New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4095364 | 44 (0.830) | 5 (0.100) | 5/240 | NT | 9.6% | coding (120/765 nt) | PP_3603 | GntR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 4095423 | 53 (1.060) | coding (61/765 nt) | PP_3603 | GntR family transcriptional regulator |
AGCACGAATGTACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGAAGACAGCGCTCATCATAG > NC_002947/4095227‑4095507 | aGCACGAATGTACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGcc > 1:291264/1‑149 (MQ=255) aCCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGc > 6:110165/1‑149 (MQ=255) ccGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGc < 5:110165/148‑1 (MQ=255) ccGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGc < 2:291264/148‑1 (MQ=255) gAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaa > 2:272796‑M1/1‑113 (MQ=255) tACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattc > 2:250067‑M1/1‑106 (MQ=255) tACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTGAGCACCGTGAc < 6:69597/147‑1 (MQ=255) ccTGCCCGGCTGCCTGCAAACGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGACATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCa < 4:67855/147‑1 (MQ=255) cggcggCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTgg > 5:125586/1‑149 (MQ=255) gcCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGc > 6:3728/1‑146 (MQ=255) ccTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGTTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGa < 3:319867/149‑1 (MQ=255) cAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaa < 1:250067‑M1/147‑60 (MQ=255) cgcgAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCTGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgcgcgg > 1:219472‑M2/1‑143 (MQ=255) cgcgAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcgg < 1:272796‑M1/149‑66 (MQ=255) cgcgAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgcgcgg < 4:52580‑M2/149‑7 (MQ=255) gcgAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcggc < 6:241787‑M1/149‑67 (MQ=255) gaTCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGc > 7:198945/1‑132 (MQ=255) gaTCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGc > 7:204314/1‑132 (MQ=255) gaTCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGc < 8:198945/132‑1 (MQ=255) gaTCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGc < 8:204314/132‑1 (MQ=255) tCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGt > 6:295455/1‑149 (MQ=255) caccGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCt < 6:125586/149‑1 (MQ=255) accGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTg < 5:295455/149‑1 (MQ=255) cGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTa < 3:52580/149‑1 (MQ=255) gTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTAc > 1:146434/1‑149 (MQ=255) aCGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTgctgct < 5:3728/148‑1 (MQ=255) ccTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGGACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTa < 8:292181/135‑1 (MQ=255) ccTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTa > 7:292181/1‑135 (MQ=255) ccTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGt > 7:287147/1‑148 (MQ=255) ccTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGt > 6:100593/1‑148 (MQ=255) cGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGc < 1:107408/148‑1 (MQ=255) gCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCt < 5:100593/149‑1 (MQ=255) ccATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTg > 2:167746/1‑149 (MQ=255) cATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTg > 4:42075/1‑148 (MQ=255) aTGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTa < 8:287147/149‑1 (MQ=255) gATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCGAAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTAt > 1:261673/1‑149 (MQ=255) gATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTAtt > 5:287048/1‑149 (MQ=255) tCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACctgctg < 8:200820/127‑1 (MQ=255) tCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACctgctg > 7:200820/1‑127 (MQ=255) cTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCt < 2:91134/116‑1 (MQ=255) cGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTAttt < 2:146434/144‑1 (MQ=255) ttCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTg > 4:329945/1‑148 (MQ=255) cggtcggCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGa < 3:329945/148‑1 (MQ=255) gCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTc > 2:253375/1‑119 (MQ=255) gCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAAACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTc < 1:253375/119‑1 (MQ=255) cTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGAAGACAGCGCt > 3:200204/1‑148 (MQ=255) gTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGAAGACAGCGCtca < 1:167746/147‑1 (MQ=255) tCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACctgct < 8:296974/103‑1 (MQ=255) gccgcGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcagatcatggccgaagagggcgtcagtcgcacggtggtgcgtgaggcgatctcgc < 6:241787‑M2/149‑84 (MQ=255) gccgcGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGc < 6:235749/90‑1 (MQ=255) gccgcGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGc > 5:235749/1‑90 (MQ=255) ccgcGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcagatcatggccgaagagggcgtcagtcgcacggtggtgcgtgaggcgatctcgcg < 4:52580‑M1/149‑144 (MQ=255) ccgcGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcggcgacaagctgccgacagaatcgcagatcatggccgaagagggcgtcagtcgcacggtggtgcgtgaggcgatctcgcg > 1:219472‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgcGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcagatcatggccgaagagggcgtcagtcgcacggtggtgcgtgaggcgatctcgcg < 1:272796‑M2/149‑85 (MQ=255) ccgcGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCAATGCCCTg < 2:132300/117‑1 (MQ=255) | AGCACGAATGTACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCACCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTGCG‑AATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGAAGACAGCGCTCATCATAG > NC_002947/4095227‑4095507 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |