New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 821949 = | 46 (0.780) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 6.6% | coding (1320/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 821986 = | 42 (0.750) | coding (1357/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
CGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCT > NC_002947/821844‑822134 | cGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACcttct > 1:79328/1‑149 (MQ=255) gggCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACcttctt > 2:25317/1‑149 (MQ=255) cggcgcctgatggcgaggcgccaggcccagggtcgacgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagcagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCg > 6:230568‑M1/103‑149 (MQ=255) aTCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGa > 1:39602/1‑149 (MQ=255) aTCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATCTCCT‑CACCTCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGc < 7:71109/147‑1 (MQ=255) tCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGAc > 7:164709/1‑149 (MQ=255) tCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGAc > 7:306233/1‑149 (MQ=255) cGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGc < 5:121836/148‑1 (MQ=255) ggcATCTAGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGTCTAGCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCct < 8:281815/147‑1 (MQ=255) gTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAAccc < 6:14255/148‑1 (MQ=255) tCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCctg < 1:317946/149‑1 (MQ=255) tCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCctg < 2:237942/149‑1 (MQ=255) gCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTCCCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACTTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGc > 6:98900/1‑149 (MQ=255) gTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCTGCACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGa > 1:276660/1‑149 (MQ=255) gTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGAc < 2:291039/121‑1 (MQ=255) gTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGATGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGAc > 1:291039/1‑121 (MQ=255) gATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGc > 6:175241/1‑149 (MQ=255) acgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagcagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACct > 5:371895‑M1/68‑108 (MQ=255) acgccagtgccaggccaccgggctgtcggggcgacagcagggtttcgcacaggtcgccgaagaaggtGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACct < 6:371895‑M1/41‑1 (MQ=255) aTCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGcc > 3:285900/1‑149 (MQ=255) ctgGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGt < 8:306233/147‑1 (MQ=255) gCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGc < 1:25317/147‑1 (MQ=255) aCTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTgg > 2:244300/1‑149 (MQ=255) tCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCAG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTg > 7:331894/1‑149 (MQ=255) ccGGCTACGTGACACTAGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGTTCAGACTGGTGATAACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCTGCGACCTGTGGGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTggag < 2:79328/149‑3 (MQ=255) ggCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACTTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTc < 5:98900/149‑1 (MQ=255) tGACACTCTCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGTGTCAGCCTGTTGATCACCTGTGCCTACTTGCTTACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCTAAACCCTG‑CTTTCGCCGCGTCAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTg < 4:285900/149‑1 (MQ=255) gACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGt > 7:140363/1‑124 (MQ=255) gACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGt < 8:140363/124‑1 (MQ=255) cTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCt < 1:220736/149‑1 (MQ=255) gCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGgc < 8:164709/149‑1 (MQ=255) cTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGTCCTGgcgc < 3:288195/149‑1 (MQ=255) tttCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTc < 2:39602/149‑1 (MQ=255) t‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCAt > 5:11275/1‑149 (MQ=255) t‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCAt > 4:198359/1‑149 (MQ=255) aCCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCa < 1:244300/149‑1 (MQ=255) aCCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCAG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATc < 8:331894/148‑1 (MQ=255) cgaagaaggtggtcagcaagtaggcacaggtgatcaccaggctgaccACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCaggcgccg > 6:230568‑M2/48‑147 (MQ=255) ttgtGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAg > 3:154399/1‑149 (MQ=255) aggtggtcagcaagtaggcacaggtgatcaccaggctgaccACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGt < 6:371895‑M2/67‑1 (MQ=255) aggtggtcagcaagtaggcacaggtgatcaccaggctgaccACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGt > 5:371895‑M2/42‑108 (MQ=255) cTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGc > 2:276795/1‑149 (MQ=255) tGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGc < 2:287001/133‑1 (MQ=255) tGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGc > 1:287001/1‑133 (MQ=255) tCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATc < 6:11275/149‑1 (MQ=255) tgtgCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCg > 8:271127/1‑149 (MQ=255) cTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTg > 7:142102/1‑149 (MQ=255) cTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTg > 2:344077/1‑149 (MQ=255) tACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGt > 5:176215/1‑149 (MQ=255) ttGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGt > 1:325096/1‑149 (MQ=255) gctgaccACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGt < 3:198359‑M2/140‑1 (MQ=255) tgaccACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTg > 3:248641‑M2/6‑149 (MQ=255) gaccACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTGTCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTg > 1:50543‑M2/5‑146 (MQ=255) gaccACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTg < 2:50543‑M2/141‑1 (MQ=255) accTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCt > 4:100813/1‑149 (MQ=255) | CGGGCTGATCCCGTTCGTGATGGTCATCTGGCTGACGTTGATCCTGCTGGCACTGCTCACCGGCTACCTGACACTCGCCTATTTCCT‑CACCGCCAAGCTGTTGTGGGTCAGCCTGGTGATCACCTGTGCCTACTTGCTGACCACCTTCTTCGGCGACCTGTGCGAAACCCTG‑CTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCT > NC_002947/821844‑822134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |