New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 893783 | 65 (1.100) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 5.7% | coding (266/303 nt) | PP_0775 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 893871 | 71 (1.250) | coding (178/303 nt) | PP_0775 | hypothetical protein |
CAAGGTGCGCACCAGGCCCAGGCTGATCGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCC > NC_002947/893637‑893929 | cAAGGTGCGCACCAGGCCCAGGCTGATCGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCAc < 2:158716/149‑1 (MQ=255) aGGTGCGCACCAGGCCCAGGCTGATCGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCAc > 1:212125/1‑147 (MQ=255) aGGTGCGCACCAGGCCCAGGCTGATCGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCa < 4:343419/149‑1 (MQ=255) caacaggctcaggcGGAGAGTAGTTAGGCCGACAGGTATTTCTGTGGGCGCTATGAAAACTGGCTGCATGCTTGCTTCTCGTTATCCGCGGTGCTAGTAATTATCGGTAAAGTGTAGCGGTATCGGCCCATTGTGCGCACCAGCCGCaa < 8:83734/146‑1 (MQ=255) aCCAGGCCCAGGCTGATCGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAg > 3:287453/1‑149 (MQ=255) caggcccaggcTGATCGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGc > 3:174974/1‑148 (MQ=255) caggcTGATCGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGc > 8:76876/1‑149 (MQ=255) cTGATCGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGc < 4:230912/149‑1 (MQ=255) cGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGAtg > 4:273850/1‑149 (MQ=255) cGAAGTCAGGCAGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTATGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGAt < 4:5300/148‑1 (MQ=255) tCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTg > 2:244775/1‑149 (MQ=255) tCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTg > 4:155133/1‑149 (MQ=255) ggCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTgcg > 2:211208/1‑148 (MQ=255) cGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCcaccagccgccgtggcaggcacgcccctgggtgctcgacc > 5:146741‑M1/1‑109 (MQ=255) acCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTtgt < 8:326883/149‑1 (MQ=255) ccAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTtgtg < 5:266789/149‑1 (MQ=255) cAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCcaccagccgccgtggcaggcacgcccctgggtgctcgacccggca > 4:9072‑M1/1‑103 (MQ=255) cAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGc > 4:205056/1‑149 (MQ=255) cAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGc > 3:92640/1‑149 (MQ=255) 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aaTGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGAAAGCGAAAGGCTGGACGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAg > 3:338464/1‑149 (MQ=255) aaaaaTGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGc > 1:241767/1‑149 (MQ=255) tCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGtgcctg < 7:337205/149‑1 (MQ=255) gCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCAc > 8:211131/1‑75 (MQ=255) gCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCAc < 7:211131/75‑1 (MQ=255) gCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCa > 5:171006/1‑149 (MQ=255) aTGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCAcg > 3:326430/1‑149 (MQ=255) gCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCAcggc > 4:278530/1‑149 (MQ=255) cTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCtg < 3:273850/149‑1 (MQ=255) cTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCtg < 5:176902/149‑1 (MQ=255) cTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCt < 5:75847/148‑1 (MQ=255) 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gTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGaaa < 6:171006/149‑1 (MQ=255) gTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGaaa < 3:278530/149‑1 (MQ=255) aGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTc < 1:230126/149‑1 (MQ=255) gggTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTcc < 3:205056/149‑1 (MQ=255) gcgcTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGacac > 4:226626/1‑149 (MQ=255) 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tgCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatt < 3:9072‑M2/149‑57 (MQ=255) tgCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTc > 6:324882/1‑149 (MQ=255) gcgcACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttattt < 6:146741‑M2/149‑58 (MQ=255) cgccaccagccgccgtggcaggcacgcccctgggtgctcgacccggcacaacgtgcgcaacacatcggccagcctttcgcttgcggctggtgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatttc < 2:230126‑M1/149‑147 (MQ=255) cgccaccagccgccgtggcaggcacgcccctgggtgctcgacccggcacaacgtgcgcaacacatcggccagcctttcgcttgcggctggtgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatttc < 8:303007‑M1/149‑147 (MQ=255) cgcACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTcc < 2:98714/149‑1 (MQ=255) ccaccagccgccgtggcaggcacgcccctgggtgctcgacccggcacaacgtgcgcaacacatcggccagcctttcgcttgcggctggtgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatttc > 2:339815‑M1/1‑1 (MQ=255) | CAAGGTGCGCACCAGGCCCAGGCTGATCGAAGTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCC > NC_002947/893637‑893929 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |