New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2098428 | 56 (0.950) | 3 (0.060) | 3/234 | NT | 5.7% | coding (1462/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | = 2098449 | 50 (0.950) | coding (1441/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
GGCGCTGGCGGGATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACG > NC_002947/2098283‑2098570 | ggCGCTGGCGGGATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAc‑c < 3:210459/149‑1 (MQ=255) gggATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCGTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCg > 3:169739/1‑149 (MQ=255) ggATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCgg < 2:217347/149‑1 (MQ=255) gCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGAt > 3:6186/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGc > 6:43396/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCAGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGc > 1:61716/1‑149 (MQ=255) cGGTGTGCACGGTCAGCGGAAATTCGGCTGTAAAAGAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGACTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGc < 4:216142/147‑1 (MQ=255) cGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcc < 1:200540‑M2/149‑11 (MQ=255) ggTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccggcct < 3:18263‑M1/149‑33 (MQ=255) gTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctg > 5:43396‑M2/1‑137 (MQ=255) tCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccgacctgg > 3:354022‑M2/1‑136 (MQ=255) aGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctggg > 1:165381‑M2/1‑134 (MQ=255) aGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctggg > 5:76015‑M2/1‑134 (MQ=255) aGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGt > 6:335579/1‑149 (MQ=255) gCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGt > 5:293234/1‑148 (MQ=255) cggcggTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTg > 2:48544/1‑148 (MQ=255) ggcggTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGc > 5:275641/1‑145 (MQ=255) ggcggTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGc < 6:275641/145‑1 (MQ=255) ggTAAAGCAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccgg > 2:173417‑M1/1‑99 (MQ=255) ggTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccgg < 1:173417‑M1/128‑30 (MQ=255) ggTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAg < 3:303238/139‑1 (MQ=255) ggTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGa < 7:117600/149‑1 (MQ=255) ggaacaCAGCGGCCAACGCCCGGCTCGGAGCGACTGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCGTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGAt < 8:252963/144‑1 (MQ=255) tAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATg < 8:112935/149‑1 (MQ=255) cAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATgcgcgc < 6:363721/149‑1 (MQ=255) cAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATgcgcgc > 5:363721/1‑149 (MQ=255) aGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGcc > 7:277805/1‑149 (MQ=255) cTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTg < 6:293234/149‑1 (MQ=255) ccAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGc > 3:13869/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGt > 5:200588/1‑149 (MQ=255) cGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCGTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCgg < 4:169739/149‑1 (MQ=255) cGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTTCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCgg < 8:312532/149‑1 (MQ=255) cGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCgg < 3:346688/149‑1 (MQ=255) tCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATCGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGCCGGCTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgat > 6:282664/1‑149 (MQ=255) ggAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgc < 1:48544/149‑1 (MQ=255) ggAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgc < 1:14006/149‑1 (MQ=255) gCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgccga > 3:299286/1‑149 (MQ=255) aaTGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgccgatgc < 2:61716/149‑1 (MQ=255) aTGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgccgatgcc > 4:58783/1‑149 (MQ=255) tgtgCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGatgccgatgccg < 4:13869/149‑1 (MQ=255) tgtgCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGatgccgatgccg < 4:305532/149‑1 (MQ=255) cAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTa < 1:163297/148‑1 (MQ=255) gTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATccc > 4:312502/1‑149 (MQ=255) gTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATccc < 3:312502/149‑1 (MQ=255) cccTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTAc > 8:132878/1‑149 (MQ=255) cATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGc < 4:318367/111‑1 (MQ=255) cATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGc > 3:318367/1‑111 (MQ=255) tGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGa < 5:202367/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACGCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATccc > 1:82396/1‑138 (MQ=255) ggCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATccc < 2:82396/137‑1 (MQ=255) gCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGAc < 4:299286/148‑1 (MQ=255) aGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACaccacc < 6:200588/149‑1 (MQ=255) gTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTc > 8:125904/1‑132 (MQ=255) gTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTc < 7:125904/132‑1 (MQ=255) gTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGa > 7:298507/1‑149 (MQ=255) cgcgTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAAt < 2:200540/149‑1 (MQ=255) gTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgc > 5:203622/1‑149 (MQ=255) gTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgc > 1:43767/1‑149 (MQ=255) aaaGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgccgc > 3:45266/1‑149 (MQ=255) ccaggcccaggaCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGAGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCAGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAg > 4:95607/1‑149 (MQ=255) cccaggccGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgccgct > 5:76015‑M1/1‑14 (MQ=255) cccaggccGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgccgct > 1:165381‑M1/1‑14 (MQ=255) ccaggtcGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgccgctga > 3:354022‑M1/1‑13 (MQ=255) ccaggccGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACg > 6:100829/1‑149 (MQ=255) ccaggccGGTGCCAC‑CGTACTCGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGTGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACg > 6:100826/1‑149 (MQ=255) caggccGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgccgctgac > 5:43396‑M1/1‑12 (MQ=255) caggccGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGt > 5:32963/1‑149 (MQ=255) aggccGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgccgctgacc < 3:18263‑M2/149‑118 (MQ=255) aggccGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTc > 8:261636/1‑149 (MQ=255) ggccGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgccgctgaccg < 1:200540‑M1/149‑140 (MQ=255) ccGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttacc < 1:173417‑M2/128‑100 (MQ=255) ccGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgctttacc > 2:173417‑M2/1‑29 (MQ=255) cGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGAcg > 8:69868/1‑149 (MQ=255) | GGCGCTGGCGGGATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCAC‑CGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACG > NC_002947/2098283‑2098570 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |