New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2734846 | 59 (1.120) | 6 (0.120) | 6/238 | NT | 10.0% | coding (1744/4422 nt) | PP_2394 | leucine‑rich repeat‑containing protein |
? | NC_002947 | = 2734867 | 53 (1.070) | coding (1765/4422 nt) | PP_2394 | leucine‑rich repeat‑containing protein |
AACAGTGGCAATTGCTCCCTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTGCGGCTCGCCGGCAGGATTGGTAC > NC_002947/2734700‑2734991 | aaCAGTGGCAATTGCTCCCTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCt < 4:147646/148‑1 (MQ=255) tGGCAATTGCTCCCTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCggtcgat > 4:300336‑M1/1‑142 (MQ=255) tGGCAATTGCTCCCTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTcgac < 2:242665/147‑1 (MQ=255) gCAATTGCTCCCTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATg > 6:242072/1‑149 (MQ=255) aTTGCTCCCTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCggtcgatctgcg > 6:52256‑M1/1‑137 (MQ=255) tGCTCCCTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATgcg > 2:12822/1‑146 (MQ=255) tCCCTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATgcg > 3:2791/1‑143 (MQ=255) cccTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATc > 4:214832/1‑148 (MQ=255) ccTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGa > 8:166473/1‑149 (MQ=255) ccTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGa > 1:193838/1‑149 (MQ=255) cTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGAc < 1:12822/149‑1 (MQ=255) cTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGAc < 7:166473/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCggt > 4:2791‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCggtcgatctgcgcatcgtcgaggtcgct < 5:52256‑M1/149‑29 (MQ=255) cTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCggtcgatctgcgcatcgtcgaggtcgctga < 3:300336‑M1/149‑31 (MQ=255) cTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTgg < 2:170438/149‑1 (MQ=255) tGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGc < 2:193838/147‑1 (MQ=255) tGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGa > 1:281723/1‑149 (MQ=255) cgccgccgcTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGAt < 2:281723/148‑1 (MQ=255) gccgcTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATg > 6:106326/1‑149 (MQ=255) gccgcTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATg > 5:269134/1‑149 (MQ=255) tCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑Tg > 7:189547/1‑149 (MQ=255) tCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGgat > 4:161569/1‑148 (MQ=255) cacaATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGgatga > 2:180520/1‑149 (MQ=255) aaTGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGgatgat > 5:248291/1‑147 (MQ=255) aaTGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGgat < 6:313955/144‑1 (MQ=255) aaTGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGgat > 5:313955/1‑144 (MQ=255) ggTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCg < 5:106326/149‑1 (MQ=255) gCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCGTCTGCGggc < 6:248291/149‑1 (MQ=255) ggcggcTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGgatgat > 5:294947/1‑131 (MQ=255) ggcggcTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGgatgat < 6:294947/131‑1 (MQ=255) gcggcTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCCTTGGATGATCAGCATCTGCGggcatgg < 1:180520/149‑1 (MQ=255) gcggcTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGggcatgg > 3:164048/1‑148 (MQ=255) gcTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGgcatggcatg > 8:231766/1‑149 (MQ=255) cTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCAtgt < 7:231766/149‑1 (MQ=255) ggtgCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTAt < 3:214832/149‑1 (MQ=255) gtgCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCgg < 3:41707/133‑1 (MQ=255) gtgCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCgg > 4:41707/1‑133 (MQ=255) gCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGc > 8:88619/1‑149 (MQ=255) aaCAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGa > 1:290773/1‑149 (MQ=255) ccgccgAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGAccgccg < 4:164048/149‑1 (MQ=255) gccgAGTGGGGCGACACACGCCTGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCggtcgatctgcgcatcgtcgaggtcgc < 1:339751‑M1/85‑28 (MQ=255) gccgAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCggtcgatctgcgcatcgtcgaggtcgc > 2:339751‑M1/1‑58 (MQ=255) gccgAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGa < 3:161569/149‑1 (MQ=255) gccgAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGa < 5:242072/149‑1 (MQ=255) ccgAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAg > 4:337729/1‑149 (MQ=255) aGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGcc < 6:53046/135‑1 (MQ=255) aGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGcc > 5:53046/1‑135 (MQ=255) gggCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGc < 4:299445/130‑1 (MQ=255) ggCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTgg < 2:268125/79‑1 (MQ=255) cacGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGa > 1:229677/1‑148 (MQ=255) acGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGaca > 8:124136/1‑149 (MQ=255) acGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGaca > 6:183100/1‑149 (MQ=255) acGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGCCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCAtgt < 3:236712/114‑1 (MQ=255) acGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGCCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCAtgt > 4:236712/1‑114 (MQ=255) gttgttCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGc > 7:238263/1‑115 (MQ=255) gttgttCCGCCGACTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGc < 8:238263/115‑1 (MQ=255) gttCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCg > 1:275138/1‑137 (MQ=255) gttCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCg < 2:275138/137‑1 (MQ=255) gccgccTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTg > 4:323709/1‑149 (MQ=255) gccTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTGCgg > 3:38304/1‑149 (MQ=255) ggCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTGCGGCTCGc > 3:103319/1‑149 (MQ=255) ggCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTGCGGCTCGc < 4:103319/149‑1 (MQ=255) aTTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGCCCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGGGTATGGCCGCCCGCCGGAGGCCGCGCAGCTCGCCACCGTCCCGCGCGTGCGGCGCGCGGGCAggt > 4:63674/1‑148 (MQ=255) tCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCggtcgctgaatgacccgcccaggcggcggaacaactggcgtgtgtcgccccactcggcgggctgttcgcaccacagccgccacgcaccggccccattgtgacggagcggcggcgcatag < 3:300336‑M2/149‑120 (MQ=255) cAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTGCGGCTCGCCGGCAGGAtt < 7:124136/148‑1 (MQ=255) cAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTGCGGCTCGCCGGCAGGAtt < 5:183100/148‑1 (MQ=255) aGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCggtcgctgaatgacccgcccaggcggcggaacaactggcgtgtgtcgccccactcggcgggctgttcgcaccacagccgccacgcaccggccccattgtgacggagcggcggcgcatagcc < 5:52256‑M2/149‑122 (MQ=255) aGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTGCGGCTCGCCGGCAGGATTgg < 2:229677/149‑1 (MQ=255) gCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCggtcgctgaatgacccgcccaggcggcggaacaactggcgtgtgtcgccccactcggc > 2:339751‑M2/1‑27 (MQ=255) gCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCggtcgctgaatgacccgcccaggcggcggaacaacaggcgtgtgtcgccccactcggc < 1:339751‑M2/85‑59 (MQ=255) gCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTGCGGCTCGCCGGCAGGATTGGt < 6:269134/149‑1 (MQ=255) aCCggtcgatctgcgcatcgtcgaggtcgctgaatgacccgcccaggcggcggaacaactggcgtgtgtcgccccactcggcgggctgttcgcaccacagccgccacgcaccggccccattgtgacggagcggcggcgcatagccctgg > 4:2791‑M1/1‑3 (MQ=255) | AACAGTGGCAATTGCTCCCTTACCAGGGCTATGCGCCGCCGCTCCGTCACAATGGGGCCGGTGCGTGGCGGCTGTGGTGCGAACAGCCCGCCGAGTGGGGCGACACACGCCAGTTGTTCCGCCGCCTGGGCGGGTCATTCAGCGACCTCGACGATGCGCAGATCGACCGGTCGCTGGCGATTCATGGCC‑TGGATGATCAGCATCTGCGGGCATGGCATGTGTATGGCCGACCGCCGGAGGCCGCGCTGCTCGACACCGTCACGCGCGTGCGGCTCGCCGGCAGGATTGGTAC > NC_002947/2734700‑2734991 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |