New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4142506 | 45 (0.850) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 8.0% | coding (639/1482 nt) | PP_3646 | aldehyde dehydrogenase family protein |
? | NC_002947 | = 4142532 | 49 (0.970) | coding (665/1482 nt) | PP_3646 | aldehyde dehydrogenase family protein |
CCTTGGCTGCCGGCAACACCATCGTGCTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGTCGCCGAACATCATCTT > NC_002947/4142367‑4142652 | ccTTGGCTGCCGGCAACACCATCGTGCTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACcggcgcggcg > 5:233439/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGCAACACCATCGTGCTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCagcgggtggcgggt > 1:7134‑M1/1‑134 (MQ=255) gCAACACCATCGTGCTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCAc > 4:74762/1‑149 (MQ=255) acCATCGTGCTCAAACCGTCCGAGCAGGCCTCGGCAACCATCCTCGATCTGGCGCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCGGGTGTGGTCAACGTGGTCAGCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCt < 1:199872/149‑1 (MQ=255) acCATCGTGCTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTAGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACTGCCACAGCACAGGCGCGGCGCTGACA‑CGACACCCGCt > 2:74309/1‑149 (MQ=255) cATCGTGCTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGc < 4:316242/139‑1 (MQ=255) cATCGTGCTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGc > 3:316242/1‑139 (MQ=255) cATCCTGCTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTgg > 2:314202‑M2/1‑147 (MQ=255) cTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCagcgggtggcgggtcagcgccgcgccggtgctgg < 2:7134‑M1/148‑35 (MQ=255) tCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTgcgc > 4:27060/1‑146 (MQ=255) aCCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCg > 3:109393/1‑149 (MQ=255) ccGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGc < 3:74762/149‑1 (MQ=255) gTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCt > 3:148359/1‑149 (MQ=255) gAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCAc > 8:59417/1‑149 (MQ=255) gCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACcggcgg > 5:345573/1‑149 (MQ=255) gCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACcggcgg > 7:133403/1‑149 (MQ=255) gCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACcggcgg < 4:109393/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCagcgggtggcgggtcagcgccgcgccggtgct > 2:95821‑M1/1‑95 (MQ=255) ccTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCagcgggtggcgggtcagcgccgcgccggtgct < 1:95821‑M1/127‑33 (MQ=255) ccTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGt < 6:233439/149‑1 (MQ=255) ccATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCAcc > 6:56866/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACgcagca < 3:240360/148‑1 (MQ=255) gCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACgcag > 4:240360/1‑146 (MQ=255) cTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAgcgc < 1:74309/149‑1 (MQ=255) ccGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAAc < 7:59417/149‑1 (MQ=255) gCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTc < 4:148359/149‑1 (MQ=255) ttCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGTCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACgcag > 3:324114/1‑131 (MQ=255) ttCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGTCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACgcag < 4:324114/131‑1 (MQ=255) ccggccggTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCaa > 8:290612/1‑149 (MQ=255) cggccggTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACg < 6:199017/124‑1 (MQ=255) cggccggTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACg > 5:199017/1‑124 (MQ=255) cggccggTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAg < 7:290612/149‑1 (MQ=255) ggccggTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGc < 5:56866/149‑1 (MQ=255) gccggTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCt > 4:20961/1‑149 (MQ=255) ccggTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTg < 6:345573/149‑1 (MQ=255) gtgGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCt < 3:27060/149‑1 (MQ=255) aaCGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCCCCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCCGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACt > 8:244796/1‑149 (MQ=255) aaCGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACt < 8:133403/149‑1 (MQ=255) cGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTg > 1:152875/1‑142 (MQ=255) cGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTg < 2:152875/142‑1 (MQ=255) tCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGggcgg > 5:37518/1‑148 (MQ=255) cGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGt > 7:71088/1‑149 (MQ=255) gCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACCGCGCCACCCGATGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGTc > 1:213223/1‑149 (MQ=255) gCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTGCGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGggcg < 4:274821/141‑1 (MQ=255) gCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTGCGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGggcg > 3:274821/1‑141 (MQ=255) cGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGTCGcc < 8:257233/147‑1 (MQ=255) ccccAGCACCGGCGCGGCCCTGACC‑CGCCCCCCGCTGGTGCGCAAGATAGCCTTACCCCGCGGTTCCCCCCCCCCCCGCCACCTGGTACCCCGCACCCCCCAAAACATAGCCAAGCAGTGCCGGGAACAGGGCCGCAAATCGCCGAAc > 2:152207/1‑148 (MQ=255) cccAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGTCGCCTAAcat < 6:37518/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTggtgctggggccgtagccggtgaccacgttgaccacaccggccgggaagccggcctcaagggccagtcgggccagctcgaggatggttgccgaggcgtgctcggacggtttgag < 2:7134‑M2/148‑115 (MQ=255) ccAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGGTCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGTCGCCGAAcat > 1:73531/1‑148 (MQ=255) ccAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGTCGCCGAAcatc < 1:152207/149‑1 (MQ=255) aGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTggtgctggggccgtagccggtgaccacgttgaccacaccggccgggaagccggcctcaagggccagtcgggccagctcgaggatggttgccgagg > 2:95821‑M2/1‑32 (MQ=255) aGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTggtgctggggccgtagccggtgaccacgttgaccacaccggccgggaagccggcctcaagggccagtcgggccagctcgaggatggttgccgagg < 1:95821‑M2/127‑96 (MQ=255) aCCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGTCGCCGAACATCATCtt < 8:71088/149‑1 (MQ=255) aCCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGTCGCCGAACATCATCtt > 1:184117/1‑149 (MQ=255) ccagcgggtggcgggtcagcgccgcgccggtgctggggccgtagccggtgaccacgttgaccacaccggccgggaagccggcctcaagggccagtcgggccagctcgaggatggttgccgaggcgtgctcggacggtttgagcaggatg > 2:314202‑M1/1‑2 (MQ=255) ccGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCaa > 8:300732/1‑130 (MQ=255) ccGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCaa < 7:300732/130‑1 (MQ=255) | CCTTGGCTGCCGGCAACACCATCGTGCTCAAACCGTCCGAGCACGCCTCGGCAACCATCCTCGAGCTGGCCCGACTGGCCCTTGAGGCCGGCTTCCCGGCCGGTGTGGTCAACGTGGTCACCGGCTACGGCCCCAGCACCGGCGCGGCGCTGACC‑CGCCACCCGCTGGTGCGCAAGATCGCCTTCACCGGCGGTGCCGCCACCGCCCGCCACGTGGTACGCAGCAGCGCCGAAAACTTCGCCAAGCTGTCGCTGGAACTGGGCGGCAAGTCGCCGAACATCATCTT > NC_002947/4142367‑4142652 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |