| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2132999 = | 60 (1.020) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.8% | coding (13/780 nt) | PP_1890 | type I pili chaperone protein FimC |
| ? | NC_002947 | 2133027 = | 53 (0.950) | intergenic (‑16/+38) | PP_1890/fimI | type I pili chaperone protein FimC/type I pili subunit FimI | |||||
CGTTGAAAACGAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGAACGGTAGTAGGC > NC_002947/2132852‑2133145 | gacaggcccaaccgacctccggttcgacgcctactaccgttccactgccagcaccgtgacgcacggccttgcatccgcccaggttcgttacaccgtcgactatcaataattacgcataaattctgtgcagtccttgcacggttaaacc < 7:258575‑M1/1‑1 (MQ=255) acaggcccaaccgacctccggttcgacgcctactaccgttccactgccagcaccgtgacgcacggccttgcatccgcccaggttcgttacaccgtcgactatcaataattacgcataaattctgtgcagtccttgcacggttaaacCAt > 2:235524‑M1/147‑149 (MQ=255) acaggcccaaccgacctccggttcgacgcctactaccgttccactgccagcaccgtgacgcacggccttgcatccgcccaggttcgttacaccgtcgactatcaataattacgcataaattctgtgcagtccttgcacggttaaacCAt < 7:153612‑M1/3‑1 (MQ=255) ttGAAAACGAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATc < 5:288450/149‑1 (MQ=255) ttGAAAACGAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATc > 7:16654/1‑149 (MQ=255) aggcccaaccgacctccggttcgacgcctactaccgttccactgccagcaccgtgacgcacggccttgcatccgcccaggttcgttacaccgtcgactatcaataattacgcataaattctgtgcagtccttgcacggttaaacCATcc > 8:165803‑M1/145‑149 (MQ=255) gAAAACGAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATc > 5:129930/1‑147 (MQ=255) gAAAACGAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATc > 3:162472/1‑147 (MQ=255) aaaCGAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGa < 4:324146/149‑1 (MQ=255) aaCGAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGAc > 6:95276/1‑149 (MQ=255) aCGAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACg > 1:37667/1‑149 (MQ=255) gAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTAACGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGTTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGca > 6:213356/1‑149 (MQ=255) gcgcGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACaa < 6:124440/149‑1 (MQ=255) gcgTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACt < 2:37667/149‑1 (MQ=255) cgTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTa < 4:162472/149‑1 (MQ=255) cgTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTa < 6:129930/149‑1 (MQ=255) gtgtAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACGGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGAGGAAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGATGAGGGATTGGTCATGGGGTTACTGGCTGCTTCCAGACGCACCAGTACGCCTg > 8:330003/4‑149 (MQ=255) tttAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCGTg > 3:225822/1‑148 (MQ=255) tAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGAt > 5:142325/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGtt < 8:16654/148‑1 (MQ=255) aaGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTaa > 3:158162/1‑149 (MQ=255) ggcggcATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAAcc < 6:142325/149‑1 (MQ=255) tGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTTGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCTGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAg < 1:342673/149‑1 (MQ=255) tGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGttt > 3:247132/1‑134 (MQ=255) tGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGttt < 4:247132/134‑1 (MQ=255) tGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACt > 5:239876/1‑149 (MQ=255) gTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTg > 3:153210/1‑149 (MQ=255) gggTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTa > 7:249673/1‑149 (MQ=255) ggTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTAt < 5:39912/149‑1 (MQ=255) ggTAAGCATCAATAAGGTCAGCCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTAt < 5:95276/149‑1 (MQ=255) gTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATg > 3:75247/1‑149 (MQ=255) gCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGt > 3:55340/1‑148 (MQ=255) gCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGt > 3:2010/1‑148 (MQ=255) aTCAATAAGGTCAGTCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGca < 2:252372/94‑1 (MQ=255) aTCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGca > 1:252372/1‑94 (MQ=255) aTCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAat > 2:47829/1‑149 (MQ=255) aTAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTCAATGTTGACCGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTAAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAattatt > 1:363596/1‑149 (MQ=255) tAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCaa > 8:245802/1‑119 (MQ=255) aGGTCAGGCAGACGCAATCAACGACGCGGGCGTGTATCGTGAATGTTGACTGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCCTCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGa < 2:363596/148‑1 (MQ=255) aGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGa < 4:2010/148‑1 (MQ=255) ggCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGa > 3:242519/1‑149 (MQ=255) gACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGTCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACg < 2:104608/147‑1 (MQ=255) gACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGgt < 4:158162/149‑1 (MQ=255) gACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGACTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACg > 1:104608/1‑147 (MQ=255) aaaCAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAAc > 2:141171/1‑149 (MQ=255) caacGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGaa < 4:153210/149‑1 (MQ=255) cgtcgactatcaataattacgcataaattctgtgcagtccttgcacggttaaacCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGt < 8:200972‑M1/38‑1 (MQ=255) cgtcgactatcaataattacgcataaattctgtgcagtccttgcacggttaaacCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGt > 7:200972‑M1/55‑92 (MQ=255) gcggtctgGTATCGTGAATGTTGACGGATTTGTCCTCGGTTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGAAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGc < 5:213356/149‑1 (MQ=255) gcgggTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGAt < 4:75247/149‑1 (MQ=255) gTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCaa < 6:239876/149‑1 (MQ=255) tATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTggg < 8:290870/139‑1 (MQ=255) tATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTggg > 7:290870/1‑139 (MQ=255) gTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCg > 8:153612/1‑149 (MQ=255) tGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGTCGGATGCAAGGCCGt > 7:21920/1‑149 (MQ=255) aTGTTGACGGATTGGTCATCGGGAAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGc < 4:291755/148‑1 (MQ=255) ataaattctgtgcagtccttgcacggttaaacCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATg < 6:17613‑M1/28‑1 (MQ=255) ataaattctgtgcagtccttgcacggttaaacCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATg > 5:17613‑M1/33‑60 (MQ=255) aCGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACg < 4:55340/148‑1 (MQ=255) aTTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAattat > 7:57214/1‑93 (MQ=255) aTTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAattat < 8:57214/93‑1 (MQ=255) gTCACCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTgg > 8:258575/1‑147 (MQ=255) tCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAg > 5:2228/1‑149 (MQ=255) gggTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTACTTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGa < 3:79361/148‑1 (MQ=255) gggTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCaa > 6:185003/1‑120 (MQ=255) ggTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAAc < 6:297914/105‑1 (MQ=255) ggTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAAc > 5:297914/1‑105 (MQ=255) ggTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGAAc > 5:223947/1‑149 (MQ=255) aCTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGAACGgta < 4:242519/149‑1 (MQ=255) cctatctCATCGAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGCCTGCACAGAATTTATGCGTATTTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGAACGgta > 7:60373‑M1/8‑148 (MQ=255) tCGCTGCATCCAGACGCACCACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCt > 7:308725/1‑101 (MQ=255) tCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCt < 8:308725/101‑1 (MQ=255) tCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGAACGgtag > 6:286511/1‑148 (MQ=255) gCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGAACGGtagtag > 8:326984/1‑149 (MQ=255) gCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAAACTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGAACGGtagtag > 3:68250/1‑149 (MQ=255) tGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGAACGGTAGTAGGc > 8:17460/1‑149 (MQ=255) | CGTTGAAAACGAGGCGCGTGTTGTTTAATGTCAAGGCGGCATGACTGTTTACCGAGAGGGTAAGCATCAATAAGGTCAGGCAGACGCAAACAACGACGCGGGCGGGTATCGTGAATGTTGACGGATTGGTCATCGGGTAACTCGCTGCATCCAGACGCACAACTACGCCTGGATGGTTTAACCGTGCAAGGACTGCACAGAATTTATGCGTAATTATTGATAGTCGACGGTGTAACGAACCTGGGCGGATGCAAGGCCGTGCGTCACGGTGCTGGCAGTGGAACGGTAGTAGGC > NC_002947/2132852‑2133145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |