| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1843419 | 52 (0.980) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 6.6% | coding (1375/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
| ? | NC_002947 | = 1843446 | 64 (1.270) | coding (1348/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS | |||||
GGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTGAGGATCTGCTT > NC_002947/1843300‑1843587 | ggTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCTGACCTGTGCGGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAca > 3:85241‑M2/1‑147 (MQ=255) tGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggcc < 3:45225‑M2/148‑7 (MQ=255) tGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggcc < 2:10459‑M2/148‑7 (MQ=255) gTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGa > 5:160474/1‑149 (MQ=255) cacCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCg > 6:223356/1‑149 (MQ=255) acCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGa < 6:150920/135‑1 (MQ=255) acCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGa > 5:150920/1‑135 (MQ=255) acCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCgg > 3:155885/1‑149 (MQ=255) cGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAca > 4:342897‑M2/1‑133 (MQ=255) cGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAca < 3:342897‑M2/135‑3 (MQ=255) aTCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggc < 8:94836‑M2/136‑6 (MQ=255) aTCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggc > 7:94836‑M2/1‑131 (MQ=255) gccgccCATCTGTTCGATCAGGCTGTTGGAAATCACCAGCCCCAGTCCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGATTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGgtg < 8:94651/142‑1 (MQ=255) gccCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGc < 4:155885/149‑1 (MQ=255) aTCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGAt < 4:45225/149‑1 (MQ=255) aTCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGAt < 7:41229/149‑1 (MQ=255) tCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATg > 1:50686/1‑149 (MQ=255) ttGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTc > 2:44503/1‑149 (MQ=255) ggAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCaa < 7:118307/135‑1 (MQ=255) ggAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCaa > 8:118307/1‑135 (MQ=255) gAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCt > 2:268182/1‑118 (MQ=255) gAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCtt < 5:223356/148‑1 (MQ=255) gAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTc < 6:160474/149‑1 (MQ=255) aaaTCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTc > 8:64287/1‑148 (MQ=255) aaaTCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTc < 7:64287/148‑1 (MQ=255) aCCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTc < 2:50686/149‑1 (MQ=255) cccAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTc < 2:104194/149‑1 (MQ=255) cccAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTc > 1:310818/1‑149 (MQ=255) aGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGa < 1:132576/83‑1 (MQ=255) aGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGa > 2:132576/1‑83 (MQ=255) aCCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCa > 4:249125/1‑149 (MQ=255) gcggcaccgGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATg < 5:7132/141‑1 (MQ=255) gcggcaccgGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATg > 6:7132/7‑147 (MQ=255) gTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggcc > 7:72217‑M2/1‑77 (MQ=255) gTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggcc < 8:72217‑M2/83‑7 (MQ=255) gTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGgc > 1:229183/1‑149 (MQ=255) gccgccGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGgcgc > 7:16392/1‑149 (MQ=255) ccgGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCac < 4:240287/149‑1 (MQ=255) ccgGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCac < 2:183889/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCAcgacga < 8:16392/149‑1 (MQ=255) cAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTc > 8:335192/1‑120 (MQ=255) cAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTc < 7:335192/120‑1 (MQ=255) tGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGt > 1:145162/1‑141 (MQ=255) tGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGt < 2:145162/141‑1 (MQ=255) tGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTcgc > 2:332594/1‑149 (MQ=255) aGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTc < 2:55240/109‑1 (MQ=255) aGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCgg < 2:229183/149‑1 (MQ=255) ttGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGt < 2:119846/137‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGAGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACtt > 7:220888/1‑149 (MQ=255) ccTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGt < 8:310826/142‑1 (MQ=255) ccTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGt > 7:310826/1‑142 (MQ=255) tGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggccttcagccaggctgacaactcactggcccgccagcccggcggcaccggtctggggctggtgatttccaagcgcctgatcgaacagatgggcggcgagatcggtgtc < 5:351212‑M2/148‑112 (MQ=255) aGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggccttcagccaggctgacaactcactggcccgccagcccggcggcaccggtctggggctggtgatttccaagcgcctgatcgaacagatgggcggcgagatcggtgtcgaca > 6:351212‑M2/1‑34 (MQ=255) cTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggccttcagccaggctgacaactcactggcccgccagcccggcggcaccggtctggggctggtgatttccaagcgcctgatcgaacagatgggcggcgagatcggt < 3:272015‑M2/138‑109 (MQ=255) cTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggccttcagccaggctgacaactcactggcccgccagcccggcggcaccggtctggggctggtgatttccaagcgcctgatcgaacagatgggcggcgagatcggt > 4:272015‑M2/1‑30 (MQ=255) cTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTc < 3:196223/93‑1 (MQ=255) cTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTc > 4:196223/1‑93 (MQ=255) gAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTg > 4:320355/1‑142 (MQ=255) gAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTg < 3:320355/142‑1 (MQ=255) gAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGAcc < 3:249125/148‑1 (MQ=255) aCAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAgg < 7:35753/149‑1 (MQ=255) tgCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGt < 1:44503/148‑1 (MQ=255) tgCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTAGt < 2:66644/148‑1 (MQ=255) ggcgcACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTg < 1:29532/148‑1 (MQ=255) gcgcACATCCTGAGGTGAACGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTTATGCGCAACTGC‑GCGCATTCTTCGTTCTCGTCTTCCATCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTg < 8:220888/148‑1 (MQ=255) cgcACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTGa < 1:332594/148‑1 (MQ=255) cgcACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTGa < 2:310818/148‑1 (MQ=255) cgcACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTGAg < 1:10459/149‑1 (MQ=255) gcACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTg < 4:91521/122‑1 (MQ=255) gcACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTg > 3:91521/1‑122 (MQ=255) acaTCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCgg > 6:67589/1‑111 (MQ=255) tCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGc > 1:161676/1‑122 (MQ=255) tCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGc < 2:161676/122‑1 (MQ=255) tCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTGAGGATCTg > 7:331711/1‑149 (MQ=255) cTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTgt‑gcgc > 6:195274/1‑53 (MQ=255) cTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTgt‑gcgc < 5:195274/53‑1 (MQ=255) cTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAgggt < 7:223805/135‑3 (MQ=255) cTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGtt > 8:223805/1‑135 (MQ=255) cTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTGAGGATCTGCt < 8:331711/149‑1 (MQ=255) tGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGACCTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTGAGGATCTGCtt > 8:39581/1‑149 (MQ=255) gAGTTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGGATTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCTTTGCTGACCAGGTTGGt < 2:257280/136‑1 (MQ=255) gAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGAATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGt > 1:257280/1‑137 (MQ=255) ggTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTcgc < 8:61682/100‑1 (MQ=255) ggTGACAGGCCGATGCCGGGGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTcgc > 7:61682/1‑100 (MQ=255) | GGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCGGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGC‑GCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGACCAGGTTGGTGAGGATCTGCTT > NC_002947/1843300‑1843587 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |