New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2457316 = | 87 (1.650) | 5 (0.100) | 5/238 | NT | 6.0% | coding (387/999 nt) | PP_2150 | thiamine biosynthesis lipoprotein |
? | NC_002947 | 2457378 = | 75 (1.520) | coding (449/999 nt) | PP_2150 | thiamine biosynthesis lipoprotein |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATC > NC_002947/2457168‑2457463 | ttcagctcgccagtggcctcggcgacaaaactgctgacacccatggcctgcaggcgcgcagcgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcg < 8:237828‑M1/1‑1 (MQ=255) cTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCAGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAg < 7:102114/149‑1 (MQ=255) cGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGc < 7:135032/147‑1 (MQ=255) gggCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAg > 6:148259/1‑149 (MQ=255) gctcgccagtggcctcggcgacaaaactgctgacacccatggcctgcaggcgcgcagcgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAg < 7:239371‑M1/5‑1 (MQ=255) gCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTg < 8:280643/149‑1 (MQ=255) aGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAg < 1:242978/144‑1 (MQ=255) gTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGccc > 3:263636/1‑148 (MQ=255) ccTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGc < 7:153989/137‑1 (MQ=255) ccTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGc > 8:153989/1‑137 (MQ=255) ccTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAAc < 7:43281/149‑1 (MQ=255) ccTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAAc > 7:194576/1‑149 (MQ=255) gCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCaa > 1:222071/1‑135 (MQ=255) gCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCaa < 2:222071/135‑1 (MQ=255) gCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACca > 8:75947/1‑147 (MQ=255) tctGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAgg > 5:91963/1‑149 (MQ=255) ctGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAgg > 2:334137/1‑148 (MQ=255) gccgccTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCa > 6:306810/1‑148 (MQ=255) cgccTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTg < 3:276993/149‑1 (MQ=255) gccTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTgg < 5:248686/149‑1 (MQ=255) gccTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTgg < 4:263636/149‑1 (MQ=255) tGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTgg > 2:164898/1‑146 (MQ=255) tGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTgg < 1:164898/146‑1 (MQ=255) aTGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGt > 3:110498/1‑149 (MQ=255) gacacccatggcctgcaggcgcgcagcgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgaGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTgcg < 4:179710‑M1/36‑1 (MQ=255) cTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTgcg > 3:100755/1‑149 (MQ=255) tCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGcc < 7:56409/121‑1 (MQ=255) tCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGcc > 8:56409/1‑121 (MQ=255) tCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGt < 7:129008/145‑1 (MQ=255) tCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGt > 8:129008/1‑145 (MQ=255) gcgTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTgcgc > 7:269729/1‑147 (MQ=255) atggcctgcaggcgcgcagcgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGc < 6:51628‑M1/8‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAg < 6:338654/134‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAg > 5:338654/1‑134 (MQ=255) tCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGtgtg < 5:296373/149‑1 (MQ=255) tGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTAc > 3:261243/1‑149 (MQ=255) tGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTAc > 4:310913/1‑149 (MQ=255) aggcgcgcagcgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGc > 2:301069‑M1/98‑105 (MQ=255) aggcgcgcagcgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGc > 4:238577‑M1/98‑105 (MQ=255) aggcgcgcagcgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGc < 1:301069‑M1/8‑1 (MQ=255) aggcgcgcagcgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGc < 3:238577‑M1/8‑1 (MQ=255) ggTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTgg < 5:286113/142‑1 (MQ=255) ggTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTgg > 6:286113/1‑142 (MQ=255) tCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAg > 1:50207/1‑148 (MQ=255) aGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCAc < 6:72383/149‑1 (MQ=255) cgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTgc > 5:253161‑M1/88‑149 (MQ=255) cTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTgc‑‑g > 7:267977/1‑149 (MQ=255) ttGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTgc‑‑gc > 7:89224/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTgc‑‑gc < 4:110498/147‑1 (MQ=255) cGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTc > 2:103989/1‑148 (MQ=255) gAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCa > 1:281574/1‑148 (MQ=255) tcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgaGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCaaa > 3:179710‑M1/80‑149 (MQ=255) aGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCaaa < 3:310913/149‑1 (MQ=255) gagCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTc < 4:261243/149‑1 (MQ=255) gagCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTc > 7:117386/1‑149 (MQ=255) cGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGa < 8:117386/148‑1 (MQ=255) ggCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTgg < 4:127454/115‑1 (MQ=255) gcgcTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCt < 1:103989/148‑1 (MQ=255) gcgcTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCt < 8:194576/148‑1 (MQ=255) ccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGc > 6:344686‑M1/68‑75 (MQ=255) ccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGc < 5:344686‑M1/8‑1 (MQ=255) gcTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCtgtg > 4:317238/1‑149 (MQ=255) gcTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCtgtg < 3:259312/149‑1 (MQ=255) gcTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCtgt > 2:260881/1‑148 (MQ=255) tCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAg > 3:207239/1‑149 (MQ=255) aTCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGAt > 4:226293/1‑149 (MQ=255) ctcACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCaaa < 2:260021/126‑1 (MQ=255) ctcACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCaaa > 1:260021/1‑126 (MQ=255) aCCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGccc < 4:207239/148‑1 (MQ=255) cGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCgg < 2:161560/149‑1 (MQ=255) gTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGt > 3:255233/1‑123 (MQ=255) tAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTg < 4:78659/149‑1 (MQ=255) gtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCaa > 6:272409‑M1/48‑116 (MQ=255) gtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCaa < 5:272409‑M1/69‑1 (MQ=255) gagCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTg > 1:345397/1‑147 (MQ=255) gagCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCa < 4:100755/149‑1 (MQ=255) aTTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGGGAGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCt > 1:116291/1‑149 (MQ=255) tCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTAcc < 4:25647/90‑1 (MQ=255) tCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACtt > 5:358702/1‑148 (MQ=255) tCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACtt > 5:109116/1‑148 (MQ=255) tCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGAACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACtt > 1:318540/1‑148 (MQ=255) gACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCaa < 6:109116/149‑1 (MQ=255) cTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACa < 2:345397/149‑1 (MQ=255) cTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACa < 5:344712/149‑1 (MQ=255) gggCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCAtcg > 2:302307/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCt > 2:120135/1‑106 (MQ=255) gCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCAtcgtc > 7:60397/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCAtcgtc < 1:334137/149‑1 (MQ=255) ggCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCg < 2:50207/148‑1 (MQ=255) gCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGt > 1:344388/1‑149 (MQ=255) cTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACa > 1:225540/1‑132 (MQ=255) cTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACa < 2:225540/132‑1 (MQ=255) tCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATg > 8:79650/1‑149 (MQ=255) aGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATg < 8:267977/147‑1 (MQ=255) cccGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTc < 3:317238/149‑1 (MQ=255) gTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGAc < 8:60397/149‑1 (MQ=255) gAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCa > 8:274169/1‑134 (MQ=255) gAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCa < 7:274169/134‑1 (MQ=255) aGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATc < 3:226293/149‑1 (MQ=255) GCAAGCGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACt > 5:224888‑M1/1‑143 (MQ=255) | CTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGC‑‑GCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATC > NC_002947/2457168‑2457463 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |