New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5654720 = | 47 (0.890) | 4 (0.080) | 3/246 | NT | 7.1% | coding (826/1059 nt) | epd | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5654765 = | 59 (1.150) | coding (781/1059 nt) | epd | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
GTCGAACCAGGCCAGCAGGTTTACCAGGCGGGGGCCGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTCGCCCGGCAAGTTCCGGAAGCAGGC > NC_002947/5654574‑5654866 | gTCGAACCAGGCCAGCAGGTTTACCAGGCGGGGGCCGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTc > 5:181390/1‑147 (MQ=255) cGAACCAGGCCAGCAGGTTTACCAGGCGGGGGCCGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAgc > 4:15708/1‑149 (MQ=255) aGGCCAGCAGGTTTACCAGGCGGGGGGCGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGcc < 5:150428/149‑1 (MQ=255) cagGTTTACCAGGCGGGGGCCGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCgca < 6:227777/149‑1 (MQ=255) aGGCGGGGGCCGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑tt < 3:279437/149‑1 (MQ=255) gCGGGGGCCGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGa < 4:29247/149‑1 (MQ=255) cGGGGGCCGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGAc < 4:310530/149‑1 (MQ=255) ccGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGc < 3:15708/149‑1 (MQ=255) cGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGcc > 3:322150/1‑149 (MQ=255) agcgcctgcttccggaacttgccgggcgaatccaggccaaagcggtacgtgtaccgaccgtcaacgtctcgtacctggacatcaccctgcagactgcccgcgacaCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTg > 4:179955‑M1/106‑149 (MQ=255) gcctgcttccggaacttgccgggcgaatccaggccaaagcggtacgtgtaccgaccgtcaacgtctcgtgcctggacatcaccctgcagactgcccgcgacaCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGgtg > 5:78580‑M1/103‑149 (MQ=255) ctgcttccggaacttgccgggcgaatccaggccaaagcggtacgtgtaccgaccgtcaacgtctcgtgcctggacatcaccctgcagactgcccgcgacaCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTg > 6:69498‑M1/101‑144 (MQ=255) ctgcttccggaacttgccgggcgaatccaggccaaagcggtacgtgtaccgaccgtcaacgtctcgtgcctggacatcaccctgcagactgcccgcgacaCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTg < 5:69498‑M1/44‑1 (MQ=255) gctggcATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCggg > 8:265500/1‑149 (MQ=255) cATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTg < 8:62402/134‑1 (MQ=255) aTCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCt > 2:28936/1‑149 (MQ=255) cgacgaTCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCAG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTg > 8:299333/1‑148 (MQ=255) gacgaTCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCa < 4:322150/149‑1 (MQ=255) acgaTCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGGTTTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCa < 1:237300/149‑1 (MQ=255) acgaTCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAg > 7:155866/1‑149 (MQ=255) gaTCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAggg > 4:213699/1‑149 (MQ=255) gaTCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAggg > 4:165801/1‑149 (MQ=255) gCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGAt < 7:265500/149‑1 (MQ=255) aaTGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTcc < 8:155866/149‑1 (MQ=255) tgtgGGTCATGGTTGAAATGACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCt < 2:17574/133‑1 (MQ=255) tgtgGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAg > 4:188695/1‑149 (MQ=255) tgtgGGTCATGCTTGAAATCACACCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTAGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGACGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCt > 1:17574/1‑133 (MQ=255) ggTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGACGTCCAGGCAc < 3:213699/149‑1 (MQ=255) tCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCgg > 6:313582/1‑120 (MQ=255) tCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCgg < 5:313582/120‑1 (MQ=255) tCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCa > 7:252498/1‑142 (MQ=255) tCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCa < 8:252498/142‑1 (MQ=255) aTGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACgaga < 3:188695/149‑1 (MQ=255) gAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTGTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTg < 1:28936/148‑1 (MQ=255) aaaTCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGAc < 7:183372/149‑1 (MQ=255) tCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGAcggt > 3:299340/1‑149 (MQ=255) gggTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTATGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCATCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGGAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCActa < 2:221990/126‑3 (MQ=255) gCGTGAGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTAAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTAGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGAGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACga > 1:221990/1‑128 (MQ=255) gagCGGCATCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTAAAGCGGACCATCAAGCGCAGCGTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATTGCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTacac < 1:335311/144‑1 (MQ=255) aGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCttt > 8:241760/1‑149 (MQ=255) ggTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGc < 7:106936/147‑1 (MQ=255) tgtAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTgg < 7:241760/149‑1 (MQ=255) aGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTc > 6:339158/1‑149 (MQ=255) ccAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTCGc > 4:111354/1‑149 (MQ=255) cAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTCGcc > 6:172376/1‑149 (MQ=255) cAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCC‑CACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTCGccc > 8:305693/1‑149 (MQ=255) cAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCC‑CACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTCGccc < 7:305693/149‑1 (MQ=255) aaGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTCGCCCgg > 3:21396/1‑148 (MQ=255) tttAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACGTGTACCg > 5:141120/1‑122 (MQ=255) tttAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACGTGTACCg < 6:141120/122‑1 (MQ=255) aaGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTCGCCCGGCAAGTTCCg > 7:264284/1‑149 (MQ=255) gCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCttt < 4:332434/121‑1 (MQ=255) gCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCttt > 3:332434/1‑121 (MQ=255) cTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGc > 2:177038/1‑81 (MQ=255) cTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGc < 1:177038/81‑1 (MQ=255) ttCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTCGCCCGGCAAGTTCCGGAAGCAGgc > 2:60937/1‑149 (MQ=255) | GTCGAACCAGGCCAGCAGGTTTACCAGGCGGGGGCCGGAAACACGCGTCTGGCTGGCATCGACGATCGCCGAATGTGGGTCATGGTTGAAATCACAGCTGGCGTGCGGCAGCTCGGTGTAAGCCAGCAAGCCTTTAAGCGGACCTTCCAGCGCAGCCTCGCGCAGCACTCGG‑TTGACTTCGGCCGCACTGGTGTCGCGGGCAGTCTGCAGGGTGATGTCCAGGCACGAGACGTTGACGGTCGGTACACGTACCGCTTTGGCCTGGATTCGCCCGGCAAGTTCCGGAAGCAGGC > NC_002947/5654574‑5654866 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |