New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 893783 | 65 (1.100) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 5.7% | coding (266/303 nt) | PP_0775 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 893871 | 71 (1.250) | coding (178/303 nt) | PP_0775 | hypothetical protein |
CTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTACACTTGTCCGCT > NC_002947/893723‑894017 | ctcGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCtggtg > 4:332360/1‑149 (MQ=255) gAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGgcg < 8:303007‑M2/149‑4 (MQ=255) gAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGgcg < 2:230126‑M2/149‑4 (MQ=255) gAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGg > 2:339815‑M2/1‑146 (MQ=255) tAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAgg < 1:211208/149‑1 (MQ=255) tAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAgg < 4:92640/149‑1 (MQ=255) cGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCt < 2:137325/149‑1 (MQ=255) gTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGTGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTgg < 6:25170/149‑1 (MQ=255) gTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTgg < 4:287453/149‑1 (MQ=255) cAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTa < 4:326430/149‑1 (MQ=255) aGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTgg < 6:277927/144‑1 (MQ=255) aGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTgg > 5:277927/1‑144 (MQ=255) gAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCCGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑gg > 4:310938/1‑149 (MQ=255) aTTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCg > 7:194061/1‑149 (MQ=255) gCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCAc > 5:183209/1‑148 (MQ=255) cGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACg > 7:161836/1‑148 (MQ=255) gTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGaaa < 6:171006/149‑1 (MQ=255) gTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGaaa < 3:278530/149‑1 (MQ=255) 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ggCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGc < 7:303007/149‑1 (MQ=255) cccTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAg > 2:26295/1‑129 (MQ=255) cccTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAg < 1:26295/129‑1 (MQ=255) cccTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑ctt > 2:310115/1‑149 (MQ=255) cccTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑ctt < 1:310115/149‑1 (MQ=255) ccTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑cttc > 1:226433/1‑149 (MQ=255) ccTTCTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑cttc > 2:295444/1‑149 (MQ=255) ttGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGACGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGGACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑cttctt > 3:180569/1‑149 (MQ=255) ttGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGGTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGGAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCCCCCAGTGGC‑cttctt > 3:180571/1‑149 (MQ=255) tgCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatt < 3:9072‑M2/149‑57 (MQ=255) tgCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑‑GCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTc > 6:324882/1‑149 (MQ=255) 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cACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCg > 4:202911/1‑149 (MQ=255) aCGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGt > 1:228889/1‑149 (MQ=255) cGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTc < 4:338464/149‑1 (MQ=255) tgCCGGGTCGAGCACCCAGGGGGTTGCCACCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGGTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGAACCCCCCCCCAGTGGA‑CTTCTTCGTCCTGAAGAACGCGGATGAGCCGGCTGAGGGGCGGTTGCAGGTCtcccc > 7:56705/1‑145 (MQ=255) tgCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatttcgagaagcacgcatgcagacatttttcattgcgccgaccgactttg > 4:9072‑M2/1‑45 (MQ=255) 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tCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTc < 1:65549/134‑1 (MQ=255) tCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTc < 2:51952/149‑1 (MQ=255) gAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCAATTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTc < 1:295444/148‑1 (MQ=255) aGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGc > 7:139111/1‑148 (MQ=255) ccAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGGCCGCACGAAAGTTCCGCCCCCCAGTGGC‑CTGCTTCGTCGTGATGAACGCCGTTGATCCGCCTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCg > 1:81361/1‑149 (MQ=255) ccAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑cttct < 4:103106/82‑1 (MQ=255) ccAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑cttct > 3:103106/1‑82 (MQ=255) ccAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGAt < 6:203844/105‑1 (MQ=255) ccAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGAt > 5:203844/1‑105 (MQ=255) ccAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCg > 4:155894/1‑148 (MQ=255) ccAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCg > 4:292173/1‑148 (MQ=255) ggCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGAt < 3:292173/149‑1 (MQ=255) gCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATg < 4:179004/149‑1 (MQ=255) gTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCAACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATgg > 6:291765/1‑148 (MQ=255) tgcctgccACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCa < 2:81361/149‑1 (MQ=255) ctgccACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAgg < 6:183209/149‑1 (MQ=255) ccACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGtt < 4:179109/148‑1 (MQ=255) ccACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTa > 4:195974/1‑149 (MQ=255) cACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAA‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTa > 1:34555/1‑148 (MQ=255) aCGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTaca < 2:226433/149‑1 (MQ=255) cggcggCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTacac < 3:202911/149‑1 (MQ=255) gtggCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTACACTTGTCCGct > 4:153859/1‑149 (MQ=255) | CTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAT‑GGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGC‑CTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTACACTTGTCCGCT > NC_002947/893723‑894017 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |