New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1088549 | 72 (0.980) | 7 (0.110) | 7/250 | 8.6 | 10.1% | intergenic (+45/‑209) | pmbA/PP_0943 | regulatory protease/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1088586 | 60 (0.900) | intergenic (+82/‑172) | pmbA/PP_0943 | regulatory protease/hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTTCATCACCTTTTTCTT > NC_002947/1088405‑1088694 | gTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacaacgg > 2:155435/1‑145 (MQ=255) gTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACgg < 7:217997/148‑1 (MQ=255) gTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGATGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACgg > 8:217997/1‑148 (MQ=255) ttCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACggtg > 7:341319/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACggt < 1:212840/148‑1 (MQ=255) tctagcagATTGTCGCGATCGGGAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACggtg < 2:91596/145‑1 (MQ=255) cagcagATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACggtggt < 8:226526/148‑1 (MQ=255) agcagATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGTGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGTG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGgtggtg < 7:401156/148‑1 (MQ=255) agcagATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGtggtgg < 2:247701/149‑1 (MQ=255) gcagATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGTG‑CCGGACCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGgaggtg > 8:401156/1‑147 (MQ=255) gTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACAt > 7:135911/1‑149 (MQ=255) cgATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCgg < 1:106413/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTg < 1:422186/148‑1 (MQ=255) ggTAGCGATATTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGGGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGTGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTg < 3:303044/148‑1 (MQ=255) tAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGa > 4:20962/1‑148 (MQ=255) cTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGa > 1:374724/1‑141 (MQ=255) cTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGa < 2:374724/141‑1 (MQ=255) ttGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCg > 3:156163/1‑149 (MQ=255) gAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGCGCGGATGACCGTTGCAGGTAGCTGAAATTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGAGCCGGTGCTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCggg > 8:107499/1‑147 (MQ=255) gAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGc < 8:286496/145‑1 (MQ=255) aaCCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTg < 8:57025/148‑1 (MQ=255) aCCCGTAGCAATATTCATATGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTa < 3:390799/149‑1 (MQ=255) cccGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAg < 3:20962/149‑1 (MQ=255) cAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCggg < 5:423820/149‑1 (MQ=255) atatTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGtt < 8:341319/149‑1 (MQ=255) atTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCa > 7:34557/1‑149 (MQ=255) ttCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTg < 6:367286/120‑1 (MQ=255) ttCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTg > 5:367286/1‑120 (MQ=255) tACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAgg < 3:19249/124‑1 (MQ=255) tACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAgg > 4:19249/1‑124 (MQ=255) tACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCAc < 6:397766/145‑1 (MQ=255) tACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCAc > 5:397766/1‑145 (MQ=255) aCGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGAcaca > 2:126635/1‑121 (MQ=255) aCGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGAcaca < 1:126635/121‑1 (MQ=255) gtTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGGGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCgg > 2:175492/1‑148 (MQ=255) ttGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGaa > 1:267187/1‑149 (MQ=255) gCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTa > 4:237766/1‑149 (MQ=255) gATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTacac < 3:237766/149‑1 (MQ=255) aTGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACAcc < 7:130064/149‑1 (MQ=255) tGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCt < 3:33460/149‑1 (MQ=255) cTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGc < 2:267187/148‑1 (MQ=255) cTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGc < 1:175492/148‑1 (MQ=255) aGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTAACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAAtac > 4:227539/1‑147 (MQ=255) cTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCg > 4:307352/1‑148 (MQ=255) tGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCg > 4:80623/1‑147 (MQ=255) aTCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGaa < 6:401148/147‑1 (MQ=255) tCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTTCACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACCCAGGCCGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAACTCCGAA‑GAc > 1:97860/1‑149 (MQ=255) cTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGc > 4:336273/1‑119 (MQ=255) cTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGc < 3:336273/119‑1 (MQ=255) tttAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GAccc > 7:97772/1‑149 (MQ=255) tttAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTACCTGCAAATCCGAA‑GAccc > 8:164545/1‑149 (MQ=255) tttAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCCGGGTAGGACACAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTGACCCGCGCAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTGTCCCTGCAAATCCGAA‑GAccc > 4:307395/1‑149 (MQ=38) aGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGaa < 8:73023/111‑1 (MQ=255) aGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGaa > 7:73023/1‑111 (MQ=255) tGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTc > 2:246348/1‑149 (MQ=255) ccTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGt > 5:312696/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCGCGAGGGCCGGGtcttc < 8:97772/148‑2 (MQ=37) ggTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTtc < 2:362451/149‑1 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACAAAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTAttt > 3:320189/1‑148 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACGGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTtcat > 4:226632/1‑148 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAAGGACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTtcatc < 1:268594/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTGGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTTCATCAc < 7:107499/149‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTTCATCAcc > 3:339683/1‑149 (MQ=255) cTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTTCATCAGCTTTTTCt > 2:376207/1‑149 (MQ=255) cTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTTCATCACCTTTTTCt > 4:224724/1‑149 (MQ=255) tACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCg > 2:173499/1‑72 (MQ=255) tACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCg < 1:173499/72‑1 (MQ=255) tACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTTCATCACCTTTTTCtt > 8:263934/1‑149 (MQ=255) acacGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGttt < 7:284480/127‑1 (MQ=255) acacGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGttt > 8:284480/1‑127 (MQ=255) acacGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTTCATCACCTTTTTCtt > 4:423104/1‑148 (MQ=255) cacGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCg > 3:285034/1‑70 (MQ=255) cacGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCg < 4:285034/70‑1 (MQ=255) | GTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCG‑CCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAA‑GACCCGGCCCTCGCGCCGGGTTTTTATTTCATCACCTTTTTCTT > NC_002947/1088405‑1088694 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |