New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4116891 | 45 (0.850) | 4 (0.080) | 3/242 | NT | 8.4% | coding (36/456 nt) | iorA‑II | isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit alpha |
? | NC_002947 | = 4116933 | 44 (0.870) | coding (78/456 nt) | iorA‑II | isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit alpha |
ACCGGGGGACAACGTATTCCCCATGCAGATAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAGGTCACCACCATCGAGGCGATC > NC_002947/4116787‑4117080 | aCCGGGGGACAACGTATTCCCCATGCAGATAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATga < 8:186878‑M2/149‑3 (MQ=255) ggACAACGTATTCCCCATGCAGATAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTggg < 7:189294/149‑1 (MQ=255) ttCCCCATGCAGATAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCAGCGATGACCTGGGGCTGACCgg < 7:26828/148‑1 (MQ=255) ccccATGCAGATAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCAc > 2:214485/1‑149 (MQ=255) aGATAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATg > 8:85495/1‑149 (MQ=255) gATAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATgg < 7:186878/149‑1 (MQ=255) aTAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGc > 5:275127/1‑149 (MQ=255) tAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGAc > 1:156463/1‑132 (MQ=255) tAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGAc < 2:156463/132‑1 (MQ=255) aaCACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGCTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCg > 4:68008/1‑149 (MQ=255) acacAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCgg > 7:201007/1‑149 (MQ=255) aGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTg < 7:85495/149‑1 (MQ=255) aacCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTgc > 2:233969/1‑149 (MQ=255) aacCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTgc > 8:272379/1‑149 (MQ=255) aCGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCt < 7:272379/149‑1 (MQ=255) gggCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGt > 4:153756/1‑149 (MQ=255) aaaCCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCtg > 4:121655/1‑149 (MQ=255) aCCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCtggt < 8:201007/149‑1 (MQ=255) cGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAAt < 3:153756/147‑1 (MQ=255) gCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAAtgtg < 1:233969/149‑1 (MQ=255) cATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATgtgg > 2:20355/1‑149 (MQ=255) aTCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTg > 1:319665/1‑105 (MQ=255) aTCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTg < 2:319665/105‑1 (MQ=255) aTCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGc < 5:86626/141‑1 (MQ=255) aTCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGc > 6:86626/1‑141 (MQ=255) aTCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGCCGCCTCTTCGGAGCTGGTGGACGGCAATgtggt > 6:199733/1‑149 (MQ=255) tCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATgtggtg < 6:275127/149‑1 (MQ=255) cAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATgacctg > 3:58028‑M2/1‑64 (MQ=255) cAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATgacctg < 4:58028‑M2/70‑7 (MQ=255) cTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATgacctgataggtcttctggttgatgcgtagttccatggtttcacctgcccgtcacggttgttgtcgctgtgttttatctgcatggggaatacgttgt < 3:81928‑M2/149‑98 (MQ=255) cTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATgacctgataggtcttctggttgatgcgtagttccatggtttcacctgcccgtcacggttgttgtcgctgtgttttatctgcatggggaatac > 5:151941‑M2/1‑52 (MQ=255) cTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATgacctgataggtcttctggttgatgcgtagttccatggtttcacctgcccgtcacggttgttgtcgctgtgttttatctgcatggggaatac < 6:151941‑M2/144‑93 (MQ=255) tCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTAccc < 1:214485/149‑1 (MQ=255) gTCGTGGCGGACGCCGTCACGCCCCTGCTGTGGGTACTCCGCGATGACCTGGGGCTGTCGGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGGGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGt < 5:199733/149‑1 (MQ=39) gTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGt < 3:121655/149‑1 (MQ=255) gTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGt > 5:83672/1‑149 (MQ=255) ggCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTgg < 7:13478/47‑1 (MQ=255) ggCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTgg > 8:13478/1‑47 (MQ=255) gACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATgacctgataggtcttctggttgatgcgtagttccatggtttcacctgcccgtcacggttgttgtcgctgtgttttatctgcatggggaatacgttgtcccccggtgcagaaac > 4:81928‑M2/1‑36 (MQ=255) gCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATgtgg > 4:201991/1‑115 (MQ=255) gCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATgtgg < 3:201991/115‑1 (MQ=255) gCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGgtg > 5:113597/1‑137 (MQ=255) gCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGgtg < 6:113597/137‑1 (MQ=255) gCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTgtggtg < 7:74089/142‑1 (MQ=255) gCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTgtggtg > 8:74089/1‑142 (MQ=255) ccccTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGa < 3:68008/149‑1 (MQ=255) cccTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAg < 6:83672/149‑1 (MQ=255) gctgTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTgc > 2:96918/1‑104 (MQ=255) gctgTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTgc < 1:96918/104‑1 (MQ=255) gtgGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAGGTcacca > 3:61577/1‑149 (MQ=255) ggTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAGGTCAccacca > 8:270255/1‑149 (MQ=255) tAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAGGTCACCACCATc > 4:173390/1‑149 (MQ=255) aTCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAGGTCACCACCATCGa < 1:20355/149‑1 (MQ=255) tCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAGGTCACCACCATCGAg > 4:275423/1‑149 (MQ=255) gcgATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACg < 2:346329/78‑1 (MQ=255) gcgATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACg > 1:346329/1‑78 (MQ=255) gcgATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAGGTCACCACCATCGAGGc > 8:217538/1‑148 (MQ=255) aTGCCCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAGGTCACCACCATCGAGGCGATc < 7:217538/149‑1 (MQ=255) | ACCGGGGGACAACGTATTCCCCATGCAGATAAAACACAGCGACAACAACCGTGACGGGCAGGTGAAACCATGGAACTACGCATCAACCAGAAGACCTATCAGGTCGAGGCGGACGCCGACACGCCCCTGCTGTGGGTAATCCGCGATGACCTGGGGCTGACCGGCACCAAGTATGGCTGCGGCTTGGCCCAGTGCGGCGCCTGTTCGGTGCTGGTGGACGGCAATGTGGTGCGCGCCTGCGTTACCCCGGTGGCCGGTGTGGTGGGGCGTGAGGTCACCACCATCGAGGCGATC > NC_002947/4116787‑4117080 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |