| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3787977 | 34 (0.530) | 39 (0.610) +CCAACTGT |
33/246 | 1.2 | 52.7% | coding (658/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 3787978 = | 38 (0.560) | coding (657/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein | |||||
CGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGCCGA > NC_002947/3787835‑3788123 | cgcTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaact < 2:392950‑M1/149‑7 (MQ=255) gctgctCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactg > 1:19887‑M1/1‑142 (MQ=255) ctgctCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgt < 6:420069‑M1/149‑9 (MQ=255) ctCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtc < 5:243803‑M1/147‑10 (MQ=255) tCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTACACGACGCCGACAGCGGCAAGTTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGACATCTTACCAACTGTCTTCAcc > 6:249562/1‑149 (MQ=255) ccGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtctt < 1:239703‑M1/149‑20 (MQ=255) ccGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtctt > 1:70421‑M1/1‑130 (MQ=255) ccGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGtt < 7:110588/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCa < 3:83740/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTACCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGG‑CGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggtt > 8:184125‑M1/1‑122 (MQ=255) ccGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGGAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggtt < 2:70421‑M1/149‑28 (MQ=255) ccGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCgg > 2:23793/1‑149 (MQ=255) ggTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgg > 5:413364‑M1/1‑114 (MQ=255) ggTGCGGTAGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGTCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAg > 5:38402/1‑149 (MQ=255) ggTCGTCGTTTTCCAGGCCAAAGGATAGCAGGTCAATGTTCCACGAAGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAAt < 5:249562/149‑1 (MQ=255) ggTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAAt > 5:65861/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcac < 1:411510‑M1/149‑42 (MQ=255) gtcgGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCAt > 4:268727/1‑149 (MQ=255) cgGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTACCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGG‑CGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaa < 7:184125‑M1/149‑48 (MQ=255) ccAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGGTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCtt < 3:234647/148‑1 (MQ=255) ggCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatc > 8:127777‑M1/1‑94 (MQ=255) aaaGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagctt > 6:201810‑M1/1‑90 (MQ=255) ggCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtc < 2:292605‑M1/104‑18 (MQ=255) ggCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtc < 8:200454‑M1/104‑18 (MQ=255) ggCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtc > 1:292605‑M1/1‑87 (MQ=255) ggCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtc > 7:200454‑M1/1‑87 (MQ=255) gCTAGCAGGTCCATGGTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGTCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgt < 5:24415‑M1/149‑64 (MQ=255) tAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaat < 5:280344‑M1/132‑49 (MQ=255) tAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaat > 6:280344‑M1/1‑84 (MQ=255) gCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCttgagg < 6:65861/149‑1 (MQ=255) aGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGTCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCttgaggtt < 6:38402/149‑1 (MQ=255) cATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgag > 5:183206‑M1/1‑75 (MQ=255) cATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttga < 8:225239‑M1/148‑74 (MQ=255) cACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgagg < 2:19887‑M1/149‑82 (MQ=255) cACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcaca > 4:76136‑M1/1‑68 (MQ=255) cACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcaca < 3:76136‑M1/110‑43 (MQ=255) acgacgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtcc > 5:167039‑M1/1‑67 (MQ=255) acgacgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtcc < 6:167039‑M1/132‑66 (MQ=255) gacgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctg > 8:178874‑M1/1‑65 (MQ=255) gacgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCAc > 3:71649/1‑149 (MQ=255) acgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACg > 8:114466/1‑149 (MQ=255) aCAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTc > 6:397823/1‑148 (MQ=255) cAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcac < 5:201810‑M1/149‑93 (MQ=255) aGCGGCAAGGTGCGGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGat < 5:318608/149‑2 (MQ=255) gCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAg < 4:63360/149‑1 (MQ=255) gCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTc < 3:268727/149‑1 (MQ=255) tGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCg > 8:30058/1‑148 (MQ=255) gCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGGGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGa > 6:163448/1‑149 (MQ=255) gTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgagtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcag > 1:385019‑M1/1‑42 (MQ=255) tAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGtt < 3:346981/149‑1 (MQ=255) agagGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTc > 8:216239/1‑149 (MQ=255) agagGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCACACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTc > 5:126420/1‑149 (MQ=255) gagGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTc < 7:216239/148‑1 (MQ=255) cGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGcgcg > 7:84730/1‑149 (MQ=255) gTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgtt > 7:306594‑M1/1‑33 (MQ=255) gTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGt > 6:189849/1‑149 (MQ=255) gTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCAACGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgtt > 1:8413‑M1/1‑33 (MQ=255) tAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttc > 5:68221‑M1/1‑32 (MQ=255) gAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcgg < 7:127777‑M1/149‑120 (MQ=255) tttGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCgg > 7:232258/1‑148 (MQ=255) tttGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCgg > 7:205210/1‑148 (MQ=255) tttGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGt < 7:30058/149‑1 (MQ=255) tttGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGt < 1:23793/149‑1 (MQ=255) tGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTa < 8:84730/148‑1 (MQ=255) aTGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCACACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAgg < 6:126420/148‑1 (MQ=255) gttgttgCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcggcgcgtcgcggt < 7:178874‑M1/148‑131 (MQ=255) gttgttgCTGCCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcggcgcgtcgcgg > 8:276043‑M1/1‑18 (MQ=255) gttgttgCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGGGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGAcc < 5:163448/148‑1 (MQ=255) ttgttgCTGCCAACGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcggcgcgtcgcggtag < 2:8413‑M1/149‑133 (MQ=255) gttgCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAaca > 4:265623/1‑149 (MQ=255) tgctgcCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACAcc > 6:102903/1‑149 (MQ=255) tgcCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgcggctggcgcgcacgtcgtcgaagctcaggcggatgttcggcgcgtcgcggtaggtgacc > 7:304967‑M1/1‑10 (MQ=255) tgcCATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcggcgcgtcgcggtaggtgacc > 4:69473‑M1/1‑10 (MQ=255) gcCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCaa > 6:305018/1‑141 (MQ=255) gcCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCaa < 5:305018/141‑1 (MQ=255) ccATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTc < 5:397823/149‑1 (MQ=255) cATCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcggcgcgtcgcggtaggtgaccaaca > 6:146912‑M1/1‑7 (MQ=255) aTCGTCccaactgtccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggctggcgcgcacgccgtcgaagctcaggcggatgttcggcgcgtcgcggtaggtgaccaacac > 4:174754‑M1/1‑6 (MQ=255) tCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGccag > 1:349434/1‑146 (MQ=255) | CGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTCGGCGCGTCGCGGTAGGTGACCAACACCTGGTCGCCGA > NC_002947/3787835‑3788123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |