New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3608784 | 50 (0.950) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.1% | coding (333/2265 nt) | PP_3182 | GGDEF domain‑containing protein |
? | NC_002947 | = 3608817 | 45 (0.890) | coding (300/2265 nt) | PP_3182 | GGDEF domain‑containing protein |
TCGAATTGGTCAACGGCAGCAGGAAGGGCAGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGC > NC_002947/3608669‑3608960 | tCGAATTGGTCAACGGCAGCAGGAAGGGCAGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTcg > 5:197369/1‑149 (MQ=255) aaTTGCTCAACCCCAGCACGAAGGCCACGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGAGCCGCTGCACTTGGAGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGgcg < 8:267548‑M2/149‑4 (MQ=255) ggTCAACGGCAGCAGGAAGGGCAGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGcc < 8:61864/148‑1 (MQ=255) gTCAACGGCAGCAGGAAGGGCAGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCt > 1:151061/1‑148 (MQ=255) gTCAACGGCAGCAGGAAGGGCAGGCGCCAAGAGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCt > 4:286514/1‑148 (MQ=255) cGGCAGCAGGAAGGGCAGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCgg > 7:88306/1‑149 (MQ=255) atcagGAAGGGCAGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTAtg < 3:201355/147‑1 (MQ=255) agGAAGGGCAGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTAtggct > 8:166642/1‑149 (MQ=255) gAAGGGCAGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCAt > 1:137726/1‑137 (MQ=255) cAGGCGCCAAGCGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTa < 3:286514/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTag < 2:151061/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTag > 1:57730/1‑149 (MQ=255) ccAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGcc > 6:297783/1‑149 (MQ=255) gTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGcc < 6:197369/149‑1 (MQ=255) ggcagggcagCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑g > 7:81317/1‑149 (MQ=255) gcagCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑gtcggtc < 2:57730/149‑1 (MQ=255) gcagCGGTGTGGCTGTCAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGTTCAATGTGCCGCTGCAGTTGTCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGTCCTT‑gtcggtc < 7:267548/149‑1 (MQ=255) tGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAg > 4:321868/1‑149 (MQ=255) aGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCt < 5:297783/149‑1 (MQ=255) gTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑gtcgg > 1:180461/1‑128 (MQ=255) gTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑gtcgg < 2:180461/128‑1 (MQ=255) ttAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGaa > 5:110454/1‑149 (MQ=255) aaTGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAaca > 3:76869/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGcc < 3:3198/114‑1 (MQ=255) gCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGcc > 4:3198/1‑114 (MQ=255) cTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAgg < 4:76869/149‑1 (MQ=255) cTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAgg < 8:88306/149‑1 (MQ=255) cTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAg < 8:81317/148‑1 (MQ=255) ttGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAggg > 4:39392/1‑149 (MQ=255) ttGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAggg > 5:10476/1‑149 (MQ=255) cAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTctg > 3:297404/1‑149 (MQ=255) ggAAAGGTTGGTAACGGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCACCTCGCCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGTACACAGGGTctgct < 6:348643/149‑1 (MQ=255) tttGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGc > 4:272874/1‑149 (MQ=255) ttGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAgg > 8:262288/1‑134 (MQ=255) ttGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAgg < 7:262288/134‑1 (MQ=255) tGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCt < 3:272874/148‑1 (MQ=255) gTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGc < 3:39392/149‑1 (MQ=255) gATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTgg > 1:13803/1‑149 (MQ=255) gggCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCcgcg > 2:265671/3‑149 (MQ=255) gCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGgcggcacattgatcgctacggtttcaaacctttcctgccaagcattaaacctgtcagccaaaccgctgccctgcccacttggcgcctgcccttcctgctgccgttgaccaattc < 5:222286‑M2/149‑115 (MQ=255) gCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGTCAGGCTGAgg < 3:333003/128‑1 (MQ=255) gCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGTCAGGCTGAgg > 4:333003/1‑128 (MQ=255) cTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGgcggcacattgatcgctacggtttcaaacctttcctgccaagcattaaacctgtcagccaaaccgctgccctgcccacttggcgcctgcccttcctgctgccgt < 5:300339‑M2/138‑105 (MQ=255) cTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGgcggcacattgatcgctacggtttcaaacctttcctgccaagcattaaacctgtcagccaaaccgctgccctgcccacttggcgcctgcccttcctgctgccgt > 6:300339‑M2/1‑34 (MQ=255) cAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCAt < 6:10476/147‑1 (MQ=255) cAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCAt < 1:178859/147‑1 (MQ=255) gcAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTgg < 2:13803/149‑1 (MQ=255) ccAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTca > 1:185884/1‑149 (MQ=255) cAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTcac < 4:297404/149‑1 (MQ=255) cGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTTGGGCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGAcc > 1:87335/1‑148 (MQ=255) cGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCAt < 1:114271/126‑1 (MQ=255) cGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCAt > 2:114271/1‑126 (MQ=255) cGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCa > 2:161912/1‑149 (MQ=255) aaCTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGc > 1:34730/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGt < 6:295803/132‑1 (MQ=255) | TCGAATTGGTCAACGGCAGCAGGAAGGGCAGGCGCCAAGTGGGCAGGGCAGCGGTTTGGCTGACAGGTTTAATGCTTGGCAGGAAAGGTTTGAAACCGTAGCGATCAATGTGCCGCTGCAGTTGGCGCAACCAGTCTGCCGGCAACTCGGCGGCCTCATCGGTATGGCTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTT‑GTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGC > NC_002947/3608669‑3608960 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |