| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1762690 | 42 (0.800) | 7 (0.140) | 6/242 | NT | 14.0% | coding (324/477 nt) | PP_1569 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 1762715 | 46 (0.910) | coding (349/477 nt) | PP_1569 | hypothetical protein | |||||
CGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGG > NC_002947/1762570‑1762863 | cgcgGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcat < 5:359800‑M2/149‑4 (MQ=255) cggcgATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgc > 6:359800‑M2/1‑144 (MQ=255) cgATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTg < 4:257424/149‑1 (MQ=255) aTTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCGTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCt > 1:247357/1‑149 (MQ=255) tgctgctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgc < 3:78502‑M2/139‑6 (MQ=255) tgctgctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgc > 4:78502‑M2/1‑134 (MQ=255) ctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg < 1:249431/147‑1 (MQ=255) ctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg < 6:4940/147‑1 (MQ=255) ctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg < 2:247357/147‑1 (MQ=255) tgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGcc > 4:95604/1‑149 (MQ=255) gCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACtt > 8:285831/1‑149 (MQ=255) agCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTc < 8:39972/149‑1 (MQ=255) tctGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg < 7:329707/125‑1 (MQ=255) tctGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg > 8:329707/1‑125 (MQ=255) tGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg < 6:288141/111‑1 (MQ=255) tGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg > 5:288141/1‑111 (MQ=255) tCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCgg > 3:325208/1‑145 (MQ=255) tCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCgg < 4:325208/145‑1 (MQ=255) gCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGc > 4:65380/1‑102 (MQ=255) gCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGc < 3:65380/102‑1 (MQ=255) aCGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTc > 2:85051/1‑148 (MQ=255) cGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGa < 1:85051/149‑1 (MQ=255) tGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGt > 4:335951/1‑96 (MQ=255) tGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGt < 3:335951/96‑1 (MQ=255) cGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGt > 3:187924/1‑149 (MQ=255) gATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTgagg > 4:177248/1‑106 (MQ=255) gATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTgagg < 3:177248/106‑1 (MQ=255) cTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAAACCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAg > 1:243676/1‑148 (MQ=255) tGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCa < 3:308770/147‑1 (MQ=255) gACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACct > 2:319814/1‑149 (MQ=255) cTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATg < 7:285831/149‑1 (MQ=255) tGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGa < 6:132503/146‑1 (MQ=255) tGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGa > 5:132503/1‑146 (MQ=255) tGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGc > 7:228858/1‑149 (MQ=255) gACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGcc > 3:156360/1‑149 (MQ=255) cTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcagagtttggtcctgctctgcctcagcagcagcaat < 5:206493‑M2/149‑115 (MQ=255) cTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcaga > 8:25631‑M2/1‑35 (MQ=255) cTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcaga < 7:25631‑M2/117‑83 (MQ=255) aTGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcagagtttggtcctgctct < 3:16877‑M2/130‑98 (MQ=255) aTGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggagacggcgtcagcgttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcagagtttggtcctgctct > 4:16877‑M2/1‑33 (MQ=255) aTGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCg > 3:331231/1‑148 (MQ=255) gCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATg < 4:331231/149‑1 (MQ=255) cATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATgg < 1:319814/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATggg > 3:317690/1‑149 (MQ=255) tGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGgt < 4:250114/149‑1 (MQ=255) ggTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcagagtttggtcctgc < 6:264037‑M2/120‑95 (MQ=255) ggTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcagagtttggtcctgc > 5:264037‑M2/1‑26 (MQ=255) gTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGgtgt < 5:294701/149‑1 (MQ=255) gTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGgtgt > 6:294701/1‑149 (MQ=255) gCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGgtgtgt > 5:222855/1‑149 (MQ=255) cTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGgtgtgt > 3:106226/1‑148 (MQ=255) cTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGtgtgtg < 4:187924/149‑1 (MQ=255) aaTCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGAGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATg > 8:99144/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATg > 4:304439/1‑148 (MQ=255) gCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGcc > 7:46587/1‑149 (MQ=255) cAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGgtgt < 2:316180/131‑1 (MQ=255) cAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGgtgt > 1:316180/1‑131 (MQ=255) aaGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCgg > 6:133579/1‑144 (MQ=255) aaGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCgg < 5:133579/144‑1 (MQ=255) ggCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCg > 7:169203/1‑149 (MQ=255) ggCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCg > 6:129256/1‑149 (MQ=255) gCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCgg < 8:228858/149‑1 (MQ=255) gCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCgg < 3:304439/149‑1 (MQ=255) | CGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGG > NC_002947/1762570‑1762863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |