New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1090127 = | 56 (1.060) | 3 (0.060) | 3/238 | NT | 5.5% | coding (988/1380 nt) | fumC‑I | class 2 fumarate hydratase |
? | NC_002947 | 1090165 = | 51 (1.030) | coding (1026/1380 nt) | fumC‑I | class 2 fumarate hydratase |
TGAACTCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAGGTCAACGAAGA > NC_002947/1090017‑1090311 | tGAACTCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATc > 1:135970/1‑149 (MQ=255) agcaagcggctgacattggccatcagctcgatgctttccagcaggttgcgggcgatcaccggcagcatcacgttcagctcgaagttaccggcttgacctgcgacggcgATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGc > 3:93211‑M1/109‑149 (MQ=255) tCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGt > 2:157169/1‑149 (MQ=255) cGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCTAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCg < 7:187713/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAgg < 6:304837/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGt > 7:9606/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTc < 1:132519/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGCACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCaa < 1:181498/148‑1 (MQ=255) gCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCaa < 8:29243/147‑1 (MQ=255) ggCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTaa < 4:66280/146‑1 (MQ=255) cGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTc > 4:338950/1‑148 (MQ=255) aaTCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑Gc > 5:350544/1‑149 (MQ=255) tCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTg < 1:157169/149‑1 (MQ=255) gCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACg > 2:265682/1‑149 (MQ=255) tGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGt > 2:305552/1‑148 (MQ=255) gCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGa > 8:307129/1‑149 (MQ=255) gCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGa > 3:74641/1‑149 (MQ=255) aGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGAtgc > 6:141735/1‑149 (MQ=255) ctctGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAAc < 6:244562/128‑1 (MQ=255) ctctGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAAc > 5:244562/1‑128 (MQ=255) tGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCg > 6:209187/1‑149 (MQ=255) aGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGt > 3:297090/1‑148 (MQ=255) aGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGt > 1:299770/1‑148 (MQ=255) gCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGcc > 2:436/1‑149 (MQ=255) ctctTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGccc < 5:209187/149‑1 (MQ=255) tctTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTTGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGa > 5:290791/1‑124 (MQ=255) tctTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTTGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGa < 6:290791/124‑1 (MQ=255) tctTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGccc > 8:283678/1‑148 (MQ=255) ctTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGCCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCg > 2:286734/1‑148 (MQ=255) ttCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGccc < 7:283678/146‑1 (MQ=255) ttCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGc > 1:130775/1‑148 (MQ=255) cGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGc < 6:350544/146‑1 (MQ=255) gATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAAc < 4:297090/148‑1 (MQ=255) aTGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACctgc < 8:297156/148‑1 (MQ=255) tGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACctgctg > 7:285016/1‑149 (MQ=255) ccAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTgg < 2:130775/148‑1 (MQ=255) aGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGaaa < 5:141735/149‑1 (MQ=255) aaGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCAt < 1:436/149‑1 (MQ=255) gTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATc > 5:138825/1‑147 (MQ=255) aaCCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGACTCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGc < 1:265682/149‑1 (MQ=255) gTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGc < 4:74641/149‑1 (MQ=255) aTCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCaa > 5:299009/1‑149 (MQ=255) cGGAGGCCAGTGCCATGTTCGCGTAGCATGTGTTTGGCAACG‑ACGCGACCATCTCCGTTGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGc < 1:135809/142‑1 (MQ=255) cGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTc < 3:338950/149‑1 (MQ=255) aGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGc < 7:307129/149‑1 (MQ=255) ccACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGccc < 5:275612/105‑1 (MQ=255) ccACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGccc > 6:275612/1‑105 (MQ=255) cTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTg < 2:299770/149‑1 (MQ=255) tGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTACCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGc > 3:124154/1‑149 (MQ=255) gcgatggtcgcgtcgttgccaatcacttgggcggcgaccatCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCt > 3:93211‑M2/42‑149 (MQ=255) ccATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTg > 6:169117/1‑149 (MQ=255) cgataTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTg > 3:282342‑M1/6‑148 (MQ=255) atggtcgcgtcgttgccaatcacttgggcggcgaccatCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTg > 5:297777‑M2/39‑144 (MQ=255) atggtcgcgtcgttgccaatcacttgggcggcgaccatCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTg < 6:297777‑M2/106‑1 (MQ=255) TGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGcc > 1:305552‑M1/1‑149 (MQ=255) TGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTACCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGcc > 4:124154‑M1/1‑149 (MQ=255) TCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCa < 3:108859‑M1/132‑1 (MQ=255) TCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCa > 4:108859‑M1/1‑132 (MQ=255) CCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACaaa > 6:299009‑M1/1‑149 (MQ=255) gTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGc > 5:358998/1‑149 (MQ=255) ttGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAAc < 4:261682/83‑1 (MQ=255) ttGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAAc > 3:261682/1‑83 (MQ=255) cg‑acgCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAgg > 6:311110/1‑149 (MQ=255) gcgaccatCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAGGTCaa > 8:171334‑M2/9‑149 (MQ=255) catCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAg > 4:148147‑M2/4‑122 (MQ=255) catCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAg < 3:148147‑M2/119‑1 (MQ=255) catCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAGGTCAACGAAg < 8:285016‑M2/146‑1 (MQ=255) atCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAGGTCAACGAAGa > 4:276672‑M2/3‑149 (MQ=255) atCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAGGTCAACGAAGa > 3:216661‑M2/3‑149 (MQ=255) | TGAACTCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACG‑ACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGA‑GCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAGGTCAACGAAGA > NC_002947/1090017‑1090311 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |