New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1936355 | 46 (0.870) | 5 (0.100) | 4/246 | NT | 11.4% | coding (657/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1936390 | 33 (0.650) | coding (692/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein |
GACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTACGTTCATTGACAGCCTGGAAGGCGATAT > NC_002947/1936248‑1936528 | gACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGt < 5:18525/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGt < 4:222466/137‑1 (MQ=255) gCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGt > 3:222466/1‑137 (MQ=255) cAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCg > 2:98999/1‑148 (MQ=255) gATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAg > 2:211978/1‑149 (MQ=255) tgtgCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTGGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTa < 4:92716/149‑1 (MQ=255) ttCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTAcc > 5:199146/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTAcc > 3:137237/1‑149 (MQ=255) ccccGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGccc < 3:200376/149‑1 (MQ=255) ccccGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGccc < 4:313643/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCACCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGtt < 6:348925/149‑1 (MQ=255) cggcgAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCg < 6:199146/149‑1 (MQ=255) aCGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGcc > 3:227523/1‑148 (MQ=255) cGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGa < 1:94176/149‑1 (MQ=255) cGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGa < 1:211978/149‑1 (MQ=255) cGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGCCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGa < 5:123922/149‑1 (MQ=255) ggCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGt < 5:343208/80‑1 (MQ=255) ggCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGt > 6:343208/1‑80 (MQ=255) ggCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGc < 5:233949/100‑1 (MQ=255) ggCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGc > 6:233949/1‑100 (MQ=255) ggCGACGGAGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAg > 8:5411/1‑149 (MQ=255) gcCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTg > 4:271820/1‑137 (MQ=255) gcCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTg < 3:271820/137‑1 (MQ=255) cAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATcggcgg < 7:5411/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAg < 1:158233/136‑1 (MQ=255) ggCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAg > 2:158233/1‑136 (MQ=255) gATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTc > 2:40620/1‑148 (MQ=255) aGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACa < 4:227523/148‑1 (MQ=255) cccGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTcgggctgatcggcgccgactggcgcactgcaccgtcgccgtaatactcgccgcccagttgcaccggggcgaacagcagcgggatcgccgcactggccagcaggtggtcga < 5:247981‑M2/149‑111 (MQ=255) cccGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTcgggctgatcggcgccgactggcgcactgcaccgtcgccgtaatactcgccgcccagttgcaccggggcgaacagcagcgggatcgccgcactg < 4:220608‑M2/133‑95 (MQ=255) cccGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTcgggctgatcggcgccgactggcgcactgcaccgtcgccgtaatactcgccgcccagttgcaccggggcgaacagcagcgggatcgccgcactg > 3:220608‑M2/1‑39 (MQ=255) cccGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCTAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTa > 4:52907/1‑149 (MQ=255) cccGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCACAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTa < 4:226800/149‑1 (MQ=255) cccGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCACAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTa > 3:226800/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTcgggctgatcggcgccgactggcgcactgcaccgtcgccgtaatactcgccgcccagttgcaccggggcgaacagcagcgggatcgccgcactggccagcaggtggtcgatg > 6:247981‑M2/1‑37 (MQ=255) gCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTACGtt > 1:110055/1‑149 (MQ=255) ttGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCAAG‑‑GCcgggctgataggcgccgaatggcgcactgcaccgtcgccgtaatactcgccgccaagttgcaccggggcgaacagcagcgggatcgccgcactggccagcaggtggtcgatggtcaacg < 5:122964‑M2/149‑120 (MQ=255) tGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTACGTTCAtt > 2:21533/1‑149 (MQ=255) gCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTACGTTCAtt < 1:21533/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTACGTTCATTGACa < 3:319074/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTACGTTCATTGACAGCCTgg < 1:98999/149‑1 (MQ=255) cAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTACGTTCATTGACAGCCTGGAAg < 1:40620/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTACGTTCATTGACAGCCTGGAAGGCGatat < 5:122553/149‑1 (MQ=255) | GACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTACGTTCATTGACAGCCTGGAAGGCGATAT > NC_002947/1936248‑1936528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |