New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1730772 = | 62 (1.050) | 4 (0.070) | 4/258 | NT | 6.4% | coding (316/1152 nt) | dapE | succinyl‑diaminopimelate desuccinylase |
? | NC_002947 | 1730807 = | 55 (0.950) | coding (281/1152 nt) | dapE | succinyl‑diaminopimelate desuccinylase |
TCGACCACCGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTACCGGGCCGTCCTGGCTGCCGT > NC_002947/1730627‑1730909 | tCGACCACCGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCggcggc > 5:150698/1‑149 (MQ=255) gagccgatgcgcattgaagacgtcgacaacttctgggccacccacggcagccaggacggcccggtactgtgttttgccggccacaccgacgtggtgcctaccggcccggtccagcaatggcagcatgaacccttcgaggcactgatCg > 5:165773‑M1/147‑148 (MQ=255) gACCACCGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGgcgc > 4:354987/1‑149 (MQ=255) gACCACCGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGgcgc > 5:124259/1‑149 (MQ=255) accaccGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCTGCGGCGcc < 6:162034/149‑1 (MQ=255) ccaccGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑a < 7:60127/149‑1 (MQ=255) caccGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑Ac < 1:873/149‑1 (MQ=255) accGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACg > 7:72236/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGATCGCTGGCGATGCCCATGGATGCCCGGGTGCCCTGAATGACGGCGgcgcaccgg > 8:234482/1‑144 (MQ=255) cGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGc < 8:31485/149‑1 (MQ=255) cGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGc > 2:24151/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATCTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCaga < 7:234482/148‑1 (MQ=255) ccGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCAt > 7:289035/1‑149 (MQ=255) gggCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTc < 7:127920/149‑1 (MQ=255) gCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCa < 4:214096/129‑1 (MQ=255) gCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCa > 3:214096/1‑129 (MQ=255) ccTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGAt < 8:289035/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGAt > 1:161145/1‑147 (MQ=255) tCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAg > 6:351676/1‑149 (MQ=255) ccacccacggcagccaggacggcccggtactgtgttttgccggccacaccgacgtggtgcctaccggcccggtccagcaatggcagcatgaacccttcgaggcactgatCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGCGCATGCCGTCGGCGTCGATCAg < 8:117660‑M1/40‑1 (MQ=255) ccTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCTTCGATCAg < 6:150698/148‑1 (MQ=255) cTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGt < 5:351676/148‑1 (MQ=255) tcgtcgCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGGTTGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTg > 1:250889/1‑149 (MQ=255) acccacggcagccaggacggcccggtactgtgttttgccggccacaccgacgtggtgcctaccggcccggtccagcaatggcagcatgaacccttcgaggcactgatCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCa < 7:199551‑M1/39‑1 (MQ=255) acccacggcagccaggacggcccggtactgtgttttgccggccacaccgacgtggtgcctaccggcccggtccagcaatggcagcatgaacccttcgaggcactgatCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCa > 8:199551‑M1/108‑146 (MQ=255) tcgCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTc > 8:339968/1‑149 (MQ=255) cTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGaa < 8:72236/149‑1 (MQ=255) cTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGaa < 1:24151/149‑1 (MQ=255) ggTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAgg > 4:278939/1‑149 (MQ=255) tGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGt < 5:219018/149‑1 (MQ=255) gATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGtt > 5:84473/1‑149 (MQ=255) gATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGt > 4:294553/1‑148 (MQ=255) aTCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTc < 2:50287/149‑1 (MQ=255) aTCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTc < 5:127202/149‑1 (MQ=255) aGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCAt < 7:118043/148‑1 (MQ=255) aGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGACAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCAtg > 3:231634/1‑149 (MQ=255) gAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATAAGTGCCTCGAAGGGTTCAtgc > 7:299277/1‑149 (MQ=255) aaaCGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCAtgct > 2:166153/1‑149 (MQ=255) aaaCGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCAtgct > 4:182702/1‑149 (MQ=255) aaaCGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCATGCACGAAGAGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGAA‑ACGGCC‑GCAGAGCATCCCGTCGGCGTCGATCAGTGCATCGAAGCGTTCAtgct > 3:133963/1‑149 (MQ=255) aaCGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCAtgctg < 3:47070/149‑1 (MQ=255) cgACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCAt < 2:250889/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCt < 1:166153/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCt < 3:278939/149‑1 (MQ=255) gcgcgG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGa < 7:79118/147‑1 (MQ=255) gg‑tggtTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCggg < 8:299277/149‑1 (MQ=255) cGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTa < 2:161145/148‑1 (MQ=255) gggTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAgg < 2:164316/149‑1 (MQ=255) cACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCgg > 4:143529/1‑149 (MQ=255) aCGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGgt < 3:143529/149‑1 (MQ=255) cGAAGCGCTCGCTGGCGATTACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGgtg < 3:294553/149‑1 (MQ=255) cGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTTCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGgtg > 4:287576/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGgtgt > 7:219723/1‑149 (MQ=255) aGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGTCCTTCATGTGGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCAGTCTGCGTATATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCTATTGCTGGACCGGTCCGGTAGGCACCACGTCtgtgtg < 4:133963/148‑1 (MQ=255) ctcgctGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCgg > 6:3860/1‑149 (MQ=255) gCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAaca < 6:124259/149‑1 (MQ=255) cGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCGTGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAaca > 1:215066/1‑148 (MQ=255) cGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAacac < 5:3860/149‑1 (MQ=255) gATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAAcaca < 6:84473/149‑1 (MQ=255) agcaatggcagcatgaacccttcgaggcactgatCGACGCCGACGGCATGCTCTGCG‑GCCGT‑GGCGCCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAg < 7:117660‑M1/115‑1 (MQ=255) aCCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTAc < 3:182702/149‑1 (MQ=255) cATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTACCg > 5:218168/1‑149 (MQ=255) aTGGATGCGAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTACCgg < 3:287576/149‑1 (MQ=255) ggATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTACCGGGc > 5:288050/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTACCGGGCCGTcc < 7:339968/149‑1 (MQ=255) gCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTACCGGGCCGTCCTGGCTGc < 3:354987/149‑1 (MQ=255) cccTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTACCGGGCCGTCCTGGCTGcc > 2:264887/1‑149 (MQ=255) cTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTACCGGGCCGTCCTGGCTGCCgt > 6:178573/1‑149 (MQ=255) | TCGACCACCGCTTTGGTGCCGTGGTGGGCGGGGCCTTCCTCGTCGCTGGTGATCAGAAACGCGACCTTGCCGCGG‑TGGTTCGGGTAGTCCTGCACGAAGCGCTCGCTGGCGATGACCATGGATGCCAGGCTGCCCTTCATGTCGGCGGCGCC‑ACGGCC‑GCAGAGCATGCCGTCGGCGTCGATCAGTGCCTCGAAGGGTTCATGCTGCCATTGCTGGACCGGGCCGGTAGGCACCACGTCGGTGTGGCCGGCAAAACACAGTACCGGGCCGTCCTGGCTGCCGT > NC_002947/1730627‑1730909 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |