New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1318866 = | 57 (1.080) | 5 (0.100) | 4/246 | NT | 9.5% | coding (90/870 nt) | PP_1152 | membrane fusion efflux protein |
? | NC_002947 | 1318909 = | 40 (0.780) | coding (133/870 nt) | PP_1152 | membrane fusion efflux protein |
TAAAGGAGTGTTTCGATGCGTGCGGCCGTACGTATTCTGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGACCGCGAGCGCTTCCAGGCCGCGCTCGATCAGGCCAGCGCGGTGACC > NC_002947/1318762‑1319046 | aagcgctcgcggtcaatactcatcaacaagtcgccagccttgacctgctggttgtcatggaccttgagttcgcgaacccagccggacacatcaggcgcaatcacCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATgtggtggt > 2:290661‑M1/105‑149 (MQ=255) aaaGGAGTGTTTCGATGCGTGCGGCCGTACGTATTCTGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATgtggtggt > 5:159094/1‑148 (MQ=255) aGGAGTGTTTCGATGCGTGCGGCCGTACGTATTCTGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGAt > 3:266673/1‑149 (MQ=255) tgtTTCGATGCGTGCGGCCGTACGTATTCTGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTgcgc < 2:60635/149‑1 (MQ=255) gATGCGTGCGGCCGTACGTATTCTGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGAtg > 7:274027/1‑149 (MQ=255) gATGCGTGCGGCCGTACGTATTCTGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGAt < 6:31190/148‑1 (MQ=255) ccGTACGTATTCTGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTgg < 4:266673/149‑1 (MQ=255) gtacgtaTTCTGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGt > 7:111644/1‑149 (MQ=255) tGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTgg < 4:156886/137‑1 (MQ=255) tGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTgg > 3:156886/1‑137 (MQ=255) gTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTc > 4:168161/1‑147 (MQ=255) gTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCaa < 1:118164/149‑1 (MQ=255) agccTGTGTGTGGTGTGGCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCATTACTAATTGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGGCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAgg < 1:327736/146‑1 (MQ=255) ccTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTcc < 2:96348/149‑1 (MQ=255) ccTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGACTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTc > 5:217421/1‑148 (MQ=255) tgtgtgtgGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGACTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCAt > 7:199050/1‑149 (MQ=255) tgtgtgGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCAt < 4:89102/147‑1 (MQ=255) gtggCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAgg < 5:287892/136‑1 (MQ=255) gtggCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAgg > 6:287892/1‑136 (MQ=255) ccTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTgcgc < 3:28211/98‑1 (MQ=255) ccTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTgcgc > 4:28211/1‑98 (MQ=255) ccTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAgg > 7:234006/1‑149 (MQ=255) gCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTc > 3:234182/1‑147 (MQ=255) cGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGt < 8:212352/144‑1 (MQ=255) cGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGt > 7:212352/1‑144 (MQ=255) cGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAgg > 6:250606/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGTAGGTCAAGGCTgg < 8:234006/149‑1 (MQ=255) gCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTc > 1:209054/1‑114 (MQ=255) gCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTc < 2:209054/114‑1 (MQ=255) ccGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGc < 2:315324/146‑1 (MQ=255) ccGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGc < 2:311077/146‑1 (MQ=255) ccGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGc > 1:315324/1‑146 (MQ=255) ccGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGc > 1:311077/1‑146 (MQ=255) tACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATCGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAg > 5:180755/1‑135 (MQ=255) tACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATCGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAg < 6:180755/135‑1 (MQ=255) ccAGCTGTTGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACttgtt < 8:274027/147‑1 (MQ=255) tgGCAGTACTACATGATCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTTATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTa < 6:217421/148‑1 (MQ=255) gTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGAcc < 6:25733/149‑1 (MQ=255) cATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACtt > 6:11861/1‑126 (MQ=255) cATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACtt < 5:11861/126‑1 (MQ=255) cATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGACCGCGa < 6:159094/147‑1 (MQ=255) cATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGACCGCGAgc > 6:131770/1‑149 (MQ=255) accaccacatcggcgcgcacacgggcatcacgcgtccatggggtgGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGACCGCGAGCGCtt > 2:290661‑M2/46‑149 (MQ=255) caccacatcggcgcgcacacgggcatcacgcgtccatggggtgGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACtt > 6:286250‑M2/44‑120 (MQ=255) caccacatcggcgcgcacacgggcatcacgcgtccatggggtgGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACtt < 5:286250‑M2/77‑1 (MQ=255) caccacatcggcgcgcacacgggcatcacgcgtccatggggtgGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGACCGCGAGCGCTTc > 4:58361‑M2/44‑148 (MQ=255) ACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGACCGCGAGCGCTTc > 8:199050‑M1/1‑147 (MQ=255) cccGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGACCGCGAGCGCTTCCAGGCCGCGCTCGATCAGGc < 5:250606/148‑1 (MQ=255) tccatggggtgGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGACCGCGAGCGCTTCCAGGCCGCGCTCGATCAGGCCAGCGCGGTGAcc < 3:58361‑M2/138‑1 (MQ=255) tggtggtgATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACttg > 4:227726/1‑83 (MQ=255) tggtggtgATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACttg < 3:227726/83‑1 (MQ=255) | TAAAGGAGTGTTTCGATGCGTGCGGCCGTACGTATTCTGGTGACCCTGTGTGTGGTGGCCCTGGCCGTGTTGGCCGGCTACCAGCTGTGGCAGTACTACATGCTCACCCCATGGACGCGTGATGCCCGTGTGCGCGCCGATGTGGTGGTGATTGCGCCTGATGTGTCCGGCTGGGTTCGCGAACTCAAGGTCCATGACAACCAGCAGGTCAAGGCTGGCGACTTGTTGATGAGTATTGACCGCGAGCGCTTCCAGGCCGCGCTCGATCAGGCCAGCGCGGTGACC > NC_002947/1318762‑1319046 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |