| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 319049 = | 56 (1.060) | 3 (0.060) | 3/238 | NT | 5.4% | coding (693/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | 319095 = | 53 (1.070) | coding (647/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase | |||||
CTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCACGGCCGC > NC_002947/318956‑319240 | cTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCcgc > 5:56537/1‑148 (MQ=255) ttGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCcgcg > 3:150582/1‑148 (MQ=255) gATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGaa < 6:334097/148‑1 (MQ=255) gcgGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGTGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAgg < 8:66532/148‑1 (MQ=255) tGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCAc > 7:114006/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCAtt < 8:114006/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATtg > 6:232089/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCa < 4:276245/144‑1 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCa > 3:276245/1‑144 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATtgt < 4:150582/148‑1 (MQ=255) aGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCTAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGa < 1:9639/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGa > 8:60269/1‑149 (MQ=255) gCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATc > 6:60111/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCg < 7:60269/149‑1 (MQ=255) ggTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGc < 5:60111/149‑1 (MQ=255) ccgacctaaCCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAg < 1:234188/141‑1 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAg < 7:259709/149‑1 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAg > 1:19691/1‑148 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAg < 2:19691/148‑1 (MQ=255) aaCCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCcgc > 3:306718/1‑106 (MQ=255) aaCCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCcgc < 4:306718/106‑1 (MQ=255) aaCCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAgct < 5:315058/149‑1 (MQ=255) aCCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAg > 2:234188/1‑140 (MQ=255) aCCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAgct < 7:130914/148‑1 (MQ=255) cAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGt < 7:308159/135‑1 (MQ=255) cAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGt > 8:308159/1‑135 (MQ=255) cTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCg > 3:143739/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGc > 6:168005/1‑149 (MQ=255) ccTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGccc < 4:143739/149‑1 (MQ=255) ggCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCAtt < 6:81708/98‑1 (MQ=255) ggCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCAtt > 5:81708/1‑98 (MQ=255) ggCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTctg < 5:82036/124‑3 (MQ=255) ggCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCgg > 6:82036/1‑124 (MQ=255) ggCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGCCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCg > 1:46826/1‑147 (MQ=255) ggCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGCCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCg < 2:46826/147‑1 (MQ=255) gATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGt > 4:252076/1‑149 (MQ=255) cGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCa > 2:175437/1‑72 (MQ=255) gatgatGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTc > 4:239563/1‑144 (MQ=255) gatgatGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTc > 7:193437/1‑144 (MQ=255) gatgGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGa > 8:221577/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACtt > 7:162793/1‑149 (MQ=255) ctggcgcttccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTg > 8:117036‑M2/47‑148 (MQ=255) ctggcgcttccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTg < 7:117036‑M2/102‑1 (MQ=255) tggcgcttccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTATGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGac > 4:64906‑M2/46‑149 (MQ=255) GCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAgg < 7:224784‑M1/118‑1 (MQ=255) GCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAgg > 8:224784‑M1/1‑118 (MQ=255) CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGacc < 2:255552‑M1/147‑1 (MQ=255) CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGacc > 1:255552‑M1/1‑147 (MQ=255) GCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGcc > 2:20405‑M1/1‑109 (MQ=255) GCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGcc < 1:20405‑M1/109‑1 (MQ=255) gTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGc < 8:162793/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCgaga < 1:200147/123‑1 (MQ=255) gTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCgaga > 2:200147/1‑123 (MQ=255) tCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGccc < 6:351285/98‑1 (MQ=255) tCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGccc > 5:351285/1‑98 (MQ=255) cAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCcgacga > 2:157763/1‑149 (MQ=255) gCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCcg < 7:61433/143‑1 (MQ=255) gCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCcg > 8:61433/1‑143 (MQ=255) tGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGc > 6:344960/1‑149 (MQ=255) tGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGc < 5:168005/149‑1 (MQ=255) gCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTc > 7:179416/1‑149 (MQ=255) gCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTc < 5:344960/149‑1 (MQ=255) ggAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTcgcg > 6:214877/1‑148 (MQ=255) gccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCg > 2:266315‑M2/6‑130 (MQ=255) gccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCg < 1:266315‑M2/125‑1 (MQ=255) ccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGTCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgt < 2:42870‑M2/83‑1 (MQ=255) ccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGTCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgt > 1:42870‑M2/5‑87 (MQ=255) cagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCACGGCcgc > 5:112255‑M2/4‑149 (MQ=255) | CTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCACGGCCGC > NC_002947/318956‑319240 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |