New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3456775 = | 53 (1.000) | 5 (0.100) | 5/244 | NT | 8.0% | coding (514/771 nt) | hbdH | 3‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 3456819 = | 64 (1.260) | coding (470/771 nt) | hbdH | 3‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
AGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGC > NC_002947/3456675‑3456964 | ccgggcatgcgcacgcgcaactgggggcgcatcatcaatatcgcttcggtgcatggcctggtcggctcgattggcaaggcagcctacgtggcagccaagcaTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCt > 1:40271‑M1/102‑149 (MQ=255) aGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCtt < 3:91686/149‑1 (MQ=255) aGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCtt > 7:323470/1‑149 (MQ=255) gCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTg < 2:325701/149‑1 (MQ=255) cgggcatgcgcacgcgcaactgggggcgcatcatcaatatcgcttcggtgcatggcctggtcggctcgattggcaaggcagcctacgtggcagccaagcaTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCtt > 6:339999‑M1/101‑149 (MQ=255) ccGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTgg < 8:323470/149‑1 (MQ=255) cACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACg > 3:160404/1‑149 (MQ=255) gcgcaactgggggcgcatcatcaatatcgcttcggtgcatggcctggtcggctcgattggcaaggcagcctacgtggcagccaagcaTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTg < 8:39982‑M1/50‑1 (MQ=255) gcgcaactgggggcgcatcatcaatatcgcttcggtgcatggcctggtcggctcgattggcaaggcagcctacgtggcagccaagcaTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTg > 7:39982‑M1/88‑137 (MQ=255) ggCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGc < 4:160404/147‑1 (MQ=255) aCGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑Gc < 5:278849/149‑1 (MQ=255) aCGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑Gc < 3:79625/149‑1 (MQ=255) gATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATAAGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑Gcc > 6:169464/1‑148 (MQ=255) tcgATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGa < 3:21579/149‑1 (MQ=255) gCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAg > 1:10723/1‑125 (MQ=255) gCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAg < 2:10723/125‑1 (MQ=255) ttGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATAAGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAg < 5:169464/147‑1 (MQ=255) cACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCAt > 1:65383/1‑149 (MQ=255) aCCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATg > 8:3086/1‑149 (MQ=255) cAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCa > 1:70543/1‑149 (MQ=255) aGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCAc > 5:120209/1‑149 (MQ=255) gtgtCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGaa < 6:120209/149‑1 (MQ=255) gtgtCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGaa < 4:162678/149‑1 (MQ=255) gCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGata > 2:195053/1‑149 (MQ=255) cccAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAg > 1:197621/1‑120 (MQ=255) ccAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATtga > 2:60467/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATtga > 3:321359/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGAACCGAAGCGATATtga > 1:303578/1‑149 (MQ=255) aGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATtgatg < 1:60467/149‑1 (MQ=255) aGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCAGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATtgat < 5:357167/148‑1 (MQ=255) aGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCAGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATtgat > 6:357167/1‑148 (MQ=255) gCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAg > 4:88445/1‑137 (MQ=255) gCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAg < 3:88445/137‑1 (MQ=255) gCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATtgatga < 7:3086/149‑1 (MQ=255) cGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑Gc > 3:50940/1‑104 (MQ=255) cGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑Gc < 4:50940/104‑1 (MQ=255) cGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑Gc < 4:46289/104‑1 (MQ=255) cGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑Gc > 3:46289/1‑104 (MQ=255) gCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAAt < 7:237336/105‑1 (MQ=255) gCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAAt > 8:237336/1‑105 (MQ=255) atatGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGcccc > 7:289848/1‑149 (MQ=255) atatGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGcccc < 4:321359/149‑1 (MQ=255) atGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGcccc > 7:265365/1‑147 (MQ=255) gCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGtt < 8:265365/149‑1 (MQ=255) gT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGa < 8:297111/92‑1 (MQ=255) gT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGa > 7:297111/1‑92 (MQ=255) aTGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑Gc > 4:61501/1‑80 (MQ=255) aTGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑Gc < 3:61501/80‑1 (MQ=255) tGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGcc > 6:3834/1‑149 (MQ=255) caagcatggcgtgatcggcctgaccaaggtggtcggcctggaaaccgccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTgcgc > 7:39982‑M2/51‑137 (MQ=255) caagcatggcgtgatcggcctgaccaaggtggtcggcctggaaaccgccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTgcgc < 8:39982‑M2/87‑1 (MQ=255) aagcatggcgtgatcggcctgaccaaggtggtcggcctggaaaccgccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCg > 6:339999‑M2/50‑149 (MQ=255) cTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATtgatga > 8:220943/1‑118 (MQ=255) cTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCgg < 2:65383/149‑1 (MQ=255) agcatggcgtgatcggcctgaccaaggtggtcggcctggaaaccgccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCgg > 1:40271‑M2/49‑149 (MQ=255) tggtggCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGccc < 5:312269/146‑1 (MQ=255) tggtggCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGccc > 6:312269/1‑146 (MQ=255) gtggCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTGGTAGGCCAATCGAGCCGAGCCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGccc > 1:282531/1‑149 (MQ=255) gtgatcggcctgaccaaggtggtcggcctggaaaccgccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCa < 5:339999‑M2/109‑1 (MQ=255) cAGGCCGCCCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGcgcg > 3:72387/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGcgcg > 2:91112/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCAAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGAGCATGCCCGGCAGCGCCAGGcgcg > 2:263115/1‑149 (MQ=255) aGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGgcgc > 4:201302/1‑147 (MQ=255) aGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGgcgc < 3:201302/147‑1 (MQ=255) caccTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGa < 8:289848/149‑1 (MQ=255) cTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATa > 4:231337/1‑149 (MQ=255) ttGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATgg < 1:185380/144‑1 (MQ=255) ttGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATgg > 2:185380/1‑144 (MQ=255) gTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAAt > 5:305153/1‑144 (MQ=255) gTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAAt < 6:305153/144‑1 (MQ=255) gTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGCAAGC‑CCAGGGCCCTTCCATGGAATaacgcc > 3:105655/1‑144 (MQ=255) aGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTTCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATg < 1:186935/137‑1 (MQ=255) aGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATg > 2:186935/1‑137 (MQ=255) aGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGa > 2:201140/1‑149 (MQ=255) ccGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAg < 1:91112/149‑1 (MQ=255) aCGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAg > 8:29393/1‑149 (MQ=255) gccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGcc > 5:269880‑M2/5‑136 (MQ=255) gccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGcc < 6:269880‑M2/132‑1 (MQ=255) gccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGtt < 2:44268‑M2/140‑1 (MQ=255) gccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGtt > 1:44268‑M2/5‑144 (MQ=255) ccaTGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGc < 7:29393‑M2/146‑1 (MQ=255) | AGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGT‑GACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCT‑‑T‑‑GCCAATCGAGCCGA‑CCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGC > NC_002947/3456675‑3456964 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |