New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4033194 = | 64 (1.210) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.1% | coding (832/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor |
? | NC_002947 | 4033241 = | 50 (0.990) | coding (879/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor |
CGACTATGGCAACAGCCTGGCATGGCGCAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTCGCCGCCGCCCGGCAAGGGCTGACGCCCTCCCCGCCTTACAA > NC_002947/4033094‑4033389 | cgacTATGGCAACAGCCTGGCATGGCGCAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCa > 6:86239/1‑149 (MQ=255) agcacggtgctgccgtccttgctgcgggtcaggtagaccggcaggactttgggcaggttgttgaccaggcgccccacttcccgggtgttgtagatgCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTa > 7:86437‑M1/97‑149 (MQ=255) tGGCAACAGCCTGGCATGGCGCAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTac < 1:240914/148‑1 (MQ=255) tGGCAACAGCCTGGCATGGCGCAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTac < 5:8907/148‑1 (MQ=255) aaCAGCCTGGCATGGCGCAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAacac > 6:227539/1‑149 (MQ=255) aaggCGCAGCCGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCCCTGCTACTCGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGCGAAgagc > 8:154185/3‑146 (MQ=255) aTGGCGCAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTgg < 7:73351/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTgg < 5:86239/149‑1 (MQ=255) tGGCGCAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTggg < 7:174661/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGgc > 5:278401/1‑149 (MQ=255) aGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCt < 6:278401/149‑1 (MQ=255) gCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTc < 5:227539/149‑1 (MQ=255) gCAAGCTGGTGCTAGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTc < 6:245133/149‑1 (MQ=255) aGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTcaac < 4:320426/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGTCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCt > 5:76354/1‑141 (MQ=255) gCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCt < 6:76354/141‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTcaaca < 7:113554/149‑1 (MQ=255) tGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTg > 8:12786/1‑149 (MQ=255) tCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGcc > 7:188257/1‑148 (MQ=255) gACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTggg < 5:235466/125‑1 (MQ=255) gACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTggg > 6:235466/1‑125 (MQ=255) tttgggcaggttgttgaccaggcgccccacttcccgggtgttgtagatgCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCa > 4:185911‑M1/50‑98 (MQ=255) tttgggcaggttgttgaccaggcgccccacttcccgggtgttgtagatgCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCa < 3:185911‑M1/49‑1 (MQ=255) ccTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTcc > 1:28518/1‑149 (MQ=255) cTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCt > 8:149/1‑149 (MQ=255) cTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCt > 8:271424/1‑149 (MQ=255) aGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGc < 7:149/148‑1 (MQ=255) aGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGc < 7:271424/148‑1 (MQ=255) cTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGt < 7:12786/149‑1 (MQ=255) ggAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTc > 5:311683/1‑148 (MQ=255) aaCAGGCGCTGCGGGTGATCAACCGCTACCTCGAGGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCAAGCACCGGCCGCATTCGCATGAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGGGCCTGGTCTACAACCTGCCCATAGTCCTGCCGGTCTAc < 7:154185/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGa > 5:5857/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGa < 6:5857/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCg > 8:231401/1‑149 (MQ=255) ccGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCgcag < 3:319574/149‑1 (MQ=255) ccGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCgcag > 5:325200/1‑149 (MQ=255) ggTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGaa > 8:35513/1‑91 (MQ=255) ggTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGaa < 7:35513/91‑1 (MQ=255) ggTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGt < 6:6759/105‑1 (MQ=255) ggTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGt > 5:6759/1‑105 (MQ=255) cAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCACGGACg > 6:340760/1‑149 (MQ=255) ccGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGgca < 7:231401/149‑1 (MQ=255) ccTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCAcc < 6:325200/148‑1 (MQ=255) tagatgccgctgatgcgaatgcggccggtgctggcatcggccagtagcagcggCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCt > 7:86437‑M2/54‑149 (MQ=255) tgccgctgatgcgaatgcggccggtgctggcatcggccagtagcagcggCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCaaa < 3:185911‑M2/49‑1 (MQ=255) tgccgctgatgcgaatgcggccggtgctggcatcggccagtagcagcggCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCaaa > 4:185911‑M2/50‑98 (MQ=255) cccGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATc < 8:188257/149‑1 (MQ=255) cccGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATc > 6:290889/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTcg > 8:57145/1‑148 (MQ=255) aCTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTcg < 7:57145/148‑1 (MQ=255) cTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTcgcc > 5:97315/1‑149 (MQ=255) tGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTcgccg > 1:257651/1‑149 (MQ=255) cGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTg > 8:190001/1‑55 (MQ=255) cGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTg < 7:190001/55‑1 (MQ=255) ccGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTCGCCGCCGCCCGGCAAGGGc > 7:205200/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTCGCCGCCGCCCGGCAAGGGCt < 5:290889/149‑1 (MQ=255) ccGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTCGCCGCCGCCCGGCAAGGGCTGAc < 6:311683/149‑1 (MQ=255) gcggCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTCGCCGCCGCCCGGCAAGGGCTGACGCCCTCCCCGCCtt < 2:28518‑M2/145‑1 (MQ=255) cATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTCGCCGCCGCCCGGCAAGGGCTGACGCCCTCCCCGCCTTACaa < 8:86437/149‑1 (MQ=255) | CGACTATGGCAACAGCCTGGCATGGCGCAGCGGCAAGCTGGTGCTCGACAACCTGAGCCTGGAACAGGCGCTGCCGGTGATCAACCGCTACCTCGACGCCCCGCTGCTACTGGCCGATGCCAGCACCGGCCGCATTCGCATCAGCGGCATCTACAACACCCGGGAAGTGGGGCGCCTGGTCAACAACCTGCCCAAAGTCCTGCCGGTCTACCTGACCCGCAGCAAGGACGGCAGCACCGTGCTCAATCGCATCTCGCCGCCGCCCGGCAAGGGCTGACGCCCTCCCCGCCTTACAA > NC_002947/4033094‑4033389 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |