New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2430851 = | 52 (0.880) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.8% | coding (1106/1974 nt) | PP_2130 | lytic transglycosylase |
? | NC_002947 | 2430901 = | 47 (0.840) | coding (1056/1974 nt) | PP_2130 | lytic transglycosylase |
TTCTTGACCAGTTGTGGGCTCAGCAGCAGCGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCATTCGCTGACGGTGTTGTCG > NC_002947/2430704‑2430997 | ctacgacccacgcgcgctcgacctgatgacccgctatgacccccagctgcgcgacaacaccgtcagcgaatggcgccttcgcctgctgctgcgcctgggccgctgggaggacgcctacgagttgaccaagcgccttccccaggacctgg > 2:223372‑M1/149‑149 (MQ=255) tcttGACCAGTTGTGGGCTCAGCAGCAGCGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGc > 4:157093/1‑148 (MQ=255) gacccacgcgcgcgcgccctgacgacccgctatgacccccagccgcgcgacaacaccgtcagcgaatggcgccttcgcctgctgctgcgcctgggccgctgggagcacgcctacgagttcaccaagcgcccttccccaggacctgGCCa > 4:312676‑M1/146‑149 (MQ=255) gACCAGTTGTGGGCTCAGCAGCAGCGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAg > 8:309258/1‑147 (MQ=255) gACCAGTTGTGGGCTCAGCAGCAGCGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAg < 7:309258/147‑1 (MQ=255) cAGTTGTGGGCTCAGCAGCAGCGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCa < 2:55766/149‑1 (MQ=255) ttGTGGGCTCTGCAGCAGCGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGTCGGAGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCGT‑TGTAAAGAAGCGGTACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAgg < 4:74524/148‑1 (MQ=255) gtgGGCTCAGCAGCAGCGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTg > 8:252928/1‑149 (MQ=255) tgGGATCAGCAGCAGCGTCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGACCGGTCGGCGGCGAGGAAGACATATAAGTCACGATCAAGCTCTGCGGCCT‑TGTAAAGAATCTGGACCTGAGGGTTGTTTGTCTGTGCAAGCTCCAggat > 4:273579/1‑145 (MQ=255) gcagcagcGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGc < 5:129108/149‑1 (MQ=255) gcagcagcGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGc < 7:252928/149‑1 (MQ=255) cagcGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAg > 3:72056/1‑148 (MQ=255) gCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTc > 4:268824/1‑149 (MQ=255) ttgttgTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTc > 3:131419/1‑147 (MQ=255) ttCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCt > 1:331396/1‑149 (MQ=255) aGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGt > 1:160910/1‑149 (MQ=255) tGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCt > 4:13878/1‑149 (MQ=255) gTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTg < 4:131419/148‑1 (MQ=255) gcgacaacaccgtcagcgaatggcgccttcgcctgctgctgcgcctgggccgctgggaggacgcctacgagttgaccaagcgccttccccaggacctgGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGcc > 1:58043‑M1/99‑149 (MQ=255) gcgacaacaccgtcagcgaatggcgccttcgcctgctgctgcgcctgggccgctgggaggacgcctacgagttgaccaagcgccttccccaggacctgGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGc < 2:58043‑M1/50‑1 (MQ=255) cGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGCAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGc > 1:204241/1‑147 (MQ=255) cGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGcc < 5:70295/148‑1 (MQ=255) cGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGc > 1:209965/1‑147 (MQ=255) gtgtCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAgg > 6:277100/1‑149 (MQ=255) tgtCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGcc > 7:205949/1‑145 (MQ=255) tgtCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGcc < 8:205949/145‑1 (MQ=255) tgCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTggg < 3:13878/149‑1 (MQ=255) tgCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTgg < 4:72056/148‑1 (MQ=255) tgCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTg < 4:302810/147‑1 (MQ=255) tgCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTg < 2:331396/147‑1 (MQ=255) cccGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTgggg > 6:74096/1‑148 (MQ=255) ggTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAgg < 3:157093/149‑1 (MQ=255) ggcggcGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCt > 7:344017/1‑149 (MQ=255) gAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACt > 3:113279/1‑149 (MQ=255) gAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACt > 3:22842/1‑149 (MQ=255) cATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAg < 5:277100/149‑1 (MQ=255) aTAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAgg > 3:305596/1‑149 (MQ=255) tAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCTGTGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAgg > 1:22054/1‑149 (MQ=255) tAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGc > 2:64484/1‑149 (MQ=255) aaGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAATAATCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGtc < 8:309527/149‑1 (MQ=255) ctgcgcctgggccgctgggaggacgcctacgagttgaccaagcgccttccccaggacctgGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTg < 4:44027‑M1/48‑1 (MQ=255) tcacgcGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCg > 5:97504/1‑149 (MQ=255) tGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGgc > 5:52971/1‑149 (MQ=255) cgtccT‑TGTAAAGAAGCGTGACCTGCGGTTTGTTTGGCTTTGCCAGCTCAAGGATGCGAGACTGCAAGTACTTCCAGCTTCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCTTAGGCTTCCTCCCAGCGGCCCAGgcgc < 3:273579/146‑1 (MQ=255) ggCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCgca < 8:344017/149‑1 (MQ=255) t‑tGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCgcagcag > 6:127780/1‑149 (MQ=255) gTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAAc < 5:378039/112‑1 (MQ=255) gTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAAc > 6:378039/1‑112 (MQ=255) aagaagCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAgg < 2:22054/148‑1 (MQ=255) aagCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCg > 3:156959/1‑147 (MQ=255) agCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAg > 5:271022/1‑149 (MQ=255) agCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAg < 3:268824/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCAt < 4:113279/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCAt < 4:22842/149‑1 (MQ=255) ggTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCAAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCATTCGCTg > 3:20514/1‑149 (MQ=255) gttgttTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCATTCGCTGa < 6:271022/149‑1 (MQ=255) ttgttTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCATTCGCTGAc > 6:13582/1‑149 (MQ=255) ttGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCATTCg > 6:87092/1‑140 (MQ=255) ttGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCATTCg < 5:87092/140‑1 (MQ=255) tGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCATTCGCTGACGgtgt > 5:337711/1‑149 (MQ=255) gtgCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGCAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCATTCGCTGACGGTGTTGTcg > 3:134949/1‑149 (MQ=255) GCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAgg < 6:107632‑M1/123‑1 (MQ=255) GCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAgg > 5:107632‑M1/1‑123 (MQ=255) | TTCTTGACCAGTTGTGGGCTCAGCAGCAGCGGCTTGTTGTTCAGCTGGTACGGTGTCTGTGCCCGGTCGGCGGCGAGGAAGCCATAGAAGTCACGCTCACGCGCTGCGGCCT‑TGTAAAGAAGCGGGACCTGCGGGTTGTTTGGCTGTGCCAGCTCCAGGCTGCGAGCCTGCCAGTACTTCCAGCGGCTGGTGCTGGCCAGGTCCTGGGGAAGGCGCTTGGTCAACTCGTAGGCGTCCTCCCAGCGGCCCAGGCGCAGCAGCAGGCGAAGGCGCCATTCGCTGACGGTGTTGTCG > NC_002947/2430704‑2430997 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |