New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5630781 = | 49 (0.930) | 5 (0.100) | 4/244 | NT | 9.5% | coding (311/3954 nt) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5630838 = | 48 (0.950) | coding (368/3954 nt) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
GTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGCCGGTATCGTCCAGGGCCTG > NC_002947/5630634‑5630917 | cgcagcagggcttcggccaggcacatcagcgccacgccttcctgagacgacagcgagaattcctgcagcaggccctggacgataccggcacggccgccgacgcttttctggttgcgcagtttttcggcaatgcttgcggccagcttgtt > 7:14366‑M1/149‑149 (MQ=255) gcagcagggcttcggccaggcacatcagcgccacgccttcctgagacgacagcgagaattcctgcagcaggccctggacgataccggcacggccgccgacgcttttctggttgcgcagtttttcggcaatgcttgcggccagcttgttg > 5:232297‑M1/148‑149 (MQ=255) gcagcagggcttcggccaggcacatcagcgccacgccttcctgagacgacagcgagaattcctgcagcaggccctggacgataccggcacggccgccgacgcttttctggttgcgcagtttttcggcaatgcttgcggccagcttgttg < 5:131434‑M1/2‑1 (MQ=255) gcagggcttcggccaggcacatcagcgccacgccttcctgagacgacagcgagaattcctgcagcaggccctggacgataccggcacggccgccgacgcttttctggttgcgcagtttttcggcaatgcttgcggccagcttgtTGGTg < 1:131962‑M1/5‑1 (MQ=255) aCCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGAtgctg < 6:338322/149‑1 (MQ=255) ggCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGAtgc < 8:81136/143‑1 (MQ=255) ggCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGAtgc > 7:81136/1‑143 (MQ=255) gacgaTGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTCCTTCATCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTCCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAg > 7:16081/1‑147 (MQ=255) ccGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGgcgcgc < 6:14909/149‑1 (MQ=255) ggTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGCTAGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGcc < 1:233404/149‑1 (MQ=255) aaGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTgg > 2:129846/1‑132 (MQ=255) aaGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTgg < 1:129846/132‑1 (MQ=255) cAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGcgcc > 6:113987/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGcgcc > 3:290794/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGcgcc > 2:102146/1‑149 (MQ=255) cGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTgg < 5:113987/149‑1 (MQ=255) aCCACAGCCACCAGTTCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGAATCTTGCCGCTGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCGCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCGTGAGCGCGCCGCTGGcc < 8:16081/149‑1 (MQ=255) caGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACcaa > 6:130371/1‑149 (MQ=255) cctgcagcaggccctggacgataccggcacggccgccgacgcttttctggttgcgcagtttttcggcaatgcttgcggccagcttgtTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACcaacaa > 1:309174‑M1/88‑148 (MQ=255) ctgcagcaggccctggacgataccggcacggccgccgacgcttttctggttgcgcagtttttcggcaatgcttgcggccagcttgtTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACcaacaa < 6:2640‑M1/61‑1 (MQ=255) ctgcagcaggccctggacgataccggcacggccgccgacgcttttctggttgcgcagtttttcggcaatgcttgcggccagcttgtTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACcaacaa > 5:2640‑M1/87‑147 (MQ=255) cTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGgcgcgc < 7:11767/111‑1 (MQ=255) tCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGcc > 2:174606/1‑149 (MQ=255) tCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGcc > 2:174159/1‑149 (MQ=255) aTTTGCCGACAGCATCTTGCCGTAGTCGGTACTGCGCTGGTCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGCAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCaa < 7:320221/149‑1 (MQ=255) ccGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCAtt < 1:174159/149‑1 (MQ=255) gagaGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGc > 8:145691/1‑149 (MQ=255) cATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGaa > 7:78336/1‑148 (MQ=255) aTCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTgg > 6:297736/1‑109 (MQ=255) aTCATGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTgg < 5:297736/109‑1 (MQ=255) ccGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGAGGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTgcg > 5:304561/1‑149 (MQ=255) ccGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTgc < 3:152787/148‑1 (MQ=255) aGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACGAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAAc < 5:130371/149‑1 (MQ=255) aGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAAc < 7:145691/149‑1 (MQ=255) ggTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAg > 6:127830/1‑148 (MQ=255) gTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGa > 3:22775/1‑148 (MQ=255) tGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGaaa > 6:325945/1‑129 (MQ=255) tGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGaaa < 5:325945/129‑1 (MQ=255) gcTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGt < 5:352338/148‑1 (MQ=255) gcTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGt > 6:352338/1‑148 (MQ=255) gATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGcc > 2:347610/1‑149 (MQ=255) aTCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCg > 8:246082/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGc < 1:347610/149‑1 (MQ=255) ccgccgCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGt > 2:328347/1‑136 (MQ=255) ccgccgCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGt < 1:328347/136‑1 (MQ=255) ccgccgCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGcc > 4:232964/1‑149 (MQ=255) agtttttcggcaatgcttgcggccagcttgtTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACcaac > 4:175860‑M1/32‑90 (MQ=255) agtttttcggcaatgcttgcggccagcttgtTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACcaac < 3:175860‑M1/59‑1 (MQ=255) gccTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGCCGGTAt < 5:127830/149‑1 (MQ=255) tACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGCCgg < 1:171098/143‑1 (MQ=255) tACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGCCgg > 2:171098/1‑143 (MQ=255) ccgccgCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGCCGGTATCGTc > 3:315047/1‑148 (MQ=255) ccgccCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCTCCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCATGCCGGTATCGTCCAgg > 2:169159/1‑149 (MQ=255) ccgccCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGCCGGTATCGTCCAgg < 8:78336/149‑1 (MQ=255) ccGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGCCGGTATCGTCCAGGGCctg > 7:43339/1‑149 (MQ=255) ccGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGCCGGTATCGTCCAGGGCctg < 1:102146/149‑1 (MQ=255) gC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGcc < 6:146492/127‑1 (MQ=255) gC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGcc > 5:146492/1‑127 (MQ=255) | GTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTACCGCCGCCCCGAGC‑AGGAAGTGGTGCCGATGCTGCTGGAGCAGGCGCGCCTGAGCGCGCCGCTGGCCGACGCCACCAACAAGCTGGCCGCAAGCATTGCCGAAAAACTGCGCAACCAGAAAAGCGTCGGCGGCCGTGCCGGTATCGTCCAGGGCCTG > NC_002947/5630634‑5630917 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |