNA gyrase inhibitor YacG |
? | NC_002947 | 737661 = | 35 (0.700) | intergenic (+44/+68) | PP_0629/yacG | membrane protein/DNA gyrase inhibitor YacG |
CTGTGGCTGATGATGTTCCCCGAGGCGTTCATCAACGGCATGGTGATAAGTGCGCTGGTGGTGTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATGCCGCGGCTCCAGGTCCCCCGAATACAGCTCATCTTCGGACTC > NC_002947/737480‑737776 | cTGTGGCTGATGATGTTCCCCGAGGCGTTCATCAACGGCATGGTGATAAGTGCGCTGGTGGTGTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGAAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGtggtgg > 7:57268/1‑149 (MQ=255) atgatgTTCCCCGAGGCGTTCATCAACGGCATGGTGATAAGTGCGCTGGTGGTGTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCgg > 3:214616/1‑149 (MQ=255) cGTTCATCAACGGCATGGTGATAAGTGCGCTGGTGGTGTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAAt > 5:279893/1‑149 (MQ=255) gTTCATCAACGGCATGGTGATAAGTGCGCTGGTGGTGTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATg > 7:133643/1‑149 (MQ=255) aTGGTGATAAGTGCGCTGGTGGTGTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCaga < 8:75952/149‑1 (MQ=255) tAAGTGCGCTGGTGGTGTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGcc < 6:279893/149‑1 (MQ=255) ttcgggggacctggagccgcggcattgagctgatccaccaatacaacgcgggcccacaacccgcgcggtacctgtgggagcgggcaagctctgagtGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACt < 1:141366‑M1/36‑1 (MQ=255) ttcgggggacctggagccgcggcattgagctgatccaccaatacaacgcgggcccacaacccgcgcggtacctgtgggagcgggcaagctctgagtGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACt > 2:141366‑M1/97‑132 (MQ=255) cgcTGGTGGTGTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTc < 1:346018/148‑1 (MQ=255) gtggtgTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCgg < 3:302813/110‑1 (MQ=255) gtggtgTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCgg > 4:302813/1‑110 (MQ=255) tgtTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTAc > 4:330766/1‑149 (MQ=255) tttGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCa > 8:183459/1‑122 (MQ=255) ttGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACcgcg > 7:85898/1‑149 (MQ=255) cccGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCggg > 7:225704/1‑149 (MQ=255) aGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTtgt < 7:196697/149‑1 (MQ=255) gTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTtgtg < 8:85898/149‑1 (MQ=255) tGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTgg < 8:133643/149‑1 (MQ=255) ttgagctgatccaccaatacaacgcgggcccacaacccgcgcggtacctgtgggagcgggcaagctctgagtGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCaga > 8:119044‑M1/73‑112 (MQ=255) ttgagctgatccaccaatacaacgcgggcccacaacccgcgcggtacctgtgggagcgggcaagctctgagtGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCaga < 7:119044‑M1/40‑1 (MQ=255) cTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGcc > 2:59613/1‑149 (MQ=255) ggAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGTCcg > 2:42424/1‑149 (MQ=255) aaCCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGTCCGCGt < 1:42424/149‑1 (MQ=255) aCCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGtt < 3:330766/149‑1 (MQ=255) aCCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGtt < 8:57268/149‑1 (MQ=255) cTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGcaca < 4:151861/93‑1 (MQ=255) cTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGcaca > 3:151861/1‑93 (MQ=255) cTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCcgcg < 4:191705/145‑1 (MQ=255) cTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCcgcg > 3:191705/1‑145 (MQ=255) cAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTAt < 8:225704/148‑1 (MQ=255) ccGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATtggt > 8:276069/1‑149 (MQ=255) aacgcgggcccacaacccgcgcggtacctgtgggagcgggcaagctctgagtGCtgt > 8:209819‑M1/53‑57 (MQ=255) aacgcgggcccacaacccgcgcggtacctgtgggagcgggcaagctctgagtGCtgt < 7:209819‑M1/5‑1 (MQ=255) cgcgGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATc < 1:59613/149‑1 (MQ=255) gcgGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATc < 1:330033/148‑1 (MQ=255) gcgGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATc > 2:330033/1‑148 (MQ=255) gTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCca > 4:93160/1‑102 (MQ=255) gTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCca < 3:93160/102‑1 (MQ=255) gCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGGGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATg < 2:166003/148‑1 (MQ=255) ggCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATGCcgc < 4:214616/149‑1 (MQ=255) cGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATGCCGCGGCTCCAGGTCCCCCGAATACa < 7:276069/149‑1 (MQ=255) gtggCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATGCCGCGGCTCCAGGTCCCCCGAATACAGCTCATCTTCGGa > 3:299060/1‑149 (MQ=255) tggCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATGCCGCGGCTCCAg < 7:187996/121‑1 (MQ=255) tggCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATGCCGCGGCTCCAg > 8:187996/1‑121 (MQ=255) GCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATGCCGCGGCTCCAGGTCCCCCGAATACAGCTCATCTTCGGActc < 5:56195‑M1/149‑1 (MQ=255) GCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATGCCGCGGCTCCAGGTCCCCCGAATACAGCTCATCTTCGGActc < 3:7379‑M1/149‑1 (MQ=255) | CTGTGGCTGATGATGTTCCCCGAGGCGTTCATCAACGGCATGGTGATAAGTGCGCTGGTGGTGTTTTGCCCCGAGTGGCTGGAAACCTTCAACCGGACGCGGTATTTGCAGGCGCCCTGGAAGGAAGATGAGCGGTGAATGTGTGGTGGCTGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTAATGCACAGCACTCAGAGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGCGGGTTGTGGGCCCGCGTTGTATTGGTGGATCAGCTCAATGCCGCGGCTCCAGGTCCCCCGAATACAGCTCATCTTCGGACTC > NC_002947/737480‑737776 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |