New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1564136 | 52 (0.980) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 6.6% | coding (1193/1473 nt) | pitB | phosphate transporter |
? | NC_002947 | = 1564229 | 63 (1.240) | coding (1100/1473 nt) | pitB | phosphate transporter |
GTGCCGGCCACGCCAGACGACAGCACGTGGGTGGTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGACTTTTCACGGGCGTCCAGGC > NC_002947/1563989‑1564283 | gTGCCGGCCACGCCAGACGACAGCACGTGGGTGGTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGt < 3:124861/149‑1 (MQ=255) cGGCCACGCCAGACGACAGCACGTGGGTGGTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAac < 2:63772/149‑1 (MQ=255) gCCAGACGACAGCACGTGGGTGGTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCAcgc < 1:63045/149‑1 (MQ=255) ccAGACGACAGCACGTGGGTGGTCGATACCGGCAGGGCGAATAAGTTCGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCCCTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGccaccaccgaata > 1:219185‑M1/1‑136 (MQ=255) gacgacAGCACGTGGGTGGTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCtt > 4:241709/1‑149 (MQ=255) acgacAGCACGTGGGTGGTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTc < 3:241709/149‑1 (MQ=255) gtgggtggTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCa > 4:171082/1‑141 (MQ=255) gtgggtggTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCa < 3:171082/141‑1 (MQ=255) gtgggtggTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCaa > 4:161738/1‑146 (MQ=255) gtgggtggTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGGGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCaa < 3:161738/146‑1 (MQ=255) gATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAg > 4:185650/1‑149 (MQ=255) gATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGAGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAg > 3:154960/1‑149 (MQ=255) gAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTg > 1:111614/1‑149 (MQ=255) tACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTTTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGa > 3:305639/1‑149 (MQ=255) aCGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTAcc > 4:189639/1‑128 (MQ=255) aCGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTAcc < 3:189639/128‑1 (MQ=255) gTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAg < 8:21006/129‑1 (MQ=255) gTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAg > 7:21006/1‑129 (MQ=255) gTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACgg > 5:107655/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACgg > 7:208061/1‑149 (MQ=255) gCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTTTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCAc < 4:305639/149‑1 (MQ=255) gATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCAccc < 6:107655/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGACAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAg > 3:55532/1‑148 (MQ=255) gcAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACg > 3:136056/1‑149 (MQ=255) gcAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACg > 3:130926/1‑149 (MQ=255) gCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTTATTTTTTTTTTTGATATGTTGTCGACCTAGTTCTACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGc < 4:154960/149‑1 (MQ=255) cTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCg < 8:208061/149‑1 (MQ=255) aTCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCgg < 4:130926/148‑1 (MQ=255) aTCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCgg < 4:136056/148‑1 (MQ=255) tgCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGccaccaccgaatacgccccgttctgggtgatcgtggccgtcgcactggcccctggcctgggtaccatggttggctggaagcgcgtggtgttga > 6:229051‑M1/1‑56 (MQ=255) ccGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGcg < 7:153843‑M2/149‑3 (MQ=255) cGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGccaccaccgaatacgccccgttctgggtgatcgtggccgtcgcactggcccctggcctgggtaccatggttggctggaagcgcgtggtgttgacgg < 5:229051‑M1/149‑97 (MQ=255) cATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGccaccaccgaatacgccccgttctgggtgatcgtggccgtcgcactggcccttggcctgtgtaccatggttggctggaagcgcgtggtgttaactgtgg < 2:219185‑M1/149‑100 (MQ=255) ccTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTc > 6:98695/1‑149 (MQ=255) ttGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCtt > 5:178482/1‑149 (MQ=255) gggCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGTCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCttt < 8:153843/148‑1 (MQ=255) gggCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCttt < 6:178482/148‑1 (MQ=255) gggCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCttt < 3:185650/148‑1 (MQ=255) gggCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTg > 8:224944/1‑149 (MQ=255) cATAGGTCATGCTTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCGACCGTCAACACCAGGCTCTTCCAGCCAACCATTGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCGATAACGTGGAGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTgcgc < 4:55532/149‑1 (MQ=255) aGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGt > 6:301902/1‑149 (MQ=255) gTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAgg > 7:186560/1‑78 (MQ=255) gTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAgg < 8:186560/78‑1 (MQ=255) aTGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCggtg > 1:24984/1‑120 (MQ=255) aTGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCggtg < 2:24984/120‑1 (MQ=255) aTGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGttttt > 7:50274/1‑148 (MQ=255) aTGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTc < 5:301902/149‑1 (MQ=255) gCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTc > 5:153511/1‑147 (MQ=255) gCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTc > 5:148263/1‑147 (MQ=255) ttGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCAAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGa > 1:346712/1‑149 (MQ=255) ccGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAg > 8:45814/1‑62 (MQ=255) ccGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAg < 7:45814/62‑1 (MQ=255) cttctCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGACTTTTCAc > 7:134855/1‑149 (MQ=255) ctcGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGACTTTTCACgg < 6:286378/148‑1 (MQ=255) ctcGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGACTTTTCACgg < 2:346712/148‑1 (MQ=255) tcGCCCACCGTCCACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGACTTTTCACGGGc > 3:197204/1‑149 (MQ=255) gCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGTCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGa < 2:224877/135‑1 (MQ=255) gCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGTCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGa > 1:224877/1‑135 (MQ=255) gCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGACTTTTCACGGGc < 8:134855/147‑1 (MQ=255) ccACAGTTAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACACAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGcggtgggcgagaagatcggcaaacaaggcatgacctatgcccaaggcatg < 2:219185‑M2/149‑51 (MQ=255) ccGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAGGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGcggtgggcgagaagatcggcaaacaaggcatgacctatgcccaaggcatgtcg < 5:229051‑M2/149‑54 (MQ=255) ccGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGACTTTTCACGGGCGTCCAgg > 8:43136/1‑149 (MQ=255) cGccaccaccgaatacgccccgttctgggtgatcgtggccgtcgcactggcccttggcctgggtaccatggttggctggaagcgcgtggtgttgacggtgggcgagaagatcggcaaacaaggcatgacctatgcccaaggcatgtcgg < 7:153843‑M1/149‑148 (MQ=255) | GTGCCGGCCACGCCAGACGACAGCACGTGGGTGGTCGATACCGGCAGGGCGAATACGTTGGCCATGCCGATGGCGCAGGCTGCGGTGATCTGTGCCGACATGCCTTGGGCATAGGTCATGCCTTGTTTGCCGATCTTCTCGCCCACCGTCAACACCACGCGCTTCCAGCCAACCATGGTACCCAGGCCAAGGGCCAGTGCGACGGCCACGATCACCCAGAACGGGGCGTATTCGGTGGTGGCGGTGAGGTCTTTGCGCAGTTTTTCAAGGTCGGACTTTTCACGGGCGTCCAGGC > NC_002947/1563989‑1564283 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |