New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1816461 = | 42 (0.710) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 6.8% | coding (333/750 nt) | surE | 5'‑nucleotidase SurE |
? | NC_002947 | 1816538 = | 42 (0.750) | coding (410/750 nt) | surE | 5'‑nucleotidase SurE |
CTCAACGGCACGCCGACCGACTGCGTGCACCTGGGGCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTCGCGTCTGGTGTTGCCGCCACGCACCGTACTCAACGTCAA > NC_002947/1816315‑1816607 | gcgccgccgcccgcgcccggtgaccgagacgggtgagctggatgccacggatgtgctccagcggcaagttgggaatattgacgttgagtacggtgcgtggcggcaacaccagacgcgactgtgcttcgaccagacgacgggcgatatAg > 5:65855‑M1/148‑149 (MQ=255) tCAACGGCACGCCGACCGACTGCGTGCACCTGGGGCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGc > 8:107144/1‑149 (MQ=255) tCAACGGCACGCCGACCGACTGCGTGCACCTGGGGCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGc > 6:54029/1‑149 (MQ=255) tCAACGGCACGCCGACCGACTGCGTGCACCTGGGGCTCAATGGGCTCTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGc > 8:36610/1‑149 (MQ=255) aaCGGCACGCCGACCGACTGCGTGCACCTGGGGCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGc < 5:137746/147‑1 (MQ=255) aaCGGCACGCCGACCGACTGCGTGCACCTGGGGCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCg > 7:85165/1‑149 (MQ=255) cACGCCGACCGACTGCGTGCACCTGGGGCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCCGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTcc < 3:31342/149‑1 (MQ=255) gacTGCGTGCACCTGGGGCTCAATGGGCTGTTGCTCGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGAGCTGGAAGGCCGCTTCCTCTGCGGTa > 1:236487/1‑149 (MQ=255) aCCTGGGGCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCg > 6:29606/1‑149 (MQ=255) cTGGGGCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGtt > 4:37023/1‑149 (MQ=255) ggCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCg > 4:337637/1‑149 (MQ=255) ctggatgccacggatgtgctccagcggcaagttgggaatattgacgttgagtacggtgcgtggcggcaacaccagacgcgactgtgcttcgaccagacgacgggcgatatAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCt < 3:326580‑M1/39‑1 (MQ=255) aaTGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCtgtt < 5:54029/149‑1 (MQ=255) aaTGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCtg < 7:252265/147‑1 (MQ=255) aaTCGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCtgtt > 4:167529/1‑149 (MQ=255) gCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTcgc > 5:257493/1‑149 (MQ=255) gCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTcgc < 4:86068/149‑1 (MQ=255) gC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTcg < 7:191965/142‑1 (MQ=255) gC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTcg > 8:191965/1‑142 (MQ=255) c‑cGCAGATTCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGAAGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCTGAACCTCGCTGGCGTGCGCGCtgtt > 8:267931/1‑137 (MQ=255) c‑cGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGc > 2:338138/1‑121 (MQ=255) c‑cGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCtgtt < 7:267931/137‑1 (MQ=255) c‑cGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGcc > 8:223605/1‑149 (MQ=255) cGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCg < 7:223605/149‑1 (MQ=255) cGCAGAGGCCGGACATGCTCGTGGCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCg < 6:257493/149‑1 (MQ=255) gATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGAc > 2:64063/1‑148 (MQ=255) aTGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACaa > 6:174879/1‑149 (MQ=255) cGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTg < 1:64063/149‑1 (MQ=255) cGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTg > 2:74415/1‑149 (MQ=255) gACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGcc < 7:303840/149‑1 (MQ=255) gTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGc > 6:241530/1‑149 (MQ=255) tattgacgttgagtacggtgcgtggcggcaacaccagacgcgactgtgcttcgaccagacgacgggcgatatAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCt > 1:218944‑M1/73‑149 (MQ=255) tCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGTCGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCt < 8:192521/148‑1 (MQ=255) tCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGcc > 5:18502/1‑137 (MQ=255) tCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGcc < 6:18502/137‑1 (MQ=255) ggggATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCtat < 3:37023/148‑1 (MQ=255) ggggATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTAATCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCtata < 3:167529/149‑1 (MQ=255) gacgttgagtacggtgcgtggcggcaacaccagacgcgactgtgcttcgaccagacgacgggcgatatAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCtata > 4:326580‑M1/69‑148 (MQ=255) ggTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCcgtcgt < 1:74415/147‑1 (MQ=255) ggTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCgtcgtc < 3:337637/148‑1 (MQ=255) gTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTg < 5:29606/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCg > 8:169490/1‑147 (MQ=255) aCCTGGGAGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTTCGGCTCTGGAAGGCCTCTTCCTCGGCGGTCCCTCACTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCTCATGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGaa < 2:236487/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGc < 3:314176/149‑1 (MQ=255) tGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTcgc > 4:209431/1‑149 (MQ=255) gACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTcgcg > 4:321579/1‑149 (MQ=255) tATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTCGCGTCTGGTGtt < 7:107144/149‑1 (MQ=255) ttCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCGGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTCGCGTCTGGTGTTgc > 8:330714/1‑149 (MQ=255) gggAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTCGCGTCTGGTGTTgccgc > 1:80961/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTCGCGTCTGGTGTTGCCGCCACGCAc < 2:80961/149‑1 (MQ=255) tGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTCGCGTCTGGTGTTGCCGCCACGCACCGTACTCAAcct > 1:254110/1‑146 (MQ=255) ggAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTCGCGTCTGGTGTTGCCGCCACGCACCGTACTCAACGTc > 6:252848/1‑148 (MQ=255) gAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTcgc > 4:167932/1‑112 (MQ=255) gAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTcgc < 3:167932/112‑1 (MQ=255) gAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTCGCGTCTGGTGTTGCCGCCACGCACCGTACTCAACGTCaa > 5:161675/1‑149 (MQ=255) | CTCAACGGCACGCCGACCGACTGCGTGCACCTGGGGCTCAATGGGCTGTTGC‑CGCAGATGCCGGACATGGTCGTGTCGGGGATCAACCTCGGTGCCAACCTGGGCGATGACGTGCTGTATTCGGGAACGGTCGCTGCGGCGCTGGAAGGCCGCTTCCTCGGCGGTACCTCGCTGGCGTTCTCGCTGTTGTCGCGCCAGCCGGACAACCTGCCGACTGCGGCCTATATCGCCCGTCGTCTGGTCGAAGCACAGTCGCGTCTGGTGTTGCCGCCACGCACCGTACTCAACGTCAA > NC_002947/1816315‑1816607 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |