New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 375996 = | 50 (0.950) | 5 (0.100) | 3/236 | NT | 10.7% | coding (43/771 nt) | PP_0313 | electron transfer flavoprotein subunit beta |
? | NC_002947 | 376052 = | 37 (0.750) | coding (99/771 nt) | PP_0313 | electron transfer flavoprotein subunit beta |
GACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATGTGCTGGGCGTGCT > NC_002947/375905‑376192 | gtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGt > 6:78998‑M1/92‑148 (MQ=255) gtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGt > 5:215443‑M1/92‑148 (MQ=255) aCCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAgct > 5:119203/1‑149 (MQ=255) ccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGt > 6:354563‑M1/84‑140 (MQ=255) ccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGt < 5:354563‑M1/57‑1 (MQ=255) gCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGctggctgg < 2:123681/149‑1 (MQ=255) gCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGCGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTGCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGATCAGT‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGctggctgg < 7:270631/149‑1 (MQ=255) gCAGCCTGCGCGACGCGGCATATGGGCACTAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCGGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGa < 4:249274/149‑1 (MQ=255) gCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGa > 2:221718/1‑149 (MQ=255) gCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGa > 3:220943/1‑149 (MQ=255) ccagcGCGACGCGGCAAAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATAAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGAACCGGCCGCCCCCGCCGCGCCGACCAGG‑ATGCACGTCCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGAGGGGGAAAAc > 8:49506/1‑149 (MQ=255) agcGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACtt > 6:270739/1‑149 (MQ=255) cgACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAg < 1:221718/149‑1 (MQ=255) gcgGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAggtgg < 3:31533/149‑1 (MQ=255) aGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAgct > 6:132577/1‑118 (MQ=255) gggCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCgg < 5:270739/149‑1 (MQ=255) ggCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCggg < 6:119203/149‑1 (MQ=255) gCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGCTTGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCggg < 1:278038/149‑1 (MQ=255) gCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTg > 3:60463/1‑131 (MQ=255) gCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTg < 4:60463/131‑1 (MQ=255) cGAGCATGAGTCCGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTATGCAGCTGGCTGGGGATAACTTTCAGGTGGTGCATGCGGGCAAt > 8:272524/1‑149 (MQ=255) cGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAGCTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAAt > 2:9338/1‑149 (MQ=255) gCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGctggctgg > 1:21689/1‑115 (MQ=255) gCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGctggctgg < 2:21689/115‑1 (MQ=255) aTGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCGCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCcaca < 4:220943/149‑1 (MQ=255) gAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGAGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAg > 3:214877/1‑148 (MQ=255) gtaaGTGTTCAGGCTGGTTTCCATTGGTGCCCACGCCAGCTCCGGGCGCGCCCGGCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGTATGCGGGCAATCCACAGGAagag < 7:49506/146‑1 (MQ=255) gAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAgg > 6:219899/1‑149 (MQ=255) aaaGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCTGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGc < 2:91174/149‑1 (MQ=255) aGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCt < 6:145251/149‑1 (MQ=255) ttCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCt > 8:243894/1‑134 (MQ=255) ttCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCt < 7:243894/134‑1 (MQ=255) cATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCATGCGCGCTTACCTGGGc < 1:9338/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCAt > 6:276422/1‑149 (MQ=255) cccACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTg > 2:287049/1‑149 (MQ=255) aCCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGac > 3:154522/1‑149 (MQ=255) acccagctccacggcacgggcatcctgctcggcgcggcgggcgcggccggagctgggTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATgg > 6:354563‑M2/58‑140 (MQ=255) acccagctccacggcacgggcatcctgctcggcgcggcgggcgcggccggagctgggTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATgg < 5:354563‑M2/83‑1 (MQ=255) acccagctccacggcacgggcatcctgctcggcgcggcgggcgcggccggagctgggTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGac > 6:78998‑M2/58‑148 (MQ=255) acccagctccacggcacgggcatcctgctcggcgcggcgggcgcggccggagctgggTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGac > 5:215443‑M2/58‑148 (MQ=255) CCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGaccac > 4:214877‑M1/1‑149 (MQ=255) GCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTc > 5:219899‑M1/1‑149 (MQ=255) GCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTc > 5:276422‑M1/1‑149 (MQ=255) cacggcacgggcatcctgctcggcgcggcgggcgcggccggagctgggTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGAc < 6:215443‑M2/100‑1 (MQ=255) cccgccGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAg > 7:112741/1‑149 (MQ=255) gccgcgccgAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCaa < 8:112741/149‑1 (MQ=255) cccGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGAt > 7:191938/1‑146 (MQ=255) cccGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGAt < 8:191938/146‑1 (MQ=255) ccgtgccgtgGAGCTGGGTTTGCAGCTGGATGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATgtgc > 1:250042/1‑149 (MQ=255) gccgtgGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTg < 1:277476/102‑1 (MQ=255) gccgtgGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTg > 2:277476/1‑102 (MQ=255) tgGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATgtgctgggcgtg < 4:154522/149‑1 (MQ=255) gagctgggTTTGCTGCTGGGTGGGGATATCTTGCAGGTGGTGGATGCGGGCATTCCACAGGAAGTGGCCTTGCGCGCTTAACTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAAGCGGCCGGGGCCGATgtgctgggcgtgct < 8:281645‑M2/141‑1 (MQ=255) | GACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGG‑ATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATGTGCTGGGCGTGCT > NC_002947/375905‑376192 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |