New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 821949 = | 46 (0.780) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 6.6% | coding (1320/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 821986 = | 42 (0.750) | coding (1357/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
GCACCCTGCGCAAGCATGACCTGGAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAG > NC_002947/821801‑822092 | gcACCCTGCGCAAGCATGACCTGGAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTgg < 6:97825/149‑1 (MQ=255) gcACCCTGCGCAAGCATGACCTGGAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTgg < 4:313164/149‑1 (MQ=255) cACCCTGCGCAAGCATGACCTGGAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTggg < 3:136805/149‑1 (MQ=255) cagcacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctgatggcgaggcgccaggcccagggtcgacgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagcagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTCa > 3:248641‑M1/145‑149 (MQ=255) cacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctgatggcgaggcgccaggcccagggtcgacgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagacagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTc > 1:50543‑M1/143‑146 (MQ=255) cacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctgatggcgaggcgccaggcccagggtcgacgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagcagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTc < 2:50543‑M1/4‑1 (MQ=255) acgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctgatggcgaggcgccaggcccagggtcgacgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagcagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTCAGc < 3:198359‑M1/7‑1 (MQ=255) gCATGACCTGGAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGa < 3:167009/149‑1 (MQ=255) cATGACCTGGAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGAt < 1:351621/149‑1 (MQ=255) cATGACCTGGAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGAt > 5:109588/1‑149 (MQ=255) gAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCtgtg < 7:294775/148‑1 (MQ=255) gAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGc < 4:350643/149‑1 (MQ=255) aGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGcc < 1:43805/149‑1 (MQ=255) cccGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACt < 6:109588/149‑1 (MQ=255) cccGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACt > 1:237942/1‑149 (MQ=255) ccGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGt < 4:216605/122‑1 (MQ=255) ccGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGt > 3:216605/1‑122 (MQ=255) gACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGc > 6:121836/1‑149 (MQ=255) gACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCAGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGc > 2:220736/1‑149 (MQ=255) cGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACcttct > 1:79328/1‑149 (MQ=255) gggCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACcttctt > 2:25317/1‑149 (MQ=255) cggcgcctgatggcgaggcgccaggcccagggtcgacgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagcagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCg > 6:230568‑M1/103‑149 (MQ=255) aTCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGa > 1:39602/1‑149 (MQ=255) aTCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATCTCCT‑CACCTCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGc < 7:71109/147‑1 (MQ=255) tCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGAc > 7:164709/1‑149 (MQ=255) tCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGAc > 7:306233/1‑149 (MQ=255) cGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGc < 5:121836/148‑1 (MQ=255) ggcATCTAGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGTCTAGCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCct < 8:281815/147‑1 (MQ=255) gTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAAccc < 6:14255/148‑1 (MQ=255) tCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCctg < 2:237942/149‑1 (MQ=255) tCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCctg < 1:317946/149‑1 (MQ=255) gCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTCCCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACTTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGc > 6:98900/1‑149 (MQ=255) gTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCTGCACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGa > 1:276660/1‑149 (MQ=255) gTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCt < 3:30328/89‑1 (MQ=255) gTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCt > 4:30328/1‑89 (MQ=255) gTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGAc < 2:291039/121‑1 (MQ=255) gTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGATGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGAc > 1:291039/1‑121 (MQ=255) gATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGc > 6:175241/1‑149 (MQ=255) acgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagcagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACct > 5:371895‑M1/68‑108 (MQ=255) acgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagcagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACct < 6:371895‑M1/41‑1 (MQ=255) aTCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGcc > 3:285900/1‑149 (MQ=255) ctgGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGt < 8:306233/147‑1 (MQ=255) gCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGc < 1:25317/147‑1 (MQ=255) aCTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTgg > 2:244300/1‑149 (MQ=255) tCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCAGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTg > 7:331894/1‑149 (MQ=255) ccGGCTACGTGACACTAGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGTTCAGACTGGTGATAACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCTGCGACCTGTGGGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTggag < 2:79328/149‑3 (MQ=255) ggCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACTTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTc < 5:98900/149‑1 (MQ=255) tGACACTCTCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGTGTCAGCCTGTTGATCACCTGTGCCTACTTGCTTACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCTAAACCCTGCTTTCGCCGCGTCAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTg < 4:285900/149‑1 (MQ=255) gACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGt < 8:140363/124‑1 (MQ=255) gACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGt > 7:140363/1‑124 (MQ=255) cTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCt < 1:220736/149‑1 (MQ=255) gCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGgc < 8:164709/149‑1 (MQ=255) cTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGTCCTGgcgc < 3:288195/149‑1 (MQ=255) tttCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTc < 2:39602/149‑1 (MQ=255) t‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCAt > 4:198359/1‑149 (MQ=255) t‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCAt > 5:11275/1‑149 (MQ=255) aCCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCa < 1:244300/149‑1 (MQ=255) aCCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCAGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATc < 8:331894/148‑1 (MQ=255) ttgtGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAg > 3:154399/1‑149 (MQ=255) | GCACCCTGCGCAAGCATGACCTGGAGCGCCCGACGGGCCTGGCCGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAG > NC_002947/821801‑822092 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |