New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2426030 = | 74 (1.400) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 5.6% | coding (864/942 nt) | PP_2127 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 2426062 = | 64 (1.270) | coding (832/942 nt) | PP_2127 | sensor histidine kinase |
GCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTGGATCGACAACGACAGC > NC_002947/2425882‑2426177 | ctggtcatccgcctgcaacgcacccctgaagggctgtcgttgtcgatccaggacgatggtcgtggtttcgcccctgcccggcacccggccgaggccggtcagcgcggcctggccggcatgcaggagcgggtaatcgcgctgcagggcag < 8:81022‑M1/1‑1 (MQ=255) tCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAg > 1:284840/1‑149 (MQ=255) cGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAgg > 4:341367/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACt > 6:14475/1‑149 (MQ=255) cAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTg > 6:228235/1‑149 (MQ=255) cccGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGAt < 3:341367/149‑1 (MQ=255) aCCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGa < 5:71975/149‑1 (MQ=255) ccccGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAg < 1:260572/149‑1 (MQ=255) cccGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAgg < 2:284840/149‑1 (MQ=255) gcgGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGccc > 6:363011/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCa < 5:14475/149‑1 (MQ=255) tCAGCGATTGTTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTTGTAATACTCCTGGCGCGTTTCTGGGTGCGCGGGGACAACGGGAACATCGCTTCTATCTGCGTGCCTCGGCAAGGCTGACTGGTg < 4:4504/129‑1 (MQ=255) tCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGc > 8:119629/1‑120 (MQ=255) tCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGc < 7:119629/120‑1 (MQ=255) tCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAg > 3:311346/1‑149 (MQ=255) tCAGCCAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTAGGTAATACTCATGGCGCGTAGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTAGGCCAGGCTGACTGGTg > 3:4504/1‑129 (MQ=255) gCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGcc < 5:189632/140‑1 (MQ=255) gCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGcc > 6:189632/1‑140 (MQ=255) gCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAgcgc > 8:128596/1‑149 (MQ=255) gAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGa < 4:47826/149‑1 (MQ=255) gAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTACTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGa < 6:223522/149‑1 (MQ=255) aggacgatggtcgtggtttcgcccctgcccggcacccggccgaggccggtcagcgcggcctggccggcatgcaggagcgggtaatcgcgctgcagggcaGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGc > 5:260553‑M1/100‑134 (MQ=255) aggacgatggtcgtggtttcgcccctgcccggcacccggccgaggccggtcagcgcggcctggccggcatgcaggagcgggtaatcgcgctgcagggcaGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGc < 6:260553‑M1/35‑1 (MQ=255) gTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTAcc > 3:344316/1‑149 (MQ=255) gTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTAcc > 2:5299/1‑149 (MQ=255) gatggtcgtggtttcgcccctgcccggcacccggccgaggccggtcagcgcggcctggccggcatgcaggagcgggtaatcgcgctgcagggcaGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGccc < 7:298634‑M1/37‑1 (MQ=255) gatggtcgtggtttcgcccctgcccggcacccggccgaggccggtcagcgcggcctggccggcatgcaggagcgggtaatcgcgctgcagggcaGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGccc > 8:298634‑M1/95‑131 (MQ=255) aCCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATg < 5:33500/115‑1 (MQ=255) aCCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATg > 6:33500/1‑115 (MQ=255) ccAGCAGTAGTCTACAGGTCATTGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTTATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTcc < 8:179196/147‑1 (MQ=255) ccAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTg > 4:88344/1‑149 (MQ=255) agcagTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCa < 5:228235/149‑1 (MQ=255) agcagTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCa > 7:126502/1‑149 (MQ=255) agcagTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCa < 5:363011/149‑1 (MQ=255) gcagTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCAt > 7:70562/1‑149 (MQ=255) cagTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGa > 4:300588/1‑132 (MQ=255) cagTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGa < 3:300588/132‑1 (MQ=255) gtCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAgg < 4:25262/111‑1 (MQ=255) gtCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAgg > 3:25262/1‑111 (MQ=255) gtCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGc < 6:44211/149‑1 (MQ=255) gtCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGc > 6:90091/1‑149 (MQ=255) tACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAg > 5:238320/1‑149 (MQ=255) gTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCcgc > 2:335058/1‑149 (MQ=255) aTGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCt > 3:314340/1‑149 (MQ=255) ggttggtAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGa > 5:84249/1‑149 (MQ=255) ttggtAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGAcc < 4:344316/149‑1 (MQ=255) gtAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGc < 6:84249/149‑1 (MQ=255) aaTACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCt > 8:247323/1‑149 (MQ=255) aTACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCt < 1:335058/148‑1 (MQ=255) aTACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTc < 3:88344/149‑1 (MQ=255) tACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCg > 8:111253/1‑149 (MQ=255) aCTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCgg > 6:251927/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTgg < 4:189811/75‑1 (MQ=255) gcgcGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGt < 7:128596/148‑1 (MQ=255) gcgcGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGt < 5:251927/148‑1 (MQ=255) cTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAg > 6:135219/1‑149 (MQ=255) tGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCg < 6:92841/126‑1 (MQ=255) tGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGAGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCg > 5:92841/1‑126 (MQ=255) gggTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTTGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAggg > 5:218823/1‑149 (MQ=255) cgGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAAc < 1:5299/149‑1 (MQ=255) aCCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGa > 6:32677/1‑149 (MQ=255) ccACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAggg > 1:244068/1‑136 (MQ=255) ccACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAggg < 2:244068/136‑1 (MQ=255) aCGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCa > 8:214512/1‑149 (MQ=255) gggAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATc > 2:35930/1‑149 (MQ=255) aaCATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCGGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTc < 6:238320/149‑1 (MQ=255) aaCATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTc < 1:35930/149‑1 (MQ=255) aCATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGCCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTcc > 4:309450/1‑149 (MQ=255) cATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGACCt > 6:308624/1‑149 (MQ=255) tCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTg > 2:300260/1‑148 (MQ=255) cTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCgg > 5:47680/1‑116 (MQ=255) cTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCgg < 6:47680/116‑1 (MQ=255) cTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAggg > 5:219500/1‑122 (MQ=255) cTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAggg < 6:219500/122‑1 (MQ=255) cTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTGGATc > 6:115922/1‑149 (MQ=255) ttCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTGGATc > 4:207177/1‑148 (MQ=255) cGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTGGATc < 3:207177/146‑1 (MQ=255) aTCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCa > 4:19076/1‑126 (MQ=255) aTCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCa < 3:19076/126‑1 (MQ=255) gCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTGGATCGACAACGa > 1:62359/1‑148 (MQ=255) cGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTGGATCGACAAc < 5:90091/145‑1 (MQ=255) cGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTGGATCGACAAc < 7:111253/145‑1 (MQ=255) tGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTGGATCGACAACGACAGc < 1:300260/149‑1 (MQ=255) | GCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACATCGCTTCGATCTGCGTGCCTCGGCCAGGCTGACTGGTGATGTCGAGGCTGCCCTGCAGCGCGATTACCCGCTCCTGCATGCCGGCCAGGCCGCGCTGACCGGCCTCGGCCGGGTGCCGGGCAGGGGCGAAACCACGACCATCGTCCTGGATCGACAACGACAGC > NC_002947/2425882‑2426177 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |