| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5533581 | 56 (1.060) | 4 (0.080) | 3/234 | NT | 7.2% | coding (894/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 5533633 | 51 (1.050) | coding (842/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
TTCTCACCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAC > NC_002947/5533435‑5533728 | ttctCACCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGc > 3:339849/1‑149 (MQ=255)ttctCACCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGc > 3:334636/1‑149 (MQ=255) tcACCCATGACGGTCTCCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCtt > 5:73352/1‑149 (MQ=255) aCCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTTCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCt < 4:339849/146‑1 (MQ=255) aCCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑TGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGc < 2:19396/149‑1 (MQ=255) aCCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCt < 4:334636/146‑1 (MQ=255) ccATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGTCTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCg < 1:87077/149‑1 (MQ=255) ccATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGc < 8:216852/147‑1 (MQ=255) ccATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCgg < 6:104952/149‑1 (MQ=255) ccATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCga > 7:216852/1‑148 (MQ=255) ccATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCg > 6:10486/1‑148 (MQ=255) ccATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCg > 7:323508/1‑148 (MQ=255) ccATGACGGTCTGCAACGGGTGGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCgg < 6:304187/149‑1 (MQ=255) aCGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAActc < 4:8984/149‑1 (MQ=255) ggTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAActcct > 2:229920/1‑149 (MQ=255) gTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAActcctc < 8:323508/149‑1 (MQ=255) gTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAActcctc < 6:308283/149‑1 (MQ=255) tCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACtcctcc < 5:286922/149‑1 (MQ=255) cGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCg < 1:229920/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTg < 5:51277/148‑1 (MQ=255) ccTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCt > 6:62988/1‑148 (MQ=255) ccTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCt < 5:62988/148‑1 (MQ=255) ccTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTg > 7:294556/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTg > 6:331389/1‑149 (MQ=255) gCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAAGTCCTCCTCCAGCGCCTTGCTGTCTGgc < 6:73352/149‑1 (MQ=255) ccACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCGTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCGGTCTgg > 2:273646/1‑147 (MQ=255) ccACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCCACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggag > 1:197403‑M1/1‑109 (MQ=255) tCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCgg < 4:263133/143‑1 (MQ=255) tCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCgg > 3:263133/1‑143 (MQ=255) cccTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcacc < 2:197403‑M1/149‑60 (MQ=255) cTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTccac < 6:291992/108‑1 (MQ=255) cTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTccac > 5:291992/1‑108 (MQ=255) gTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTc > 5:283127‑M2/1‑137 (MQ=255) gTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTc < 6:283127‑M2/138‑2 (MQ=255) gACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCAt < 4:292782/149‑1 (MQ=255) aCTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATg < 8:294556/149‑1 (MQ=255) aCTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATg > 4:256718/1‑149 (MQ=255) ttCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTa > 3:193974/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTa > 8:58270/1‑148 (MQ=255) gcgcCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTc < 2:233789/141‑1 (MQ=255) gcgcCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGACTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTc > 1:233789/1‑141 (MQ=255) gcCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGc > 1:51534/1‑149 (MQ=255) cATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcacc > 6:24179‑M1/1‑71 (MQ=255) cATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcacc < 5:24179‑M1/130‑60 (MQ=255) cATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCg > 2:290623/1‑149 (MQ=255) aTTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGt > 5:168751/1‑149 (MQ=255) ttGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTc < 7:58270/149‑1 (MQ=255) tGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCgg > 6:341134/1‑118 (MQ=255) aaaGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGt > 2:281975/1‑136 (MQ=255) aaaGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGt < 1:281975/136‑1 (MQ=255) aaaGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCaa < 4:153561/148‑1 (MQ=255) gCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTcggcac < 1:151808‑M2/118‑7 (MQ=255) gCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTcggcac > 2:151808‑M2/1‑112 (MQ=255) ccAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTgcgcg > 1:81121/1‑149 (MQ=255) agagCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGcgcc > 6:212808/1‑149 (MQ=255) gCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCgccgcc > 3:166423/1‑149 (MQ=255) cAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCcggc < 2:81121/147‑1 (MQ=255) aaGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGac < 5:212808/149‑1 (MQ=255) aaGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGa > 5:8947/1‑148 (MQ=255) gCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGacac < 4:166423/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCa < 6:168751/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCa < 2:51534/149‑1 (MQ=255) tAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAg > 8:78731/1‑149 (MQ=255) cAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCgg < 1:290623/149‑1 (MQ=255) ggTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTgcgc > 6:140518/1‑117 (MQ=255) gtgtAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCa > 4:251474/1‑136 (MQ=255) gtgtAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGAc < 7:78731/149‑1 (MQ=255) cGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGa < 4:193974/148‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaaggg < 2:197403‑M2/149‑91 (MQ=255) ggTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatg > 6:24179‑M2/1‑59 (MQ=255) ggTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatg < 5:24179‑M2/130‑72 (MQ=255) ggTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACa > 2:87683/1‑149 (MQ=255) gTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgc < 1:151808‑M1/118‑113 (MQ=255) gTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgc > 2:151808‑M1/1‑6 (MQ=255) tGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATg < 3:256718/149‑1 (MQ=255) cGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGTGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAc > 4:124127/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAc > 5:169696/1‑149 (MQ=255) gacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaac < 6:283127‑M1/138‑138 (MQ=255) gacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaac > 5:283127‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTCTCACCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAG‑CGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAC > NC_002947/5533435‑5533728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |