New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2098415 = | 53 (1.000) | 3 (0.060) | 3/226 | NT | 5.5% | coding (1475/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | 2098464 = | 55 (1.170) | coding (1426/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
GCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGTGAACTTCAGCGCGTTGGACAGCAGGTTG > NC_002947/2098317‑2098612 | gCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGt > 5:39625/1‑148 (MQ=255) gCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTg < 7:102249/149‑1 (MQ=255) cGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTg > 2:162822/1‑148 (MQ=255) ggCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCATGCACAGCTTACGCGTCAAAGCCAGGACCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTg > 7:60935/1‑147 (MQ=255) aaTGCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAggg < 6:364672/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGGAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCTTAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCt < 8:229662/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCt < 8:310921/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCt > 8:282587/1‑149 (MQ=255) ggTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTgg > 8:327659/1‑145 (MQ=255) aGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATgc > 5:343784/1‑144 (MQ=255) aGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATgc < 6:343784/144‑1 (MQ=255) cTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTg < 1:162822/149‑1 (MQ=255) ccAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTg < 8:57218/131‑1 (MQ=255) ccAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTg > 7:57218/1‑131 (MQ=255) ccAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATg < 6:47507/138‑1 (MQ=255) ccAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATg > 5:47507/1‑138 (MQ=255) ccAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGAGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGc < 2:41214/149‑1 (MQ=255) aaaGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGt > 8:273467/1‑149 (MQ=255) cccGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAAGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTc > 5:316064/1‑149 (MQ=255) ggCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCggg < 4:29666/149‑1 (MQ=255) tgggAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGGTCAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCTGGGTACTGGCGGGTGATGCCTGCTCCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgat < 8:60935/147‑1 (MQ=255) tCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGc < 4:190197/137‑1 (MQ=255) tCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGc > 3:190197/1‑137 (MQ=255) ggAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACTGGTTAGGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCGTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgc < 5:199928/149‑1 (MQ=255) gAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgcc > 1:290717/1‑149 (MQ=255) aGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgccg < 4:126249/149‑1 (MQ=255) gAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgccgatg > 4:270921/1‑149 (MQ=255) aGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATc > 3:72460/1‑149 (MQ=255) gTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCggg > 3:129143/1‑129 (MQ=255) tGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCg < 4:72460/149‑1 (MQ=255) tGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCg < 6:39625/149‑1 (MQ=255) cTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCggg < 8:81437/114‑1 (MQ=255) gCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCacac > 7:183555/1‑149 (MQ=255) cacaGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCacac > 8:170603/1‑148 (MQ=255) gTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGc < 4:189549/96‑1 (MQ=255) gTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGc > 3:189549/1‑96 (MQ=255) gcgTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATg < 7:170603/149‑1 (MQ=255) aaGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgccgc > 2:38908/1‑148 (MQ=255) ccaggcccaggcCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAg > 3:35428/1‑149 (MQ=255) caggcccaggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAgc > 8:92492/1‑149 (MQ=255) aggcccaggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAgcg > 1:60646/1‑149 (MQ=255) ggcccaggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGGAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAgcgc < 7:282587/149‑1 (MQ=255) ggcccaggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAgcgc < 8:183555/149‑1 (MQ=255) gcccaggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCCCCGACAAAGACCGCCAAGCGCa > 6:273428/1‑149 (MQ=255) ccaggccggtgccggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACg > 4:243558‑M2/49‑149 (MQ=255) GCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGa > 4:35428‑M1/1‑149 (MQ=255) cggtgccggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATc < 3:290395‑M2/55‑1 (MQ=255) cggtgccggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCAGGTATc > 4:290395‑M2/43‑97 (MQ=255) CGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgccg < 2:60736‑M1/132‑1 (MQ=255) CGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgccg > 1:60736‑M1/1‑132 (MQ=255) CACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCg > 7:327659‑M1/1‑149 (MQ=255) CACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGAGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGa < 2:312131‑M1/117‑1 (MQ=255) CACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGAGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGa > 1:312131‑M1/1‑117 (MQ=255) aCCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCg > 3:329128/1‑148 (MQ=255) cGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCgg > 6:68770/1‑143 (MQ=255) cGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCgg < 5:68770/143‑1 (MQ=255) tACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACg < 3:323337/101‑1 (MQ=255) tACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACg > 4:323337/1‑101 (MQ=255) tACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCg > 1:317304/1‑149 (MQ=255) tACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCg > 4:224555/1‑149 (MQ=255) aCTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCgg > 2:303254/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCgg < 1:303254/148‑1 (MQ=255) cTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCgg < 3:224555/148‑1 (MQ=255) gCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCgg < 7:46956/136‑1 (MQ=255) gCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCgg > 8:46956/1‑136 (MQ=255) gCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGt < 7:273467/147‑1 (MQ=255) gCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGt < 2:290717/147‑1 (MQ=255) gCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGt < 3:270921/147‑1 (MQ=255) tGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGTGAACTTCAgc < 1:38908/149‑1 (MQ=255) cGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGTGAACTTCAGcgcg > 2:89508/1‑149 (MQ=255) gcaccggcctgggTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGTGAACTTCAGCGCGtt < 5:273428‑M2/136‑1 (MQ=255) ccggcctgggTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGTGAACTTCAGCGCGTTGGa < 7:92492‑M2/139‑1 (MQ=255) cctgggTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGTGAACTTCAGCGCGTTGGAcagc < 4:329128‑M2/143‑1 (MQ=255) ggTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGTGAACTTCAGCGCGTTGGACAGCAGGt < 2:60646‑M2/147‑1 (MQ=255) tGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGTGAACTTCAGCGCGTTGGACAGCAGGTTg > 4:172236/1‑149 (MQ=255) | GCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCCGAAGCGGGTGAACTTCAGCGCGTTGGACAGCAGGTTG > NC_002947/2098317‑2098612 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |