New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 437159 | 45 (0.760) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 7.8% | coding (129/888 nt) | PP_0358 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 437191 | 52 (0.930) | coding (97/888 nt) | PP_0358 | membrane protein |
ACACGTAGGTCAGCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGTGCATGCAGAATCCTTGCTTAGGT > NC_002947/437014‑437306 | acacGTAGGTCAGCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCAcc > 4:281035/1‑149 (MQ=255) cGTAGGTCAGCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCgg < 2:62564/149‑1 (MQ=255) gTAGGTCAGCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGt < 5:263602/149‑1 (MQ=255) gTAGGTCAGCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGt < 6:25165/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGa < 4:18889/149‑1 (MQ=255) aGCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGTCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGACCACCCGGTGGACAAt < 2:199292/149‑1 (MQ=255) aGCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAAt < 2:355490/149‑1 (MQ=255) gCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATg < 7:27270/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGAtct > 5:255355/1‑149 (MQ=255) aGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCgtcccggcggtggagatcattgtccaccgggt > 3:149123‑M1/1‑117 (MQ=255) aGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGa < 2:124283/148‑1 (MQ=255) tGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGGAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACgc < 1:258420‑M2/149‑3 (MQ=255) ccccGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACgctc < 7:50237‑M2/149‑5 (MQ=255) ccGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCgtcccggcggtggagatcattgtccaccgggtgctctg < 4:149123‑M1/149‑39 (MQ=255) aGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGc > 7:114778/1‑149 (MQ=255) aGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGc < 1:335125/149‑1 (MQ=255) ccAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCtt > 6:322167/1‑148 (MQ=255) aGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGaa < 5:301579/149‑1 (MQ=255) ggATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAg > 7:1303/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCgtcccggcggtggagatcattgtccaccgggtgctctggtca < 2:362916‑M1/130‑43 (MQ=255) ccGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCgtcccggcggtggagatcattgtccaccgggtgctctggtca > 1:362916‑M1/1‑88 (MQ=255) cgcgGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAg < 8:50237/149‑1 (MQ=255) ggTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGccc < 8:319832/149‑1 (MQ=255) gcgcAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAgatga > 2:319736/1‑149 (MQ=255) gcgcAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAgatg < 6:255355/148‑1 (MQ=255) gcAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAgatgatc > 8:197130/1‑148 (MQ=255) gcAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGatgatg < 2:258420/149‑1 (MQ=255) ttCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGatgatg > 4:6170/1‑145 (MQ=255) ttCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTa < 3:6170/147‑1 (MQ=255) ccaccaGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGG‑CCCAGATGATGTAGGCGCTCaa < 4:352751/149‑1 (MQ=255) accaGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAg > 3:190959/1‑149 (MQ=255) ccGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGATAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCAAg > 8:302571/1‑149 (MQ=255) gggTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTAt < 4:190959/149‑1 (MQ=255) ggTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATg > 4:168656/1‑149 (MQ=255) ggTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATg < 8:1303/149‑1 (MQ=255) tttCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCaa < 4:199878/135‑1 (MQ=255) tttCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCaa > 3:199878/1‑135 (MQ=255) ccACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATCGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCcgc > 6:107726/1‑149 (MQ=255) cacaCCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCAACGCCGTGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGG‑AAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGa < 6:75728/149‑1 (MQ=255) acCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGAcg > 5:17429/1‑149 (MQ=255) cAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGAcgcg > 6:12724/1‑149 (MQ=255) gcagcagcGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGTCGCGGGtac < 1:319736/149‑3 (MQ=255) gcagcGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTgcg > 7:336322/1‑149 (MQ=255) cGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGt < 8:336322/149‑1 (MQ=255) cGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGt < 8:114778/149‑1 (MQ=255) cGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCACTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGt > 3:318962/1‑149 (MQ=255) gAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGtgcatgc < 7:197130/149‑1 (MQ=255) tGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACgctctggtcagcactgttcggctcgctgctgctactggtgtggaaacaccccggctggtggcgtgaactgcgcaacaacccgcgccgg > 1:362916‑M2/1‑42 (MQ=255) tGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACgctctggtcagcactgttcggctcgctgctgctactggtgtggaaacaccccggctggtggcgtgaactgcgcaacaacccgcgccgg < 2:362916‑M2/130‑89 (MQ=255) tGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCGCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGTGCATGCAGAATCCtt > 7:237194/1‑149 (MQ=255) aCCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGTGCATGCAGAATCCTTGc < 3:168656/149‑1 (MQ=255) cAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACgctctggtcagcactgttcggctcgctgctgctactggtgtggaaacaccccggctggtggcgtgaactgcgcaacaacccgcgccggctgggcatcctggcactgagcgg < 4:149123‑M2/149‑112 (MQ=255) cAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGTGCATGCAGAATCCTTGCt > 5:73721/1‑148 (MQ=255) cAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGTGCATGCAGAATCCTTGCt > 2:47766/1‑148 (MQ=255) cAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCACTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGTGCATGCAGAATCCTTGCtt < 4:318962/149‑1 (MQ=255) gagCgtcccggcggtggagatcattgtccaccgggtgctctggtcagcactgttcggctcgctgctgctactggtgtggaaacaccccggctggtggcgtgaactgcgcaacaacccgcgccggctgggcatcctggcactgagcgggg < 7:50237‑M1/149‑146 (MQ=255) agCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGTGCATGCAGAATCCTTGCTTAgg < 5:322167/149‑1 (MQ=255) gCgtcccggcggtggagatcattgtccaccgggtgctctggtcagcactgttcggctcgctgctgctactggtgtggaaacaccccggctggtggcgtgaactccgcaacaacccgcgccggctgggcatcctggcactgagcggggca < 1:258420‑M1/149‑148 (MQ=255) | ACACGTAGGTCAGCCAGTTGCCGGCGATCAGTGCCCCGCTCAGTGCCAGGATGCCCAGCCGGCGCGGGTTGTTGCGCAGTTCACGCCACCAGCCGGGGTGTTTCCACACCAGTAGCAGCAGCGAGCCGAACAGTGCTGACCAGAGCACCCGGTGGACAATGATCTCCACCGCCGGGACGCTCTGGATTGCCTTGAAGTAGAGGGGGAAAAGGCCCCAGATGATGTAGGCGCTCAAGCCCAGTATGTACCCGCGACGCGGGTTTGCGGCGTGCATGCAGAATCCTTGCTTAGGT > NC_002947/437014‑437306 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |