New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3667666 | 41 (0.780) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 9.1% | coding (1021/1368 nt) | PP_3231 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3667696 | 41 (0.810) | coding (991/1368 nt) | PP_3231 | hypothetical protein |
ACAACACATGGCGCAGCTCCTTGCGCTGTGGGTCGCGCCAGTCGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCGATATGGGAGTTGTGAGCCCAG > NC_002947/3667519‑3667814 | acaacaCATGGCGCAGCTCCTTGCGCTGTGGGTCGCGCCAGTCGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATcggcg < 8:310943/149‑1 (MQ=255) tGGCGCAGCTCCTTGCGCTGTGGGTCGCGCCAGTCGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCAc < 5:264849/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCCTTGCGCTGTGGGTCGCGCCAGTCGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCt > 2:29452/1‑149 (MQ=255) cgcTGTGGGGCGCGCCAGTAGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGAGAGGAGTAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGGCTGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGACCGCGGCCAGGTGGCcgccgccgat < 6:122417/149‑8 (MQ=255) gcTGTGGGTCGCGCCAGTCGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTg < 1:29452/149‑1 (MQ=255) tgtgGGTCGCGCCAGTCGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCggcggcggc < 8:231061/128‑1 (MQ=255) tgtgGGTCGCGCCAGTCGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCggcggcggc > 7:231061/1‑128 (MQ=255) ggTCGCGCCAGTCGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATg < 1:190930‑M2/149‑2 (MQ=255) tCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCatggccaccgaccgcggccaggtggccgccgccgatgact > 8:125715‑M1/1‑103 (MQ=255) tCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCatggccaccgaccgcggccaggtggccgccgccgatgact < 7:125715‑M1/143‑41 (MQ=255) aggcTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAac > 2:95512/1‑137 (MQ=255) aggcTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAac < 1:95512/137‑1 (MQ=255) tGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCg > 7:83129/1‑148 (MQ=255) aCGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAgc > 5:246738/1‑149 (MQ=255) aCGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAgc > 2:11854/1‑149 (MQ=255) ggAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACcgc < 8:285374/121‑1 (MQ=255) ggAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACcgc > 7:285374/1‑121 (MQ=255) ggAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGc < 6:246738/149‑1 (MQ=255) gAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCt > 5:263913/1‑149 (MQ=255) aTGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTgg < 5:14946/95‑1 (MQ=255) aTGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTgg > 6:14946/1‑95 (MQ=255) aTGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGGCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGa < 5:237845/149‑1 (MQ=255) gCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCGACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGCTCACCACCGCGTCGGGCCCGCAAGCGCTGCGGCGAAGCTGGCCGagg > 8:278123/1‑147 (MQ=255) cTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATg < 2:190930/148‑1 (MQ=255) cTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGt > 1:41405/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGtt < 5:97582/147‑1 (MQ=255) cAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCatggccaccgaccgcggccaggtggccgccgccgatg > 5:159351‑M1/1‑62 (MQ=255) cAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCatggccaccgaccgcggccaggtggccgccgccgatg < 6:159351‑M1/99‑38 (MQ=255) cGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCt < 1:11854/149‑1 (MQ=255) cgcgAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTc < 3:190041/147‑1 (MQ=255) cgAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGc < 2:41405/149‑1 (MQ=255) cgAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGc < 6:263913/149‑1 (MQ=255) gAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGcc > 4:51510/1‑149 (MQ=255) aTTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCt > 7:145974/1‑101 (MQ=255) aTTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCt < 8:145974/101‑1 (MQ=255) tCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGc > 1:139083/1‑149 (MQ=255) cTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTg > 4:126026/1‑149 (MQ=255) cTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCGGCGGCAt > 5:32490/1‑149 (MQ=255) cATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGc > 6:278261/1‑149 (MQ=255) cATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGAAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGc > 5:189855/1‑149 (MQ=255) tGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCg < 5:73620/149‑1 (MQ=255) gCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCGatat > 3:285421/1‑149 (MQ=255) gCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCGatat < 3:51510/149‑1 (MQ=255) cGTGCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCGATATgg < 4:285421/149‑1 (MQ=255) cGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCGATATgg < 3:126026/149‑1 (MQ=255) tCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCGATATGGGa < 8:83129/149‑1 (MQ=255) aGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATgccgatgactgggacggcgacatgcagatcaaggaaatccgaccttcgcgcagcgacagctgggagcatcagttccgcctcgcaggcgtgccagcctgcctga < 7:125715‑M2/143‑104 (MQ=255) aGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATgccgatgactgggacggcgacatgcagatcaaggaaatccgaccttcgcgcagcgacagctgggagcatcagttccgcctcgcaggcgtgccagcctgcctga > 8:125715‑M2/1‑40 (MQ=255) cATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATgccgatgactgggacggcgacatgcagatcaaggaaatccgaccttcgcgcagcgacagctg > 5:159351‑M2/1‑37 (MQ=255) cATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATgccgatgactgggacggcgacatgcagatcaaggaaatccgaccttcgcgcagcgacagctg < 6:159351‑M2/99‑63 (MQ=255) aTCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCGGCGGCATTGCCGATATGGGAGTTGTGa < 6:32490/148‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCGATATGGGa < 6:161165/140‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCGATATGGGa > 5:161165/1‑140 (MQ=255) catggccaccgaccgcggccaggtggccgccgccgatgactgggacggcgacatgcagatcaaggaaatccgaccttcgcgcagcgacagctgggagcatcagttccgcctcgcaggcgtgccagcctgcctgagcgactggcgcgacc < 1:190930‑M1/149‑149 (MQ=255) | ACAACACATGGCGCAGCTCCTTGCGCTGTGGGTCGCGCCAGTCGCTCAGGCAGGCTGGCACGCCTGCGAGGCGGAACTGATGCTCCCAGCTGTCGCTGCGCGAAGGTCGGATTTCCTTGATCTGCATGTCGCCGTCCCAGTCATCGGCGGCGGCCACCTGGCCGCGGTCGGTGGCCATGCCGATCAACACCGCGTCGTGCCCGAAAGCGCTGCGGCAAAGCTGGCCGATGTTGAACTGGCCTTTCCAGCCCATTTCCGTGGCTGCGGCATTGCCGATATGGGAGTTGTGAGCCCAG > NC_002947/3667519‑3667814 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |