New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1465748 = | 64 (1.210) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 5.4% | coding (1443/1560 nt) | algG | poly(beta‑D‑mannuronate) C5 epimerase |
? | NC_002947 | 1465806 = | 44 (0.880) | coding (1385/1560 nt) | algG | poly(beta‑D‑mannuronate) C5 epimerase |
ACCGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGTATACGCCGAC > NC_002947/1465659‑1465945 | gccctcgacccgttcgacaccaaggtgtcgctggtcgtggtgggtggcgagctgtcggccaacggctccggcccgctgtcgatcgactcGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGa > 1:99159‑M1/90‑149 (MQ=255) aCCGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGa < 4:346609/149‑1 (MQ=255) tCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtcgat < 8:78571/149‑1 (MQ=255) aTCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtcgatcga < 1:213986/149‑1 (MQ=255) acaGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCgg < 4:303681/149‑1 (MQ=255) aGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGc > 4:236320/1‑149 (MQ=255) ccTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGACGATCGACAGCGGGCCg < 8:114400/149‑1 (MQ=255) tCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGa < 3:90817/148‑1 (MQ=255) ggCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTg < 3:236320/149‑1 (MQ=255) gTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGcc < 5:68846/149‑1 (MQ=255) cagcagGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGa > 5:18625/1‑147 (MQ=255) cagcagGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACa > 2:6955/1‑149 (MQ=255) agcagGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAg > 8:267455/1‑149 (MQ=255) gcagGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGc > 1:346578/1‑149 (MQ=255) gAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGt > 6:27591/1‑107 (MQ=255) gAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGt < 5:27591/107‑1 (MQ=255) gAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGACCGGAGCCGTTg > 4:60195/1‑133 (MQ=255) gAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGACCGGAGCCGTTg < 3:60195/133‑1 (MQ=255) ccAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTg < 7:267455/149‑1 (MQ=255) ccAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTg > 8:61863/1‑149 (MQ=255) ccAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTg < 1:6955/149‑1 (MQ=255) ccAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTCGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTg > 1:196672/1‑149 (MQ=255) cAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTgg > 2:148231/1‑149 (MQ=255) aGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGgt < 6:139640/149‑1 (MQ=255) acCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGTGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCg > 1:285056/1‑148 (MQ=255) cATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGAGGGCCGTAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAAc > 7:71570/1‑149 (MQ=255) aTTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACg < 2:346578/149‑1 (MQ=255) ttGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGAc < 8:132650/105‑1 (MQ=255) ttGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGAc > 7:132650/1‑105 (MQ=255) gCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTc > 6:304486/1‑147 (MQ=255) gCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGa < 2:196672/149‑1 (MQ=255) tcgccgctgtcggtcgagctgtacaaggtgtccatgctcgccccgcgcaaggccagcggcGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGACCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGc > 1:99159‑M2/61‑149 (MQ=255) aTGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGc < 5:304486/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGgtgt < 3:315874/132‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGgtgt > 4:315874/1‑132 (MQ=255) gccgctgtcggtcgagctgtacaaggtgtccatgctcgccccgcgcaaggccagcggcGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACAACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGa > 7:172297‑M2/59‑149 (MQ=255) GCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGa > 7:237742‑M1/1‑113 (MQ=255) GCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGa < 8:237742‑M1/113‑1 (MQ=255) ggtcgagctgtacaaggtgtccatgctcgccccgcgcaaggccagcggcGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGACCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGcggt < 2:99159‑M2/100‑1 (MQ=255) ttGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGcggtc > 5:235653/1‑149 (MQ=255) gAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGa > 5:114089/1‑147 (MQ=255) gCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAgg > 4:295026/1‑149 (MQ=255) acacCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGc < 8:33675/118‑1 (MQ=255) acacCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCttt > 7:21097/1‑148 (MQ=255) acCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGAt < 2:285056/149‑1 (MQ=255) acCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGAt < 6:114089/149‑1 (MQ=255) cTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGAtgt < 3:295026/149‑1 (MQ=255) tGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTc < 4:34483/130‑1 (MQ=255) tGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTc > 3:34483/1‑130 (MQ=255) aCAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCg > 6:261233/1‑149 (MQ=255) aGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGgtgt < 1:331903/124‑1 (MQ=255) aGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGgtgt > 2:331903/1‑124 (MQ=255) gaccgacAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGTATACGc > 5:106880/1‑149 (MQ=255) cgacAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGTATACGCCGa < 6:235653/149‑1 (MQ=255) gacAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACGCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGTATACGCCGAc < 7:61863/149‑1 (MQ=255) cggcGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGcggtcggt > 7:76463‑M2/5‑108 (MQ=255) cggcGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGcggtcggt < 8:76463‑M2/104‑1 (MQ=255) cggcGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGt < 3:252067‑M2/130‑1 (MQ=255) cggcGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGt > 4:252067‑M2/5‑134 (MQ=255) | ACCGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGTATACGCCGAC > NC_002947/1465659‑1465945 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |