New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1266340 = | 44 (0.830) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.2% | coding (1648/2442 nt) | quiP | acyl‑homoserine lactone acylase QuiP |
? | NC_002947 | 1266412 = | 49 (0.970) | coding (1576/2442 nt) | quiP | acyl‑homoserine lactone acylase QuiP |
GCCGACACCGGGCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAG > NC_002947/1266192‑1266484 | gCCGACACCGGGCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGGGGGGAGGGGGAGGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCttgtt < 1:274960/149‑1 (MQ=255) tatgccgacccgatgctgcacccgtacgaccaggacccacccgcgggctggatcggccatgccaaccagcgcagcctgccgcgcggctatggcatgcagctgtccagcacctggtactaccccgagcgtgccgaacgactggcacagct < 5:323589‑M1/1‑1 (MQ=255) tgccgacccgatgctgcacccgtacgaccaggacccacccgcgggctggatcggccatgccaaccagcgcagcctgccgcgcggctatggcatgcagctgtccagcacctggtactaccccgagcgtgccgaacgactggcacagcTg > 5:319477‑M1/147‑148 (MQ=255) gccgacccgatgctgcacccgtacgaccaggacccacccgcgggctggatcggccatgccaaccagcgcagcctgccgcgcggctatggcatgcagctgtccagcacctggtactaccccgagcgtgccgaacgactggcacagcTGGc < 6:347456‑M1/4‑1 (MQ=255) cacCGGGCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGTAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGTG‑CCATGCCGGGTGCTTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCa < 2:47218/149‑1 (MQ=255) cacCGGGCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGc > 7:290051/1‑147 (MQ=255) cacCGGGCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCa < 3:3770/149‑1 (MQ=255) acCGGGCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAg > 2:347833/1‑149 (MQ=255) cGGGCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGc > 4:149239/1‑148 (MQ=255) gggCGCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCaa < 7:256644/149‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGGCCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAg < 1:252972/149‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAgg < 4:179874/149‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGt < 8:162763/149‑1 (MQ=255) tCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGtt > 4:8680/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGt < 8:298944/140‑1 (MQ=255) ggCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCAGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGt > 7:298944/1‑140 (MQ=255) ttGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGc > 5:33533/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGc > 7:8051/1‑149 (MQ=255) cAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGc < 3:149239/149‑1 (MQ=255) gCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGa > 3:33169/1‑149 (MQ=255) cGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCttgttg > 6:63030/1‑103 (MQ=255) cGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCttgttg < 5:63030/103‑1 (MQ=255) tgtCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTg < 6:33533/149‑1 (MQ=255) tCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTc < 8:290051/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCg < 3:8680/149‑1 (MQ=255) gcgGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGt < 4:33169/149‑1 (MQ=255) cgGGCCTTGTAGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTTGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCATGGCCATCAGTCTGCGACTGTCTTg < 8:100815/149‑1 (MQ=255) gcagcctgccgcgcggctatggcatgcagctgtccagcacctggtactaccccgagcgtgccgaacgactggcacagcTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGcc > 6:82766‑M1/79‑149 (MQ=255) cccGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGc < 1:347833/147‑1 (MQ=255) cccGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGc > 8:23958/1‑147 (MQ=255) cggcggGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCAcc > 6:352237/1‑92 (MQ=255) ggggAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTg > 7:83333/1‑115 (MQ=255) ggggAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTg < 8:83333/115‑1 (MQ=255) gTCGATTGCCTGCGTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGtt > 5:290359/1‑149 (MQ=255) tCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTc > 7:218206/1‑149 (MQ=255) cTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCgg < 8:218206/149‑1 (MQ=255) cgaatctcTGGG‑CCATGCCGGGTGCGGCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCgggg < 5:209967/142‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCgggg < 7:23958/148‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCggg < 1:275753/147‑1 (MQ=255) aGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGgt < 8:8051/148‑1 (MQ=255) gTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGgtag > 2:112367/1‑149 (MQ=255) gTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTACGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGGCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGgtag > 6:227669/1‑149 (MQ=255) tGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCAGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGgtag > 1:117252/1‑148 (MQ=255) tGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCgggg > 6:209967/1‑141 (MQ=255) gg‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGTCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCggg > 2:28292/1‑138 (MQ=255) gg‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGACAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCggg < 1:28292/138‑1 (MQ=255) cctggtactaccccgagcgtgccgaacgactggcacagcTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCa > 3:33921‑M1/40‑111 (MQ=255) cctggtactaccccgagcgtgccgaacgactggcacagcTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCa < 4:33921‑M1/72‑1 (MQ=255) tGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAg < 2:20770/143‑1 (MQ=255) tGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAg > 1:20770/1‑143 (MQ=255) tGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTg < 6:290359/149‑1 (MQ=255) tCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCt > 7:267790/1‑138 (MQ=255) tCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCt < 8:267790/138‑1 (MQ=255) aGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTACGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGGCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCcgcgcg < 5:227669/148‑1 (MQ=255) ttgttgGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAg > 4:319167/1‑149 (MQ=255) | GCCGACACCGGGCTCAGGCGGCCATCGAAGGCCTTGAGCCGGGCCAGCGTGTCGCGGGCCTTGTCGCGCTGCCCGGCGGGGAGGGCGTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGG‑CCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAG > NC_002947/1266192‑1266484 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |