| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 28428 = | 39 (0.740) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 7.5% | coding (1120/1698 nt) | PP_0024 | membrane‑associated metal‑dependent hydrolase |
| ? | NC_002947 | 28458 = | 37 (0.730) | coding (1090/1698 nt) | PP_0024 | membrane‑associated metal‑dependent hydrolase | |||||
TGAATTGCGAGGGGTAGCGCTTGTAGTAGGCCGGGCCGTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTTCTCGGCTCTTGGCCAAGC > NC_002947/28314‑28604 | tgcttcaacgcgctggcatcagtgtcatgtggactgacaacaactcggggtgcaaaggggtctgcgacagggttcccaaccacaaggctgcctctcacgcggattcccaactgtGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGt > 6:147925‑M1/115‑149 (MQ=255) aaTTGCGAGGGGTAGCGCTTGTAGTAGGCCGGGCCGTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGtt < 8:14867/148‑1 (MQ=255) aTTGCGAGGGGTAGCGCTTGTAGTAGGCCGGGCCGTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTgg < 6:177044/149‑1 (MQ=255) gTAGCGCTTGTAGTAGGCCGGGCCGTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGt < 6:38230/149‑1 (MQ=255) ttGTAGTAGGCCGGGCCGTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAgg > 1:26946/1‑148 (MQ=255) ttGTAGTAGGACGGGCCGTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAgg > 2:94021/1‑148 (MQ=255) gtagGCCGGGCCGTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCt > 3:72928/1‑149 (MQ=255) ggccgggccgTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGt > 1:273436/1‑134 (MQ=255) ggccgggccgTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGt < 2:273436/134‑1 (MQ=255) gccgggccgTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTtg < 3:338767/147‑1 (MQ=255) gacgggccgTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTtg > 4:338767/3‑147 (MQ=255) gggccgTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGtt < 1:94021/149‑1 (MQ=255) tGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTg > 3:172994/1‑149 (MQ=255) gggtgcaaaggggtctgcgacagggttcccaaccacaaggctgcctctcacgcggattcccaactgtGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTgg > 2:39860‑M1/68‑105 (MQ=255) gggtgcaaaggggtctgcgacagggttcccaaccacaaggctgcctctcacgcggattcccaactgtGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTgg < 1:39860‑M1/38‑1 (MQ=255) gAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTtg > 4:314671/1‑121 (MQ=255) gAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTtg < 3:314671/121‑1 (MQ=255) gCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTg > 5:158549/1‑149 (MQ=255) gCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTg < 7:19720/149‑1 (MQ=255) cAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGa > 4:248532/1‑137 (MQ=255) cAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGa < 3:248532/137‑1 (MQ=255) cGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGttgttg > 4:287067/1‑149 (MQ=255) cTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTCTCGCAGCCCACATAGCACCCCGAGTtgttgt > 8:323992/1‑147 (MQ=255) cTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTcc < 2:26946/149‑1 (MQ=255) ggCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCa < 1:38955/115‑1 (MQ=255) ggCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCa > 2:38955/1‑115 (MQ=255) gcgcTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCcac < 6:158549/148‑1 (MQ=255) cgcTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACAt < 4:72928/149‑1 (MQ=255) atgaAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCACTTTGCCCCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACt > 8:6993/1‑149 (MQ=255) tgaAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCAGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACt > 1:74634/1‑148 (MQ=255) gaAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGTCACTGa > 7:166236/1‑149 (MQ=255) gaAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGa > 6:154913/1‑149 (MQ=255) aGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGAt < 3:287067/148‑1 (MQ=255) ccaactgtgcaccagcgaggagtgtaaggacggggtgcACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCAccc < 1:39860‑M2/67‑1 (MQ=255) ccaactgtgcaccagcgaggagtgtaaggacggggtgcACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCAccc > 2:39860‑M2/39‑105 (MQ=255) gTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAg < 5:154913/149‑1 (MQ=255) actgtgcaccagcgaggagtgtaaggacggggtgcACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCa > 6:147925‑M2/36‑149 (MQ=255) agcaCCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTc > 6:168729/1‑149 (MQ=255) GCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTc < 2:50399‑M1/148‑1 (MQ=255) ttACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTCGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTtc > 2:185419/1‑149 (MQ=255) acTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTTCTCgg < 1:50399/149‑1 (MQ=255) tcctcGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGag > 2:279964/1‑134 (MQ=255) tcctcGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGag < 1:279964/134‑1 (MQ=255) tcctcGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTTCTCGGc > 7:162090/1‑148 (MQ=255) gCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGTCACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTTCTCGGCTCtt < 8:166236/147‑1 (MQ=255) gCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTTCTCGGCTCTTgg > 5:30216/1‑149 (MQ=255) gcACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTTCTCGGCTCTTGGCCAAGc > 4:22580‑M2/3‑149 (MQ=255) gcACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTTCTCGGCTCTTGGCCAAGc > 7:1618‑M2/3‑149 (MQ=255) cACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTTCTCGGCTCTTGGCCAAGc < 8:162090‑M2/147‑1 (MQ=255) cACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTCGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGATCAGCCCTTCTCGGCTCTTGGCCAAGc < 1:185419‑M2/147‑1 (MQ=255) acaGTTGGGTTTCGGCGTGAGATGCATCCTTGTTGTTGGGATCCCTGTCGCAGAGCCGTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCTCTTTGAAg < 7:225483/112‑1 (MQ=255) acaGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCACGAGTTGTAGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAg > 8:225483/1‑112 (MQ=255) | TGAATTGCGAGGGGTAGCGCTTGTAGTAGGCCGGGCCGTGACTGCCTTTGTAGTGGAGCACCAGGACAGCATCGCCTTCCTGGCGCTTGATGAAGTCTTGCATCTCCGTGAGCAGCACCCCGTCCTTACACTCCTCGCTGGTGCACAGTTGGGAATCCGCGTGAGAGGCAGCCTTGTGGTTGGGAACCCTGTCGCAGACCCCTTTGCACCCCGAGTTGTTGTCAGTCCACATGACACTGATGCCAGCGCGTTGAAGCACGTCGAGCAGCCCTTCTCGGCTCTTGGCCAAGC > NC_002947/28314‑28604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |