New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1543781 | 34 (0.640) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 11.5% | coding (585/1245 nt) | mdfA | multidrug MFS transporter |
? | NC_002947 | = 1543810 | 29 (0.580) | coding (614/1245 nt) | mdfA | multidrug MFS transporter |
GTGGGCACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCT > NC_002947/1543665‑1543945 | gtggGCACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcac > 8:147563‑M2/1‑146 (MQ=255) cACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGa < 4:73791/149‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGACGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGa > 8:59168/1‑149 (MQ=255) cACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGACGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGa < 7:59168/149‑1 (MQ=255) ctggctgTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTAGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATg < 7:233773/149‑1 (MQ=255) gTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCa > 6:272647/1‑143 (MQ=255) gTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCa < 5:272647/143‑1 (MQ=255) gCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTgg < 1:175935/148‑1 (MQ=255) cATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGc < 8:186621/149‑1 (MQ=255) ttCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCaa > 2:177879/1‑149 (MQ=255) ccATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTg < 1:149274/116‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTg > 2:149274/1‑116 (MQ=255) aTCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCgg > 6:316336/1‑121 (MQ=255) aTCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCgg < 5:316336/121‑1 (MQ=255) gcgcGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACcgccgc > 3:319595/1‑146 (MQ=255) gcgcGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACcgccgc < 4:319595/146‑1 (MQ=255) gcgcGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTc > 3:335161/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTc < 7:193158/149‑1 (MQ=255) tGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTgca < 4:335161/149‑1 (MQ=255) gACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTgcagg > 3:184697/1‑147 (MQ=255) tgctgctgTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCgccgcc > 5:211525/1‑149 (MQ=255) ctgTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGcgccgc < 6:214292/143‑1 (MQ=255) ctgTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGcgccgc > 5:214292/1‑143 (MQ=255) gTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGt > 8:258572/1‑149 (MQ=255) tACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGt < 4:109703/148‑1 (MQ=255) ccGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcacgcccagggtttccggcatcaaccggtacagcagcagccaggtcagcaccgcgccgatggcgaatgccacgaacagccagcgccagtccagccattgcag < 5:169427‑M2/149‑103 (MQ=255) aCCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGAt < 4:184697/149‑1 (MQ=255) tGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcacgcccagggtttccggcatcaaccggtacagcagcagccaggtcagcaccgcgccgatggcgaatgccacgaacagccagcgccagtccagccattgcagcagcaaggtg < 6:108021‑M2/149‑113 (MQ=255) tGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTgg > 5:105276/1‑124 (MQ=255) tGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTgg < 6:105276/124‑1 (MQ=255) cGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcacgcccagggtttccggcatcaaccggtacagcagcagccaggtcagcaccgcgccgatggcgaatgccacgaacagccagcgccagtccagccattgcagcagcaaggtgccca < 4:328227‑M2/149‑117 (MQ=255) gAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcacgcccagggtttccggcatcaaccggtacagcagcagccaggtcagcaccgcgccgatggcgaatgccacgaacagccagcgccagtccagccattgcagcagcaaggtgcccaccag > 6:169427‑M2/1‑29 (MQ=255) ccGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCt > 4:185032/1‑137 (MQ=255) gCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGc > 2:193991/1‑117 (MQ=255) gCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGc < 1:193991/117‑1 (MQ=255) tCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGtgct > 5:262859/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGtgct > 1:291009/1‑149 (MQ=255) | GTGGGCACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCT > NC_002947/1543665‑1543945 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |